Окислительное расщепление нуклеиновых кислот конъюгатами блеомицина с олигонуклеотидами Воробьев, Павел Евгеньевич

brief description

Воробьев, Павел Евгеньевич.
Окислительное расщепление нуклеиновых кислот конъюгатами блеомицина с олигонуклеотидами : диссертация ... кандидата химических наук : 02.00.10. - Новосибирск, 2005. - 104 с. : ил.
Оглавление диссертациикандидат химических наук Воробьев, Павел Евгеньевич
Список сокращений.
1. Введение.
2. Взаимодействие блеомицина и его олигонуклеотидных производных с нуклеиновыми кислотами (обзор литературы).
2.1. Общая характеристика блеомицинов.
2.2. Структура блеомицинов.
2.3. Активация комплексов блеомицина с ионами железа.
2.4. Связывание блеомицина с нуклеиновыми кислотами.
2.5. Специфичность расщепления нуклеиновых кислот блеомицином.
2.6. Эффективность расщепления РНК блеомицином.
2.6.1. Сравнение эффективности расщепления различных РНК.
2.6.2. Зависимость эффективности расщепления от концентрации ионов магния.
2.7. Продукты расщепления нуклеиновых кислот блеомицином.
2.8. Свойства конъюгатов блеомицина с олигонуклеотидами.
2.8.1. Синтез конъюгатов блеомицина с олигонуклеотидами.
2.8.2. Стабилизация комплементарных комплексов конъюгат-мишень остатком блеомицина.
2.8.3. Сайт-специфическое расщепление одноцепочечных ДНК.
2.8.4. Каталитическое расщепление одноцепочечной ДНК олигонуклеотидным конъюгатом блеомицина.
2.8.5. Расщепление двуцепочечной ДНК в составе триплекса.
3. Расщепление нуклеиновых кислот блеомициновыми производными олигонуклеотидов (Результаты и обсуждение).
3.1. Синтез блеомициновых производных олигонуклеотидов.
3.1.1. Синтез стандартных конъюгатов.
3.1.2. Синтез линкерсодержащих конъюгатов блеомицина с олигонуклеотидами.
3.2. Расщепление одноцепочечных ДНК конъюгатами блеомицина с олигонуклеотидами
3.2.1. Расщепление одноцепочечных ДНК конъюгатами блеомицина с протяженной олигонуклеотидной частью.;.
3.2.2. Расщепление ДНК конъюгатами блеомицина с короткими олигонуклеотидами в присутствии олигонуклеотидных эффекторов.
3.2.2.1. Факторы, определяющие эффективность расщепления одноцепочечных ДНК конъюгатами блеомицина с короткими олигонуклеотидами в составе тандемных комплексов.
3.2.3. Влияние гидрофобных и гетероциклических группировок в составе конъюгата и эффекторов на эффективность расщепления одноцепочечной ДНК конъюгатами блеомицина с короткими олигонуклеотидами в составе тандемных комплексов.
3.3. Субстратные свойства гибридных дуплексов, образованных с участием тандемов производных коротких олигонуклеотидов по отношению к рибонуклеазе Н Е. coli.
3.3.1. Гидролиз РНК рибонуклеазой Н Е. coli в составе гибридного дуплекса, образованного с участием немодифицированного тандема коротких олигодезоксирибонуклеотидов
3.3.2. Субстратные свойства тандемных гибридных дуплексов, содержащих конъюгаты блеомицина с короткими олигонуклеотидами, по отношению к рибонуклеазе Н Е. coli.
3.4. Расщепление РНК конъюгатами блеомицина с олигодезоксирибонуклеотидами.
3.5. Расщепление двуцепочечной ДНК конъюгатами блеомицина с триплекс-формирующими олигонуклеотидами (ТФО).