Изучение двух групп уникальных - ΦKZ-подобных и Т7-подобных бактериофагов Pseudomonas aeruginosa Буркальцева, Мария Владленовна

brief description

Буркальцева,МарияВладленовна.Изучениедвухгруппуникальных-ΦKZ-подобныхиТ7-подобныхбактериофаговPseudomonasaeruginosa: диссертация ... кандидата биологических наук : 03.00.03. - Москва, 2005. - 116 с. : ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
Государственный научно-исследовательский институт генетики и селекции промышленных микроорганизмов Буркалыдева МарняВладленовна^о^^ИЗУЧЕНИЕДВУХГРУППУНИКАЛЬНЫХ- фKZ•' ''r'i.':.''--'•ПОДОБНЫХИ Т7-ПОДОБНЫХ-БАКТЕРИОФАГОВPSEUDOMONASAERUGINOSA03.00.03 - молекулярная биология Диссертация на соискание

стр. 2
ВВЕДЕНИЕ ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ 1. Pseiidomonasaeruginosaкак условный патоген 2. ЬСлассификациябактериофаговР.aeruginosa2.1. МорфологиябактериофаговР.aeruginosa2.2. Го.мология геномовбактериофаговР.aeruginosa3. Модульная теория и эволюциябактериофагов3.1. Модульная теория эволюции 3.2. Супергруппы

стр. 3
75 75 78 81 81 81 81 82 82 82 83 83 последователыюстн ДНК 2.3. (])КМУ-подобныебактериофаги2.3.1. Вьщеление новых фКМУ-подобныхбактериофагов2.3.2. Морфология фаговых частиц 2.3.3.Изучениегенома новых фКМУ-подобныхбактериофагов2.3.4. Спектр лнтической активности 2.3.5. Феномен взаимодействия фКМУ-подобпых

Оглавление диссертациикандидат биологических наук Буркальцева, Мария Владленовна
ВВЕДЕНИЕ.
ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.б
1. Pseudomonas aeruginosa как условный патоген.б
2. Классификация бактериофагов P. aeruginosa.
2.1. Морфология бактериофагов P. aeruginosa.
2.2. Гомология геномов бактериофагов P. aeruginosa.
3. Модульная теория и эволюция бактериофагов.
3.1. Модульная теория эволюции.
3.2. Супергруппы бактериофагов.
3.2.1. Фаги-трапспозоны.
3.2.2. Т4-подобные бактериофаги.
3.2.3. Т7-подобныс бактериофаги.
4. Фаготерапия.
4.1. Использование бактериофагов Р. aeruginosa в фаготерапии.
4.2. Проблемы использования живых вирулентных бактериофагов в фаготерапии.
4.2.1. Общая и специализированная траисдукция.
4.2.2. Фаговая конверсия.
4.2.3. Псевдолизогения.
5. Бактериофаг <}>KZ Р. aeruginosa.
5.1. Биологические свойства бактериофага <}>KZ.
5.2. Структура частицы бактериофага <}>KZ.
5.3. Геном фага <}>KZ.
5.3.1. Основные свойства и организация генома <}>KZ.
5.3.2. Предполагаемые промоторы и терминаторы.
5.3.3 Внрус-кодирусмые тРНК.
5.4. Предполагаемые генные продукты бактериофага <}>KZ.
5.4.1. Сходство генных продуктов фага <}>KZ с известными белками.
5.4.2. Интрон-кодируемые эндонуклеазы.
5.4.3. Генные продукты, вовлеченные в метаболизм иуклеотндов.
5.4.4. Репликация ДНК.
5.4.5. Белки фага <}>KZ, родственные белкам других бактериофагов.
5.4.6. Белки фаговой частицы <}>KZ.
5.5. Бактериофаги группы <J)KZ.
ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ
МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ.
РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ.
1. ФК^-ПОДОБ11ЫЕ БАКТЕРИОФАГИ.
1.1. Сравнение биологических свойств фагов.
1.1.1. Бактериофаги и их происхождение.
1.1.2. Выделение новых фК2-подобных бактериофагов.
1.1.3. Фенотип негативных колоний фагов.
1.1.4. Сравнение морфологии фаговых частиц.
1.1.5. Псевдолизогения.
1.1.6. Спектр литическои активности. 1.1.7. Способность к общей транедукции.
1.1.8. Инактивация сывороткой.
1.2. Сравнение геномов фК2-подобных фагов.
1.2.1. Сравнение размеров геномов.
1.2.2. Сравнение рестрикциопиых профилей ДНК.
1.2.3. Определение гомологии ДНК.
1.3. Сравнение полипептидного состава зрелых частиц.
1.4. Некоторые особенности предполагаемых генных продуктов фага <J>KZ.
1.5. Обсуждение.
1.5.1.Эволюция группы ф^-нодобиых бактериофагов.
1.5.2. Возможность использования фК2-подобных фагов в фаготерапии.
2. БАКТЕРИОФАГ фКМУ.
2.1. Биологические свойства фага фКМ V.
2.1.1. Выделение фага фКМУ и внешние признаки негативных колоний.
2.1.2. Морфология фаговых частиц.
2.1.3. Спектр литической активности.
2.1.4. Рост и развитие фага.
2.2. Изучение генома фага фКМУ.
92.2.1. Размер и GC-состав генома.
2.2.2. Рестрикционный анализ ДНК.
2.2.3. Характеристика генома фКМУ, полученная па основе анализа полной последовательности ДНК.
2.3. фКМУ-подобные бактериофаги.
2.3.1. Выделение новых фКМУ-подобных бактериофагов.
2.3.2. Морфология фаговых частиц. ш 2.3.3. Изучение генома новых фКМУ-подобных бактериофагов.
2.3.4. Спектр литической активности.
2.3.5. Феномен взаимодействия фКМУ-подобных и некоторых фК2-подобных фагов.
2.4. Обсуждение.
2.4.1. Эволюция фКМУ-подобных фагов.
2.4.2. Возможное практическое применение фагов вида фКМУ.
ВЫВОДЫ.