Синтез олигорибонуклеотидов и их фотоактивируемых перфторарилазидных производных Репкова, Марина Николаевна

brief description

Репкова, Марина Николаевна.
Синтез олигорибонуклеотидов и их фотоактивируемых перфторарилазидных производных : диссертация ... кандидата химических наук : 02.00.10. - Новосибирск, 1999. - 140 с.
Оглавление диссертациикандидат химических наук Репкова, Марина Николаевна
Список принятых сокращений
ВВЕДЕНИЕ
1. Н-ФОСФОНАТНЫЙ МЕТОД СИНТЕЗА ОЛИГОНУКЛЕОТИДОВ (Обзор литературы)
1.1. Синтез и свойства нуклеозид-Н-фосфонатов
1.2. Механизм реакции конденсации в Н-фосфонатном методе синтеза
1.3. Твердофазный Н-фосфонатный синтез олигонуклеотидов
1.3.1. Используемые полимерные носители
1.3.2. Используемые конденсирующие реагенты
1.3.3. Окисление
1.3.4. Возможные побочные реакции и способы их предотвращения
1.3.5. Синтез олигорибонуклеотидов
1.4. Твердофазное химическое 3и 5'- фосфорилирование в сочетании с Н-фосфонатным методом синтеза олигонуклеотидов
2. СИНТЕЗ ОЛИГОРИБОНУКЛЕОТИДОВ И ИХ ПРОИЗВОДНЫХ (Результаты и обсуждение)
2.1. Твердофазный Н-фосфонатный синтез олигорибонуклеотйдов и их 5'-фосфатов с использованием 2'-0-тетрагидропиранильной защитной группы
2.1.1. Синтез и свойства защищенных рибонуклеозид-Н-фосфонатов
2.1.2. Автоматический Н-фосфонатный синтез олигорибонуклеотидов
2.1.3. Твердофазный Н-фосфонатный синтез олигорибонуклеотидов в "ручном" варианте
2.1.4. Твердофазный Н-фосфонатный синтез олигорибонуклеотидов, содержащих 5'-концевой фосфат
2.2. Фотоактивируемые п-аз и дотетраф торбенз амидные производные олигорибонуклеотидов: синтез и свойства
2.2.1. Синтез фотоактивируемых производных олигорибонуклеотидов, содержащих я-азидотетрафторбензамидную группировку на 5'-концевом фосфате
2.2.2. Сравнительное изучение термической стабильности дуплексов, образованных и-азидотетрафторбензамидными производными олигорибонуклеотидов и их дезоксирибоаналогов с РНК- и ДНК-мишенями
2.2.3. Сайт-специфическая фотомодификация нуклеиновых кислот гс-азидотетрафторбензамидными производными олигорибонуклеотидов
3. ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ
3.1. Исходные материалы
3.2. Основные методы работы
3.3. Методики эксперимента
3.3.1. N-Ацил-5' -О-диметокситритил-2' -О-тетрагидропиранилрибонуклеозиды
3.3.2. Защищенные рибонуклеозид-Н-фосфонаты
3.3.3. Исследование реакционной способности защищенных рибонуклеозид-Н-фосфонатов
3.3.4. Твердофазный Н-фосфонатный синтез олигорибонуклеотидов
3.3.4.1. Автоматический синтез олигорибонуклеотидов
3.3.4.2. Твердофазный синтез олигорибонуклеотидов в "ручном" варианте
3.3.4.3. Удаление защитных групп и выделение олигорибонуклеотидов
3.3.5. Твердофазный Н-фосфонатный синтез олигорибонуклеотидов, содержащих 5'-концевой фосфат
3.3.6. Синтез олигорибонуклеотидов, содержащих и-азидотетрафторбензамидную группу на 5' -концевом фосфате