Количественные модели "структура-свойство" органических соединений Григорьев, Вениамин Юрьевич

brief description

Григорьев, Вениамин Юрьевич.
Количественные модели "структура-свойство" органических соединений : диссертация ... доктора химических наук : 02.00.03, 02.00.04 / Григорьев Вениамин Юрьевич; [Место защиты: Ин-т физиологич. актив. веществ РАН]. - Черноголовка, 2013. - 324 с. : ил.
Оглавление диссертациикандидат наук Григорьев, Вениамин Юрьевич
Оглавление
Условные обозначения и сокращения ................................................2
Введение .......................................................................................7
Глава 1. Современное состояние в области создания количественных моделей «структура - свойство» и «структура - активность»
(на примере острой токсичности органических соединений) .....................13
1.1. Общая схема С^РИ/С^АЯ моделирования ....................................13
1.2. Объекты исследования и источники данных ..................................15
1.3. Дескрипторы ..........................................................................19
1.4. Кластеризация молекул. Предобработка данных ............................22
1.5. Отбор дескрипторов ................................................................26
1.6. Статистические методы моделирования ..................................28
1.7. Валидация моделей ..................................................................33
1.8. Модели ...............................................................................39
1.9. Экспертные системы ...............................................................73
Выводы по главе ...........................................................................76
Глава 2. Экспериментальная часть ......................................................78
2.1. Физико-химические данные .....................................................78
2.2. Биологические данные .............................................................78
2.3. Расчет, преобразование и отбор дескрипторов ...............................79
2.4. Меры сходства химических соединений .......................................81
2.5. Статистические методы исследования ..........................................82
2.6. Валидация С^РК/С^АЯ моделей ................................................84
2.7. Методика проведения спектральных и калориметрических измерений .87
2.8. Планирование эксперимента и оценка термодинамических параметров водородной связи по данным экспериментальных измерений ..................88
2.9. Исходные вещества, реактивы и их квалификация ...........................90
Глава 3. Количественные модели «структура - физико-химические свойства» органических соединений .................................................................92
3.1. Аддитивно-мультипликативная модель энтальпии и свободной энергии
водородной связи. Монофункциональные соединения ............................91
3.2. Аддитивно-мультипликативная модель энтальпии и свободной энергии водородной связи. Полифункциональные соединения ...........................116
3.3. Модель липофильности органических соединений ........................122
3.4. Компьютерный программный комплекс HYBOT .............................134
Выводы по главе ...........................................................................140
Глава 4. Количественные локальные модели «структура - биологическая активность» органических соединений ...............................................142
4.1. Классификационные и регрессионные модели неполярного наркоза ... 142
4.2. Классификационные и регрессионные модели полярного наркоза ......157
4.3. Линейный дискриминантно - регрессионный подход ......................182
4.4. Ретардантная активность солей четвертичного аммония .................191
Выводы по главе ..........................................................................195
Глава 5. Количественные глобальные модели «структура - биологическая активность» органических соединений ...............................................197
5.1. Модель АЛБТ .......................................................................197
5.2. Модель AMP ........................................................................213
5.3. Модель ЛРМПК ....................................................................225
5.4. Проницаемость ФАВ через гематоэнцефалический барьер .............233
Выводы по главе ..........................................................................238
Глава 6. Перспективные разработки в области создания количественных моделей «структура - свойство» и «структура - активность» ...................240
6.1. Рекуррентная модель .............................................................240
6.2. Фрактальный дескриптор ..........................................................251
6.3. Линейная динамическая модель ...............................................265
Выводы по главе ........................................................................277
Заключение .................................................................................278
Список литературы .......................................................................280