Короткие ретропозоны из геномов чешуйчатых рептилий: Отряд Squamata Косушкин, Сергей Александрович

brief description

Косушкин,СергейАлександрович.Короткиеретропозоныизгеномовчешуйчатыхрептилий:ОтрядSquamata: диссертация ... кандидата биологических наук : 03.00.03. - Москва, 2006. - 92 с. : ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
61:06-3/702 госсийская академия наук Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта На правах рукописиКосушкинСергейАлександровичКОРОТКИЕРЕТРОИОЗОИЫ ИЗ ГЕИОМОВЧЕШУЙЧАТЫХРЕИТИЛИЙ (отрядSQUAMATA) специальность 03.00.03 - молекулярная биология ДИССЕРТАЦИЯ на соискание ученой степени кандидата

стр. 66
и Squam-2 новые семействакороткихретропозонов вотряде''чешуйчатыхрептилий(Squamata): их свойства и соиоставлеиие. Обнаруженные в нашей работе два семействакороткихретропозонов типа SINE учешуйчатыхрептилийсходны, с точки зрения особенностей их структуры и размеров, с семействами SINE из

стр. 66
тРНК-неродственной области различной длины и структуры. Для более подробного описания свойств этих типов повторов у разных представителейчешуйчатыхрептилийнеобходимо остановиться более подробно на системе этогоотряда. Систематикачешуйчатыхрептилий, самого многочисленного и разнообразного,отрядарептилий, во многом противоречива, и молекулярные данные часто не согласуются с морфологическими представлениями. Вместе сотрядом...

Оглавление диссертациикандидат биологических наук Косушкин, Сергей Александрович
Введение
Глава 1. Обзор литературы б
I. Повторяющиеся элементы ДНК. б
1.1. Типы ДНК-повторов - тандемные (сателлитные) и диспергированные. б
1.2. Диспергированные повторы - классификация и структура.
1.3.1. Длинные ретропозоны (LINEs).
1.3.2. Короткие ретропозоны (SINEs): общая характеристика.
1.4. Размножение и эволюция SINE.
1.5. Функции SINEs и других повторов.
1.6. Многообразие типов коротких ретропозонов в геномах животных.
1.7. SINE в геноме чешуйчатых рептилий.
1.8. Способы поиска новых семейств SINE в геномах.
II. Проблемы молекулярной таксономии и систематики чешуйчатых рептилий отр. Squamata).
2.1. Внутри отрядная систематика рептилий отр. Squamata.
2.2. Проблема систематики на низших таксономических уровнях ящериц семейства Lacertidae.
2.2.1. История изучения кавказских скальных ящериц.
2.2.2. История изучения лесных видов (D. derjugini и D. praticola).
2.2.3. История изучения зеленых ящериц (род Lacerta s.str.).
Глава 2. Материалы и методы
2.1. Материалы, реактивы и приборы, использованные в работе.
2.1.1. Ферменты
2.1.2. Плазмидные векторы
2.1.3. Другие реактивы
2.1.4. Материалы
2.1.5. Приборы
2.2. Выделение ДНК.
2.3. Поиск и выделение копий SINE в геномах исследуемых видов. 32 2.3.1. ПЦР.
2.3.2. Клонирование ПЦР-продуктов.
2.3.3. Создание геномных клонотек и их скрининг.
2.3.4. Выделение плазмидной ДНК.
2.3.5. Дот-гибридизация ДНК.
2.3.6. Секвенирование ДНК.
2.4. Компьютерная обработка нуклеотидных последовательностей SINE
2.5. Inter-MIR-ПЦР.
2.6. Анализ паттернов Inter-MIR-ПЦР и построение дендрограмм.
2.7. Компьютерная обработка последовательностей мономеров сателлитной ДНК ящериц.
Глава 3. Результаты
3.1. Характеристика повтора Squam-1: структурные особенности.
3.2. Таксономическое распространение Squam-1. 45 3.3 Характеристика повтора Squam-2: структурные особенности.
3.4. Таксономическое распространение Squam-2.
3.5. Inter-MIR-ПЦР и анализ мономеров сателлитной ДНК.
Глава 4. Обсуждение
4.1. Squam-1 и Squam-2 - новые семейства коротких ретропозонов в отряде чешуйчатых рептилий (Squamata): их свойства и сопоставление.
4.2. Использование Inter-SINE-ПЦР и сателлитной ДНК при изучении эволюции и таксономической структуры рептилий.
Выводы
Благодарности