Влияние полиморфизма капсульного антигена Yersinia pestis на иммунодиагностику и вакцинопрофилактику чумы Шишкина Лидия Александровна

Короткий опис

Шишкина,ЛидияАлександровна.ВлияниеполиморфизмакапсульногоантигенаYersiniapestisнаиммунодиагностикуивакцинопрофилактикучумы: диссертация ... кандидата биологических наук : 03.02.03 /ШишкинаЛидияАлександровна; [Место защиты: Гос. науч. центр прикладной микробиологииибиотехнологии]. - Оболенск, 2018. - 163 с. : ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
центр прикладной микробиологии и биотехнологии» На правах рукописиШишкинаЛидияАлександровнаВЛИЯНИЕПОЛИМОРФИЗМАКАПСУЛЬНОГОАНТИГЕНАYERSINIAPESTISНАИММУНОДИАГНОСТИКУИВАКЦИНОПРОФИЛАКТИКУЧУМЫСпециальность: 03.02.03. микробиология диссертация на соискание ученой степени кандидата биологических

стр. 9
Предметом исследования являлсяполиморфизмкапсульногоантигенаY.pestis, еговлияниена эффективностьиммунодиагностикиивакцинопрофилактикиинфекции. В работе

стр. 112
распространенностиполиморфизмакапсульногоантигенаY. pestis, а также изучениевлиянияданногополиморфизманаиммунодиагностикуивакцинопрофилактикучумы. Для изученияполиморфизмагена сaf1 чумного микроба и его продукта Caf1антигена, необходим, прежде всего, набор природных изолятов, представляющий

Оглавление диссертациикандидат наук Шишкина Лидия Александровна
ВВЕДЕНИЕ
Глава 1 ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1.1 Основные сведения о Yersinia pestis
1.2 История открытия капсульного антигена чумного микроба, изучение его физико-химических свойств, условий выделения и очистки
1.3 Молекулярная структура Caf1
1.4 Генетические детерминанты Cafl Y. pestis
1.5 Шаперон/ашерные системы секреции чумного микроба
1.6 Капсула как фактор патогенности Y. pestis
1.7 Иммуногенные свойства Cafl Y. pestis
1. 8 Заключение по Обзору литературы
Глава 2 МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
2.1 Штаммы микроорганизмов
2.2 Среды и условия культивирования
2.3 Лабораторные животные
2.4 Молекулярно-генетические методы
2.4.1 Выделение геномной ДНК
2.4.2 Секвенирование гена cafl
2.4.3 Полногеномное секвенирование штаммов Y. pestis subsp.
microti
2.5 Выделение и очистка СаА Y. pestis
2.6 Изучение иммунологических свойств изоформ капсульного антигена
2.6.1 Иммунизация мышей изоформами СаА
2.6.2 Перекрёстная протективность изоформ Caf1
2.6.3 Перекрёстная серологическая активность изоформ Caf1 ..............^
2.7 Биоинформационные методы
2.7.1 Анализ полиморфизма гена cafl
2.7.2 Анализ полногеномных последовательностей ДНК
2.7.3 Структурно-пространственные свойства изоформ капсульного антигена Y. pestis
2.8 Статистические методы
Глава 3 СРАВНЕНИЕ МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИХ, ФИЗИКО-
ХИМИЧЕСКИХ И СТРУКТУРНО-ПРОСТРАНСТВЕННЫХ
СВОЙСТВ ИЗОФОРМ Caf1, ВЫЯВЛЕНИЕ ОТЛИЧИЙ
3.1 Сравнительный анализ нуклеотидных последовательностей caf
генов Y. pestis и аминокислотных последовательностей кодируем-
ых ими белков
3.2 Внутренний фолдинг структуры различных вариантов СаА антигена У. рвзИя
3.2.1 Вторичная структура
3.2.2 Компьютерное моделирование третичной структуры изоформ СаН антигена
3.2.3 Внутренняя неупорядоченность изоформ СаН чумного микроба
3.3 Выделение и очистка изоформ СаН
3.4 Заключение по Главе
65
Глава 4 ИЗУЧЕНИЕ ИММУНОГЕННОЙ АКТИВНОСТИ ТРЁХ ИЗОФОРМ СЛБ1 У. pestis
4.1 Перекрёстная серологическая активность........................................................^^
4.2 Перекрёстная протективность
4.3 Заключение по Главе
Глава 5 ПОЛИМОРФИЗМ НУКЛЕОТИДНЫХ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ ШАПЕРОН/АШЕРНЫХ СИСТЕМ СЕКРЕЦИИ У. pestis..........„
/8
5.1 Полногеномное секвенирование штаммов чумного микроба, отличающихся по продуцируемым изоформам капсульного антигена
5.2 Вариабельность шаперон/ашерных систем секреции у штаммов
У. pestis различных SNP-типов
5.3 Заключение по Главе
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ВЫВОДЫ
ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ
ПЕРЕЧЕНЬ СОКРАЩЕНИЙ, УСЛОВНЫХ ОБОЗНАЧЕНИЙ, СИМВОЛОВ,
ЕДИНИЦ И ТЕРМИНОВ
СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННЫХ ИСТОЧНИКОВ
СПИСОК РАБОТ, ОПУБЛИКОВАННЫХ ПО ТЕМЕ ДИССЕРТАЦИИ
ПРИЛОЖЕНИЕ А
ПРИЛОЖЕНИЕ Б
ПРИЛОЖЕНИЕ В
ВВЕДЕНИЕ