Изучение структурных основ протеолитической активности пепсина на основе рентгеноструктурных исследований комплексов фермента с ингибиторами Гущина, Алла Евгеньевна

brief description

Гущина,АллаЕвгеньевна.Изучениеструктурныхосновпротеолитическойактивностипепсинанаосноверентгеноструктурныхисследованийкомплексовферментасингибиторами: диссертация ... кандидата химических наук : 03.00.03. - Москва, 1984. - 148 с. : ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
7/ / /f,/ . / / ^ . АКАДИУШ НАУК СССР ИНСТИТУТ МОЛЕКУЛЯРНОЙ БИОЛОГИИ На правах рукописи ГЩН У ИААллаЕвгеньевнаУДК 577.152:548.737ИЗУЧЕНИЕСТРУКТУРНЫХОСНОВПРОТЕОЛИГИЧЕСКОЙАКТИВНОСТИПЕПСИНАНАОСНОВЕРЕНТГЕНОСТРУКГУРНЫХИССЛЕДОВАНИЙКОМПЛЕКСОВФЕРМЕНТАСИНГИБИТОРАМИ03.00.03 - Молекулярная биология

стр. 6
рентгеноструктурныеисследованиякомплексовпепсинасингибиторамии сравнение трехмерных струк^ тур активных центров нескольких представителей этого классафер­ ментов, а также установлениеструктурныхосновингибированияпепсинамалыми молекулами. - 7 ГЛАВА IСТРУКТУРНЫЕОСНОВЫМЕХАНИЗМА ПРОТЕОЛИГМЕСКОЙ

стр. 42
субстрата также значительно замедляет гидролиз. Наличие заряженной группы вблизи расщепляемой связи в активном центреферментавлияет на егопротеолитическуюактивность. 1.5. Рентгенеструктурные подходы к выяснению механизма действия аспартатных протеиназ. I.5.I.Изучениефермент-субстратных взаимодействий наосновеисследованийкомплексовсингиби­ торамии модельных построений с гипотетичес­ кими субстратами. Объяснить различия в...

Оглавление диссертациикандидат химических наук Гущина, Алла Евгеньевна
ВВЕДЕНИЕ.
ГЛАВА I. СТРУКТУРНЫЕ ОСНОВЫ МЕХАНИЗМА. ПРОТЕОЛИСШЕСКОЙ АКТИВНОСТИ АСПАРТАТНЫХ ПРОТЕИНАЗ (ЛИТЕРАТУРНЫЙ ОБЗОР)
1.1. Аспартатные протеиназы. Основные характеристики различных представителей этого класса ферментов
1.1.1. Аминокислотный состав и сравнительный анализ первичных структур
1.1.2. Сравнительная характеристика пространственных структур
1.1.3. Некоторые представления об эволюционном развитии ферментов этого класса на основе сведений об их трехмерной структуре
1.2. Общие цредставления о строении активного центра аспартатных протеиназ.
1.2.1. Специфические ингибиторы.
1.2.2. Каталитически активные остатки
1.3. Структурные особенности изменения протеолитж-ческой активности аспартатных протеиназ при различных химических модификациях функционально важных групп фермента
1.4. Специфичность аспартатных цротеиназ.
1.5. Рентгеноструктурные подходы к выяснению механизма действия аспартатных протеиназ
1.5.1. Изучение фермент-субстратных взаимодействий на основе исследований комплексов с ингибиторами и модельных построений с гипотетическими субстратами.
1.5.2. Конформационная подвижность некоторых сегментов молекул аспартатных протеиназ
1.5.3. Некоторые представления о возможных механизмах действия аспартатных про-теиназ.
ГЛАВА II. ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ.
2.1. Получение необходимого набора фаз для расчета разностных синтезов Фурье
2.1.1. Поиски новых тяжелоатомных производных пепсина.
2.1.2. Получение трехмерного набора рентгеновских дифракционных данных для производного пепсина с соединением
2.1.3. Определение координат тяжелых атомов для производного пепсина с соединением
W(vh3)A
Финальный синтез Фурье пепсина, рассчитанный по фазам, полученным методом изоморфных замещений
2.2. Получение рентгеновских экспериментальных данных для кристаллов комплексов пепсина с различными ингибиторами'.
2.2.1. Получение комплексов пепсина с соединениями: пара-бром1)еноцилбромидом, 1,2-эпокси-3-пара-изофеноксицропаном (ЭПШ), метиловым эфщюм дииод- <f-r иро з ил-дииод-- ^тирозина (Тир^-Тир^-ОМе), метиловым эфиром фенилаланил-дииод- иро з ина
Фен-Тир12-0Ме)
2.2.2. Сбор рентгеновских дифракционных данных для кристаллов комплексов пепсина с ингибиторами. Построение разностных синтезов Фурье.
ГЛАВА III. АКТИВНЫЙ ЦЕНТР ПЕПСИНА И СРАВНЕНИЕ ЕГО С ДРУГИМИ
АКТИВНЫМИ ЦЕНТРАМИ АСПАРТАТНЫХ ПРОТЕИНАЗ
3.1. Описание структуры активного центра пепсина
3.2. Сравнение структур активных центров пепсина и аспартатных цротеиназ из Rkisopus Ch'uiensis и PeniciUum jantineiium,
3.3. Связывание этанола в активном центре пепсина
ГЛАВА 1У. РЕНТГЕНОСТРУКТУРНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ КОМПЛЕКСОВ
ПЕПСИНА С ИНГИБИТОРАМИ.
4.1. Интерпретация разностных синтезов электронной плотности, рассчитанных по фазам, полученным методом изоморфных.замещений, для комплексов пепсина с ингибиторами.
4.1.1. Комплексы пепсина с ЭПИП, п-бром|ено-цилбромидом, TnpIg-TnpIg-OMe.
4.1.2. Комплексы пепсина с Фен-Тир^-ОМе
4.2. Использование уточненных фаз для построения разностного синтеза электронной плотности ингибитора и уточнение модели ингибитора в молекуле пепсина.
ГЛАВА У. СТРУКТУРНЫЕ АСПЕКТЫ ИНГИБИРОВАНШ ПЕПСИНА МАЛЫМИ МОЛЕКУЛАМИ И ИЗМЕНЕНИЯ ЕГО КАТАЛИТИЧЕСКИХ СВОЙСТВ В ЗАВИСИМОСТИ ОТ ДЛИНЫ СУБСТРАТА.
5.1. Ингибирувдие свойства этанола.
5.2. Структурные особенности строения первичных мест связывания аспартатных протеиназ, определяющие их каталитические свойства по отношению к дипептидным субстратам.
5.3. Структурные аспекты изменения каталитических свойств пепсина в зависимости от длины субстрата
ВЫВОДЫ.