Количественное профилирование смесей белков в задачах хроматомасс-спектрометрического анализа клеточных протеомов Бубис Юлия Александровна

brief description

Бубис, Юлия Александровна.
Количественное профилирование смесей белков в задачах хроматомасс-спектрометрического анализа клеточных протеомов : диссертация ... кандидата физико-математических наук : 02.00.02 / Бубис Юлия Александровна; [Место защиты: ФГАОУ ВО «Московский физико-технический институт (национальный исследовательский университет)»]. - Москва, 2022. - 100 с. : ил.
Оглавление диссертациикандидат наук Бубис Юлия Александровна
Введение
Глава 1. Обзор литературы
1.1 Протеомика «снизу-вверх»
1.1.1 Подготовка пептидной пробы
1.1.2 Разделение пептидной смеси
1.1.3 Маее-епектрометричеекий анализ
1.1.4 Идентификация пептидов и белков в протеомике «снизу-вверх» , , , ,
1.2 Сравнительная (количественная) протеомика
1.2.1 Изобарные метки для количественного анализа
1.2.2 методы количественного анализа в протеомике
Глава 2. Сравнение количественных методов без использования
изотопных меток
2.1 Аннотированный набор данных
2.2 Обработка данных
2.3 Метрики сравнения
2.4 Сравнение эффективности методов
2.5 Количественный анализ с помощью метода DireetMSl
2.5.1 Метод Бп^М81
2.5.2 Материалы и методы
2.5.3 Эффективность количественной аннотации
Глава 3. РЬозрЬоЗЫеЫ — новый метод протеолитического гидролиза
фосфорилированных белков
3.1 Эффективность триптического гидролиза фосфорилированных белков
3.2 Метод РЬоврЬоЗЫеМ
Глава 4. Валидация результатов идентификации пептидов в протеомике
на основе аминокислотных статистик
4.1 АЛ_*1а1
2
Стр.
4,2 Апробация ЛЛ_Мн1
4.2.1 Набор данных N01-60
4.2.2 Набор данных НеЬа
4.2.3 Набор данных РЬоврЬо-НеЬа
4.2.4 Поиск побочных реакций с помощью ЛЛ_Мн1
Заключение
Благодарности
Список сокращений и условных обозначений
Список литературы