Новые особенности регуляции аппарата экспрессии генов в стационарной фазе бактериальной культуры E. coli Плетнев Филипп Игоревич

brief description

Плетнев, Филипп Игоревич.
Новые особенности регуляции аппарата экспрессии генов в стационарной фазе бактериальной культуры E. coli : диссертация ... кандидата химических наук : 02.00.10 / Плетнев Филипп Игоревич; [Место защиты: ФГБОУ ВО «Московский государственный университет имени М.В. Ломоносова»]. - Москва, 2020. - 151 с. : ил.
Оглавление диссертациикандидат наук Плетнев Филипп Игоревич
Список используемых сокращений
Введение
Актуальность проблемы
Степень разработанности темы
Цели и задачи исследования
Объект исследования
Предмет исследования
Научная новизна исследования
Теоретическая значимость исследования
Практическая значимость исследования
Методология диссертационного исследования
Основные положения, выносимые на защиту
Степень достоверности результатов
Апробация работы
Публикация работы
Личный вклад автора
Структура и объем диссертации
Обзор литературы
Стадии роста бактериальной культуры
Изменения в структуре и топологии ДНК
Регуляция транскрипции в стационарной фазе
о70 - регулятор экспрессии генов домашнего хозяйства
Регуляция активности о70 в стационарной фазе
о38 - сигма фактор стационарной фазы
Некоторые регуляторы транскрипции в стационарной фазе
Строгий ответ
Процесс трансляции E. coli в стационарной фазе
Структура рибосомы E. coli
Механизмы защиты при незначительном голоде
Гибернация рибосом как ответ на усиливающийся голод
Трансляция в условиях долговременного голода. Фаза смерти и запрограммированная клеточная гибель
Структурные особенности клеток в стационарной фазе роста
Микроэволюция бактерий в стационарной фазе
Заключение
Материалы и методы
Реактивы и биопрепараты
Штаммы
Олигонуклеотиды
Манипуляции с ДНК
Манипуляции с РНК
Манипуляции с клетками
Выделение рибосом, белков, клеточных экстрактов
Манипуляции с белками
Результаты
Постановка задачи
Полногеномное секвенирование штамма ArimK из Keio коллекции и получение новых штаммов
Влияние мутации I48S на кинетику роста и выживаемость клеток
Влияние мутации I48S на метаболическую активность клеток E. coli
Изучение транскриптома штамма I48S
Влияние мутации I48S на in vitro активность РНК-полимеразы
Получение делеции гена rimK
Определение статуса модификации белка S6 в стационарной фазе
Изучение регуляции экспрессии гена rimK
Поиск причины неконститутивности модификации S6
Обсуждение