Исследование зараженности членистоногих переносчиков дельты Волги и Волго-Ахтубинской поймы вирусом Западного Нила и молекулярно-генетическая характеристика штаммов LEIV-Ast00-986-human и LEIV-Vlg99-27889-human ВЗН Воронина, Анна Георгиевна

brief description

Воронина,АннаГеоргиевна.ИсследованиезараженностичленистоногихпереносчиковдельтыВолгииВолго-АхтубинскойпоймывирусомЗападногоНилаимолекулярно-генетическаяхарактеристикаштаммовLEIV-Ast00-986-humanиLEIV-Vlg99-27889-humanВЗН: диссертация ... кандидата биологических наук : 03.00.03. - Москва, 2005. - 113 с. : ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
Q^: Oo-il^O-^^i РОССИЙСКАЯ АКАДЕМИЯ МЕДИЦИНСКИХ НАУК ИНСТИТУТ ВИРУСОЛОГИИ им. Д.И. ИВАНОВСКОГО На правах рукописиВОРОНИНААННАГЕОРГИЕВНАИССЛЕДОВАНИЕЗАРАЖЕННОСТИЧЛЕНИСТОНОГИХПЕРЕНОСЧИКОВДЕЛЬТЫВОЛГИИ ВОЛГОАХТУБИНСКОЙПОЙМЫВИРУСОМЗАПАДНОГОПИЛА ИМОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКАЯХАРАКТЕРИСТИКАШТАММОВLEIV-AstOO-986-humanИ...

стр. 71
последовательностей геномовштаммоввирусаЗНLEIV-AstOO986-humanиLEIV-VIg99-27889-human. Нами были определены полноразмерные нуклеотидные последовательностиштаммоввирусаЗНLEIV-Ast00-986-humanиLEIV-Vlg99-27889-human, выделенные во время эпидемических вспышек 1999г. и 2000г. в Волгоградской и Астраханской областях. Для проведения этихисследованийнеобходимым условием явился подбор...

стр. 98
напряженности природных очагов вирусаЗападногоНилавдельтеВолгииВолго-Ахтубинскойпойме. 4. На основании определения первичной структуры участков генома вирусаЗападногоНила( 5'-НТР -core) в 86 образцахВЗН, установлено, что вдельтеВолгииВолго-Ахтубинскойпоймециркулируют вирусы ЗН, относящиеся к I, II и IV генотипу. Показано, что наибольшее распространение имеют...

Оглавление диссертациикандидат биологических наук Воронина, Анна Георгиевна
ВВЕДЕНИЕ.
Глава 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.
1.1 Общая характеристика флавивирусов.
1.1.1 Общий план строения и трансляции генома флавивирусов.
1.1.1.2 Структура генома.
1.1.1.3 Репликация РНК.
1.1.1.4 Трансляция и процессинг.
1.1.1.5 Стратегия вирусного генома.
1.1.2 Белки флавивирусов и их функции.
1.1.2.1 Структурные белки флавивирусов.
1.1.2.2 Неструктурные белки флавивирусов.
1.2 Филогения различных изолятов вируса
Западного Нила.
1.3 Исследования ВЗН, проведенные в лаборатории Молекулярной генетики института Вирусологии РАМН.
1.4 Этиология и эпидемиология.
1.5 Клиника заболевания.
1.6 Резервуар вируса среди позвоночных.
1.7 Переносчики вирусной инфекции.
1.8 Сохранение вирусной популяции в межэпизоотический период.
1.9 Ареал распространения заболевания за рубежом.
1.10 Ареал распространения заболевания в России и странах СНГ.
Глава 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ.
2.1 Место сбора и объем полевого материала.
2.2 Методы сбора, транспортировки, хранения и подготовки полевых материалов.
2.3 Методы молекулярно-биологических исследований.
2.3.1. Выделение тотальной РНК из осветленной клеточной или тканевой суспензии.
2.3.2 Реакция обратной транскрипции.
2.3.3 Проведение полимеразной цепной реакции.
2.3.4. Электрофорез ДНК.
2.3.5. Секвенирование ДНК.
2.4 Компьютерная обработка данных.
Глава 3. СОБСТВЕННЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ.
3.1.Определение полноразмерных нуклеотидных последовательностей геномов штаммов вируса ЗН LEIV-AstOO-986-human и LEIV-Vlg99-27889-human.
3.2. Создание ОТ-ПЦР тест системы для обнаружения РНК вируса JI3H в клинических образцах и пробах полевого материала
3.3 Определение специфичности и чувствительности ОТ-ПЦР тест - системы, лабораторная модификация системы.
3.4 Исследование комаров и клещей Астраханской области на наличие вируса ЗН при помощи ОТ-ПЦР системы.
3.4.1. Анализ зараженности видового состава комаров.
3.5. Нуклеотидный и филогенетический анализ 5'-концевой области генома вируса ЗН из полевых изолятов.
3.6. Обсуждение.
ВЫВОДЫ.
Благодарности.