Идентификация и структурно-функциональная характеристика генов мобилизации плазмиды pAH 36-4CPA Ситдикова, Лейсан Радисовна

brief description

Ситдикова,ЛейсанРадисовна.Идентификацияиструктурно-функциональнаяхарактеристикагеновмобилизацииплазмидыpAH36-4CPA: диссертация ... кандидата биологических наук : 03.00.03. - Уфа, 2006. - 111 с. : ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
61:07-3/457 РОССРВДСКАЯ АКАДЕМИЯ НАУК УФИМСКИЙ ИАУЧИЫЙ ЦЕНТР ИНСТИТУТ БИОЛОГРШ На правах рукописи 579.841:579.222.3СитдиковаЛейсанРадисовнаИДЕНТИФИКАЦИЯИ СТРУКТУРИО-ФУНКЦИОНАЛЬНАЯХАРАКТЕРИСТИКАГЕНОВМОБИЛИЗАЦИИНЛАЗМИДЫ рАН 36-4СРА 03.00.03. МОЛЕКУЛЯРНАЯ БИОЛОГИЯ диссертация на соискание ученой

стр. 5
генного пула мобилизируемых нлазмид. Цель и задачи исследования. Целью настояш;ей работы являласьидентификацияихарактеристикагеновсистемымобилизацииплазмидырАН 36-4СРА штамма Citrobacter hydrophyla IBRB-36 4СРА. Задачи исследования: 1. провести рестрикционный анализплазмидырАН 36-4СРА штамма Citrobacter hydrophyla IBRB-36 4СРА; 2. определить последовательность нуклеотидов фрагментов нлазмиды рАН 36-4СРА; 3. идентифицироватьгены...

Оглавление диссертациикандидат биологических наук Ситдикова, Лейсан Радисовна
ВВЕДЕНИЕ
ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
Плазмиды и механизмы переноса генетической информации у 8 бактерий
1.1. Конъюгация
1.1.1. Конъюгативные плазмиды
1.1.2. Генетическая организация факторов переноса
1.2. Мобилизация 10 1.2.1. Характеристика белков мобилизации
1.3. Главные семейства малых мобилизируемых плазмид
1.3.1. MOBq семейство
1.3.2. ColEl-семейство 24 1.3.2.1. MOBhen подсемейство 30 1.3.2.1. МОВр подсемейство
1.3.3. рМУ158-семейство
1.3.4. CloDF13 семейство
ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЙ
2.1. Объекты исследований
2.2. Выделение плазмидной ДНК
2.3. Очистка плазмидной ДНК в легкоплавкой агарозе
2.4. Клонирование плазмидной ДНК
2.4.1. Приготовление компетентных клеток
2.4.2. Приготовление векторов
2.4.3. Лигирование
2.4.4. Трансформация клеток плазмидной ДНК
2.5. Выделение плазмидной ДНК клонов
2.6. Рестрикционный анализ плазмидной ДНК
2.7. Секвенирование плазмид со вставкой
2.7.1. Введение метки в праймер
2.7.2. Постановка реакции секвенирования
2.8. Определение устойчивости штамма к антибиотикам
2.9. Определение устойчивости штамма к тяжелым металлам
2.10. Конъюгация клеток бактерий
ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ
3.1. Рестрикционный анализ плазмиды рАН 36 4СРА штамма Citrobacter hydrophila IBRB-36 4СРА
3.2. Создание геномных библиотек перекрывающихся рестрикционных фрагментов плазмиды рАН 36-4СРА
3.2.1. Rsa I библиотека клонов
3.2.2. Kzo9l - библиотека клонов 62 3.2.2. Alul- библиотека клонов
3.3. Определение последовательности нуклеотидов фрагментов 68 плазмиды рАН 36 4СРА
3.3.1. Секвенирование библиотеки клонов Rsa I - Kzo9I - Alul - 68 фрагментов рАН364СРА
3.3.2. Секвенирование плазмиды рАНЗб 4СРА методом «праймерной прогулки»
3.4. Сравнительный анализ фрагмента плазмиды рАН 36-4СРА в формате базы данных GenBank
3.5. Филогенетическое положение генов mob плазмиды рАН 36-4СРА штамма Citrobacter hydrophila
3.6. Сравнительный анализ кластера mob генов плазмиды рАН 36-4СРА
3.6.1. Сравнительный анализ последовательности нуклеотидов mob А 77 плазмиды рАН 36-4СРА
3.6.2. Сравнительный анализ последовательности нуклеотидов тоЬВ 80 плазмиды рАН 36-4СРА
3.6.3. Сравнительный анализ последовательности нуклеотидов тоЬС 82 плазмиды рАН 36-4СРА
3.6.4. Сравнительный анализ последовательности нуклеотидов mobD 84 плазмиды рАН 36-4СРА
3.7. Исследование процесса трансфера плазмиды рАН 36-4СРА
С. hydrophila IBRB-36 4СРА
ВЫВОДЫ