Роль ремоделирующего хроматин комплекса PBAF в процессе миелоидной дифференцировки клеток крови человека Вирясова Галина Михайловна

brief description

Вирясова, Галина Михайловна.
Роль ремоделирующего хроматин комплекса PBAF в процессе миелоидной дифференцировки клеток крови человека : диссертация ... кандидата химических наук : 02.00.10 ; 03.01.03 / Вирясова Галина Михайловна; [Место защиты: Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова]. - Москва, 2019. - 123 с. : ил.
Оглавление диссертациикандидат наук Вирясова Галина Михайловна
Список сокращений
Введение
Глава 1. Обзор литературы
1.1. Нейтрофилы — полиморфоядерные лейкоциты человека
1.1.1. Дифференцировка нейтрофилов
1.1.2. Основные функции нейтрофилов
1.1.3. Ошибки дифференцировки клеток крови и лейкемия
1.2. Ремоделирование хроматина
1.2.1. Структура хроматина
1.2.2. Белковые комплексы, ремоделирующие хроматин
1.3. Семейство белковых комплексов SWI/SNF
1.3.1. Состав белковых комплексов SWI/SNF
1.3.2. Механизмы ремоделирования нуклеосом
1.4. Белковый комплекс PBAF в клетках человека
1.4.1. Роль комплекса PBAF в дифференцировке клеток
1.4.2. Роль комплекса PBAF в онкотрансформации клеток
1.4.3. Субъединица PHF10 белкового комплекса PBAF
Глава 2. Материалы и методы
2.1. Реактивы и материалы
2.1.1. Реактивы
2.1.2. Первичные антитела
2.1.3. Флуоресцентные метки, красители и вторичные антитела
2.1.4. Буферные растворы
2.1.5. Питательные среды
2.1.6. Последовательности праймеров
2.2. Приборы
2.2.1. Основное оборудование
2.2.2. Проточный цитометр
2.2.3. Флуоресцентный микроскоп
2.2.4. Амплификаторы
2.3. Методы
2
2.3.1. Выделение нейтрофилов человека
2.3.2. Дифференцировка клеток линии ИЬ-60
2.3.3. Выделение общей РНК
2.3.4. Синтез кДНК (обратная транскрипция)
2.3.5. Полимеразная цепная реакция с обратной транскрипцией (ПЦР)
2.3.6. Электрофорез в ПААГ
2.3.7. Блот-гибридизация в варианте «вестерн» (вестерн-блоттинг)
2.3.8. Флуоресцентная микроскопия
2.3.9. Проточная цитофлуориметрия
2.3.10. Ко-иммунопреципитация субъединиц комплекса РБАБ
2.3.11. Иммунопреципитация хроматина
2.3.13. Статистическая обработка результатов
Глава 3. Результаты и обсуждение
3.1. Модель дифференцировки клеток крови по миелоидному пути
3.1.1. Подбор оптимальных клеточных линий и условий дифференцировки клеток линии ИЬ60 в нейтрофилы
3.1.2. Экспрессия генов специфических маркеров CD66 в ходе дифференцировки клеток крови по миелоидному пути
3.1.3. Снижение пролиферативной активности клеток и выход из клеточного цикла при миелоидной дифференцировке
3.1.4. Морфологические изменения ядра при развитии промиелоцитов
3.1.5. Апоптоз и некроз при дифференцировке клеток линии ИЬ60 в нейтрофилы
3.2. Количественные изменения комплекса РБАБ при дифференцировке клеток крови
3.2.1. Эффективность транскрипции генов субъединиц комплекса РБАР
3.2.2. Экспрессия генов субъединиц комплекса РБАБ
3.3. Целостность и локализация комплекса PBAF в клетках крови
3.3.1. Целостность комплекса PBAF в ходе дифференцировки
3.3.2. Локализация субъединиц комплекса PBAF в нейтрофилах
3.4. Изоформы субъединицы РИБ10 комплекса РБАБ в промиелоцитах, дифференцированых промиелоцитах и нейтрофилах
3.4.1. Изменение соотношений изоформ субъединицы PHF10 комплекса PBAF в клетках
3.4.2. Преобладание Ss-изоформы субъединицы PHF10 в нейтрофилах.. 94 3.5. Роль комплекса PBAF в активации специфических генов при
дифференцировке клеток крови по миелоидному пути
3.5.1. Взаимодействие комплекса PBAF с промоторами генов СОбб и Р21
3.5.2. Взаимодействие субъединицы PHF10 белкового комплекса PBAF c промоторами генов СБбб и Р21
Заключение
Выводы