Изучение посттрансляционных модификаций вирусных белков с использованием масс-спектрометрических подходов Серебрякова, Марина Васильевна

brief description

Серебрякова, Марина Васильевна.
Изучение посттрансляционных модификаций вирусных белков с использованием масс-спектрометрических подходов : диссертация ... кандидата химических наук : 02.00.10. - Москва, 2005. - 99 с. : ил.
Оглавление диссертациикандидат химических наук Серебрякова, Марина Васильевна
1. ВВЕДЕНИЕ.
2. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.9
2.1 Использование масс-спектрометрии при изучении белков.
2.2 Основы MALDI-времяпролетной масс-спектрометрии белков и пептидов.
2.2.1 MALDI - получение газофазных ионов биополимеров.
2.2.2 Фрагментация пептидов, индуцированная MALDI.
2.2.3 Изучение природных модификаций белков.
2.2.4 Времяпролетная система разделения ионов и их детекция.
2.2.5 Разрешение и точность MALDI-времяпролетных масс-спектрометров.
2.2.6 Получение масс-спектров фрагментации.
2.3 Белок оболочки X вируса картофеля.
2.3.1 Строение белка оболочки X вируса картофеля.
2.3.2 Возможные модификации белка оболочки X вируса картофеля.
2.4 Гемагглютинин вируса гриппа типа А.
2.4.1 Строение вирусных частиц гриппа типа А.
2.4.2 Строение гемагглютинина и его участие в слияниис клеткой хозяина.
2.4.3 Ацилирование С-концевого участка гемагглютинина жирными кислотами и возможная роль этой модификации белка.
3. ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ.41
Препараты X вируса картофеля.
Препараты вируса гриппа типа А.
Модельные пептиды.
Масс-спектрометрия.
4. РЕЗУЛЬТАТЫ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ.48
4.1 Масс-спектрометрическое определение положения углеводных остатков в белке оболочки Х-вируса картофеля, штамм UK3, и его мутанта.
4.1.1 Определение возможных модификаций белка оболочки.
4.1.2 Определение точного положения сахарных остатков.
4.2 Изучение ацилирования цистеинов С-концевой области гемагглютинина вируса гриппа штаммов A/Puerto Rico/8/34, А/Х-31 и A/FPV/Weybridge/34 жирными кислотами.
4.2.1 Выделение и идентификация С-концевых фрагментов.
4.2.2 Изучение лабильности тиоэфирной связи под действием восстанавливающих агентов.
4.2.3 Определение соотношения количеств пальмитиновых и стеариновых остатков в С-концевой области гемагглютининов разных штаммов.
4.2.4 Изучение направленности ацилирования трех цистеиновых остатков С-концевой области гемагглютинина разными жирными кислотами.
5. ВЫВОДЫ.