Полиморфные и STS-маркеры хромосомы 3 человека и локализация делеций на коротком плече хромосомы 3 в опухолях легкого, молочной железы и шейки матки Пугачева, Елена Михайловна

Краткое описание

Пугачева,ЕленаМихайловна.ПолиморфныеиSTS-маркерыхромосомы3человекаилокализацияделецийнакороткомплечехромосомы3вопухоляхлегкого,молочнойжелезыишейкиматки: диссертация ... кандидата биологических наук : 03.00.03. - Москва, 1999. - 102 с. : ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
ГОСУДАРСТВЕННЫЙ НАУЧНО-ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЙ ИНСТИТУТ ГЕНЕТИКИ И СЕЛЕКЦИИ ПРОМЫШЛЕННЫХ МИКРООРГАНИЗМОВ На правах рукописиПОЛИМОРФНЫЕИ 8Т8-МАРКЕРЫХРОМОСОМЫ3ЧЕЛОВЕКАИЛОКАЛИЗАЦИЯДЕЛЕЦИЙНАКОРОТКОМПЛЕЧЕХРОМОСОМЫ3 ВОПУХОЛЯХЛЕГКОГО,МОЛОЧНОЙЖЕЛЕЗЫИШЕЙКИМАТКИ03.00.03 - М о л е к у л я р н а я

стр. 2
картированиекороткогоплечахромосомы3 вопухоляхлегкого,молочнойжелезы,шейкиматкии других органов 21 1.4.1.Делециинакороткомплечехромосомы3 при ракелегкого21 1.4.2,Делециинакороткомплечехромосомы3 при ракемолочнойжелезы27 1.4.3.Делециинакороткомплечехромосомы3 при раке женских

стр. 7
было проведено такое д е л е ц и о н н о е картированиекороткогоплечахромосомы3 с использованием Д Н К из 74 пар образцов эпителиальныхопухолейтрехлокализаций(раклегкого,молочнойжелезыишейкиматки) с использованием плотной панели ди-, три- и тетрамерныхполиморфныхмаркеров(13 локусов).

Оглавление диссертациикандидат биологических наук Пугачева, Елена Михайловна
Оглавление
Введение
ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1.1.Гены - супрессоры рака
1.2. Подходы при локализации районов, содержащих гены-супрессоры рака
1.2.1. Цитогенетический анализ
1.2.2. Анализ аллельных потерь
1.2.3. Анализ нестабильности микросателлитных последовательностей
1.3. Тонкая локализация и идентификация генов в
клонированнных фрагментах ДНК
1.3.1. Noil-библиотеки для картирования генов человека, в том числе ассоциированных с развитием опухолей
1.3.2. CpG участки, их связь с NotI - клонами и генами
1.4. Делеционное картирование короткого плеча хромосомы 3 в опухолях легкого, молочной железы, шейки матки и других органов
1.4.1. Делении на коротком плече хромосомы 3 при раке легкого
1.4.2. Делеции на коротком плече хромосомы 3 при раке молочной железы
1.4.3. Делеции на коротком плече хромосомы 3 при раке женских репродуктивных органов
1.4.4. Делеции на коротком плече хромосомы 3 в опухолях других органов
1.5. Гены-кандидаты на хромосоме Зр
1.5.1. Область 3р13-р14
1.5.2. Область Зр21
1.5.3. Область Зр25
2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
2.1. Реактивы и ферменты
2.2 Буферные растворы
2.3. Бактериальные штаммы и плазмиды
2.4. Not! - библиотека и контиг космид
2.5. Выделение ДНК
2.5.1. Выделение ДНК плазмид и космид
2.5.2. Выделение геномной ДНК из ткани человека с помощью протеиназы К и экстракции фенол-хлороформом (Grimberg, 1989)
2.6. Расщепление ДНК рестриктазами и реакции лигирования
2.7. Получение компетентных клеток E.coli JM109 и их трансформация плазмидной ДНК
2.8. Электрофоретическое разделение ДНК
2.9. Определение нуклеотидной последовательности
2.10. Мечение олигонуклеотидных зондов с применением полинуклеотидкиназы фага Т4 и гибридизация по
С ау зерну
2.11. Полимеразная цепная реакция (ПЦР)
2.12. Окрашивание фрагментов ДНК в ПААГ азотнокислым серебром (согласно Budowle et al., 1991)
2.13. Популяционная выборка для анализа новых полиморфных локусов
2.14. Сбор материала
3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ
3.1. Новые маркеры на хромосоме 3 человека
3.1.1. Частота встречаемости и особенности распределения микросателлитов различных мотивов в составе Notl -библиотеки хромосомы 3 и контига космид из области 3р21.31
3.1.2. Микросателлиты в Notl-связующих и прыжковых клонах как маркеры генов
3.1.3. Получение и анализ реклонов, содержащих
микро сателлиты
3.1.4. Характеристика локусов микросателлитов с помощью ПЦР
3.1.5. Применение новых маркеров хромосомы 3
3.2. Делеционное картирование хромосомы Зр в трех видах эпителиального рака
3.2.1. Анализ аллельных потерь и нестабильности микросателлитов; учет потерь Н и L-аллелей
3.2.2, Аллельные изменения на коротком плече хромосомы 3 в образцах рака легкого
3.2.3. Аллельные изменения на коротком плече хромосомы 3 в образцах рака молочной железы
3.2.4, Аллельные изменения на коротком плече хромосомы 3 в образцах рака шейки матки
3.2.5. Сравнение аллельных изменений на хромосоме Зр в разных формах эпителиального рака
ВЫВОДЫ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ