Жирнокислотный профиль и структурное моделирование ДНК-связанных липидов Шмырина, Анастасия Сергеевна

Короткий опис

Шмырина,АнастасияСергеевна.ЖирнокислотныйпрофильиструктурноемоделированиеДНК-связанныхлипидов: диссертация ... кандидата биологических наук : 03.00.04. - Москва, 2005. - 138 с. : ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 3
синтетической среде 4.4. Обсуждение Глава 3. Зависимость характеристик и упаковки вмДНК /*. aurantiaca, от Глава 4. ЗависимостьжирнокислотногопрофиляДНК-связанныхлипидов4.1. Выделение фракцийДНК-связанныхлипидовиз препаратов вмДНК 4.2.Жирнокислотныйпрофильдвух фракцийДНК-связанныхлипидоввмДНК 4.3.ЖирнокислотныйпрофильфракцийДНК-сязанныхлипидоввмДНК Р. Глава...

Оглавление диссертациикандидат биологических наук Шмырина, Анастасия Сергеевна
Список сокращений
Введение
Общая характеристика работы
Глава 1. ДНК-связанные липиды хроматина и методы их исследования обзор литературы)
1.1. Липидомика и липиды хроматина
1.2. Выделение общих липидов
1.3. ДНК - связанные липиды и методы их выделения
1.4. Организация бактериальной ДНК
1.5. Структурная и функциональная роль липидов в организации ДНК, хромосом и хроматина
1.6. Принципы хромато-масс-спектроскометрического анализа липидных образцов
1.7. Биофизическое и компьютерное моделирование взаимодействия
ДНК с липидами
Глава 2. Материалы и методы исследования
2.1. Материалы и реагенты
2.2. Объекты
2.3. Микробиологические методы
2.3.1. Среды
2.3.2. Условия культивирования
2.3.3. Световая микроскопия
2.4. Биохимические методы
2.4.1. Выделение нуклеоида P. aurantiaca
2.4.2. Выделение высокомолекулярной ДНК (вмДНК) P. aurantiaca
2.4.3. Определение содержания ДНК и характеризация препаратов ДНК
2.4.4. Определение эластовязкости препаратов вмДНК
2.4.5. Выделение фракций ДНК-связанных липидов P. aurantiaca
2.4.6. Методика анализа состава бактериальных жирных кислот
2.5. Анализ жирнокислотного профиля липидных фракций методом газовой хроматографии-масс-спектрометрии (ГХ-МС), анализ метиловых эфиров жирных кислот
2.5.1. Характеристика прибора, условия проведения анализа
2.5.2. Стандарты
2.6. Физико-химические методы
2.6.1. Спектроскопические методы
2.6.1.1. Получение комплексов
2.6.1.2. Спектрофотометрия
2.6.1.3. Спектроскопия кругового дихроизма
2.6.1.4. Кондуктометрические хемосенсоры Sensobi
2.6.1.5. Атомно - силовая микроскопия (наноскопия)
2.6.2. Изучение взаимодействия липидов и ДНК с помощью биологических микрочипов
2.7. Статистическая обработка результатов 58 Результаты исследований и их обсуждение
Глава 3. Зависимость характеристик и упаковки вмДНК РL aurantiaca, от физиологического статуса бактериальной клетки
3.1. Выделение высокомолекулярной (вмДНК) и геномной ДНК
3.2. Свойства высокомолекулярной ДНК Pseudomonas aurantiaca
3.3. Обсуждение
Глава 4. Зависимость жирнокислотного профиля ДНК-связанных липидов геномной ДНК P. aurantiaca от состава питательной среды
4.1. Выделение фракций ДНК-связанных липидов из препаратов вмДНК прокариот
4.2. Жирнокислотный профиль двух фракций ДНК-связанных липидов вмДНК (мясо- пептонный бульон)
4.3. Жирнокислотный профиль фракций ДНК-сязанных липидов вмДНК Р. aurantiaca, выращенной на синтетической среде
4.4. Обсуждение
Глава 5. Жирнокислотный профиль ДНК-связанных липидов ДНК нуклеоида. ДНК-связанные липиды в препаратах ДНК при использовании «жесткого» метода выделения
5.1. Жирнокислотный профиль ДНК-связанных липидов геномной ДНК Р. aurantiaca, выделенной детергентным методом
5.2. Жирнокислотный профиль ДНК-связанных липидов в сравнении с профилем общих липидов P. aurantiaca
5.3. Обсуждение
Глава 6. Зависимость взаимодействия липидов с ДНК от ее нуклеотидной последовательности. Титрование синтетических полинуклеотидов ДНК олеиновой кислотой и холестерином
6.1. УФ - спектроскопия комплексов полинуклеотидов с олеиновой кислотой.
6.2. Спектры кругового дихроизма комплексов полинуклеотидов с олеиновой кислотой и холестерином
6.3. Специфичность связывания липидов (олеиновая кислота и холестерин) с нуклеиновыми кислотами: биологические микрочипы
6.4. Кондуктометрические хемосенсоры Sensobi
6.5. Обсуждение
Глава 7. Индуцированная кардиолипином ассоциация ДНК
7.1. УФ - спектроскопия комплеков полинуклеотидов с кардиолипином
7.2. Спектроскопия кругового дихроизма комплексов полинуклеотидов с кардиолипином
7.3. Изучение комплексов полинуклеотидов с кардиолипином с помощью хемосенсоров
Sensobi
7.4. Атомно - силовая микроскопия (наноскопия)
7.5. Обсуждение 113 8. Заключение 115 Выводы 120 Библиографический список 122 Приложения