Развитие комбинированных методов квантовой и молекулярной механики Боченкова, Анастасия Владимировна

brief description

Боченкова, Анастасия Владимировна.
Развитие комбинированных методов квантовой и молекулярной механики : диссертация ... кандидата физико-математических наук : 02.00.17. - Уфа, 2004. - 172 с.
Оглавление диссертациикандидат физико-математических наук Боченкова, Анастасия Владимировна
Введение
Глава 1 Комбинированные методы квантовой и молекулярной механики (КМ/ММ)
1.1 Классификация по способу описания взаимодействия между квантовой и классической подсистемами.
Глава 2 Комбинированный подход, основанный на методе двухатомных фрагментов в молекулах (КМ/ДФМ)
2.1 Построение полной поверхности потенциальной энергии смешанных молекулярных кластеров ArT,(HCl)m и Arn(HF)m
2.2 Построение аналитического потенциала межмолекулярного взаимодействия Аг-НС1 и Ar-HF в рамках метода ДФМ . . 26 2.2.1 Выбор параметра смешивания.
2.3 Анализ ППЭ трехатомных систем Аг-НС1 и Ar-HF, полученных в рамках метода КМ/ДФМ: уточненная модель метода КМ/ДФМ. Границы применимости простейшего варианта метода ДФМ для построения ППЭ слабосвязанных систем
Глава 3 Поиск стационарных точек на многомерных поверхностях потенциальной энергии
3.1 Анализ известных алгоритмов поиска минимумов в задачах различной размерности: факторы, влияющие на эффективность поиска.
3.1.1 Квазиньютоновские методы.
3.1.2 Метод прямого обращения в итеративном пространстве (СОНБ)
3.1.3 Методы решения задач большой размерности.
3.2 Основания для использования специальных методов оптимизации геометрической конфигурации ядер в рамках комбинированных методов КМ/ММ.
3.3 Последовательный согласованный алгоритм градиентной оптимизации с аналитическим расчетом вторых производных ио координатам ММ подсистемы и смешанных производных
Глава 4 Моделирование колебательных спектров смешанных молекулярных кластеров Агп(НС1)т и Агп(НЕ)т, т=1
4.1 Методы расчета.
4.2 Теоретическое исследование изолированных молекулярных комплексов (НС1)т.
4.3 Колебательные спектры кластеров большого размера Аг„(НС1)т и Агп(НР)т, т >
4.4 Основные результаты.
Глава 5 Структура и колебательный спектр молекулы НАгЕ в матрице аргона
5.1 Построение аналитической ППЭ в системе Аг-НАгР в рамках метода КМ/ДФМ.
5.2 Методы расчета.
5.3 Геометрические конфигурации молекулы НАгР в матрице аргона и матричные сдвиги.
5.4 Основные результаты
Глава 6 Комбинированный подход КМ/ММ, основанный на методе потенциалов эффективных фрагментов
6.1 Методология.
6.2 Конформационный анализ пептидного фрагмента ААМА в водном окружении.
6.3 Основные результаты
Глава 7 Моделирование влияния эффектов сольватации на колебательные спектры высокосимметричных молекулярных ионов
7.1 Описание влияния растворителя: модели БСЯР и ионного окружения.
7.2 Исследование влияния сольватации на колебательные спектры системы Наз8Ь84 в водном растворе
7.2.1 Изолированный анион.
7.2.2 Модель самосогласованного реакционного поля.
7.2.3 Модель, учитывающая усредненное электростатическое поле иротивоионов.
7.3 Основные результаты.
Выводы Литература