Повторяющиеся последовательности генома тупай: Mammalia, Scandentia Тен, Олег Андреевич

brief description

Тен,ОлегАндреевич.Повторяющиесяпоследовательностигеноматупай:Mammalia,Scandentia: диссертация ... кандидата биологических наук : 03.00.03. - Москва, 2006. - 97 с. : ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
61:06-3/704 1 Росснйская академня наук Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта На нравах руконисиТенОлегАндреевичПОВТОРЯЮЩИЕСЯПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИГЕПОМАТУПАЙ(Mammalia,Scandentia). снециальиость 03.00.03 - молекулярная биология ДИССЕРТАЦИЯ на соискание ученой стенени кандидата биологических

стр. 8
клонировать и секвенировать многокопийныеповторяющиесяпоследовательностигеномаTupaia glis. Провести анализ их нуклеотидныхпоследовательностей. ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ: ОСНОВНЫЕ ТИНЫ НОВТОРЯЮЩИХСЯ НОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ ВГЕНОМЕВЫСШИХ ЭУКАРИОТ. 1.1 1.1.1 САТЕЛЛИТНАЯ ДНК. Общая характеристика и структурная

стр. 19
рассеянных по геномуповторяющихсяэлементов. Вгеномахбольшинства млекопитающихпоследовательностисателлитных ДНК составляют лишь третью часть от обшего числаповторяющихсяпоследовательностей. Остальные повторы (эта фракция объединяет до 20% всей клеточной ДНК) ренатурируют медленнее, чем сателлитная ДНК,

Оглавление диссертациикандидат биологических наук Тен, Олег Андреевич
Основные обозначения и сокращения
Введение
Глава 1 .Обзор литературы: Основные типы повторяющихся последовательностей в геноме высших эукариот
1.1. Сатсллитная ДНК
1.1.1. Общая характеристика и структурная организация тандемно организованных повторов и составляющих их элементов
1.1.2. Основные классы сателлитной ДНК в геноме человека
1.1.3. Альфа-сателлитпая ДНК — доминирующий класс центромерных ДНК
1.1.4. Иерархическая организация а-сателлитной ДНК
1.1.5. Происхождение и эволюция тандемно организованных повторов
1.1.6. Значения для генома
1.2. Рассеянные по геному повторяющиеся последовательности.
1.2.1. Общая характеристика рассеянных по геному повторяющихся элементов
1.2.2. ДНК-транспозоны
1.2.3. Ретротранспозоны
1.2.4. LTR-содержащие ретротранспозоны
1.2.5. Длинные ретропозоны
1.2.6. Короткие ретропозоны
1.2.7. 7SL- РНК родственные КР
1.2.8. Происхождение и эволюция 7SL РНК-родственных КР
1.2.9. Малые РНК и их гены, ведущие происхождение от 78Ь-родственных КР
1.2.10. Значение КР для генома
1.2.11. Перспективы использования КР в филогенетических исследованиях
Глава 2. Материалы и методы
2.1. Материалы и реактивы, использованные в работе
2.1.1. Ферменты и наборы
2.1.2. Плазмидные векторы
2.1.3. Другие реактивы
2.1.4. Материалы
2.1.5. Приборы
2.2. Животные, ткани и ДНК
2.3. Выделение геномной ДНК
2.4. Дот-гибридизация
2.5. Гибридизация по Саузерну
2.6. Электрофорез ДНК в агарозном геле
2.6.1 .Выделение ДНК из геля
2.7. Полимсразпая ценная реакция (ПЦР)
2.8. Радиоактивное мечение ДНК
2.9. Создание геномных библиотек и их скрининг
2.10. Выделение плазмидной ДНК
2.11. Секвепирование ДНК
2.11.1. Секвенирование с использованием модифицированной
Т7 ДНК-полимеразы (секвеназы)
2.11.2. Секвенирование с использованием Taq-полимеразы
2.11.3. Секвенирующий электрофорез в ПААГ
2.12. Компьютерный анализ
Глава 3. Результаты
3.1. Изучение распространения 7SL РНК-родственных
SINE среди млекопитающих
3.2. Клонирование и секвенирование 78Ь-родственных КР
3.3. Обнаружение и клонирование высокоповторнющихся последовательностей генома Tupaiaglis
3.4. Основной короткий ретропозон генома тупай
3.5. Основная тандемная последовательность генома Tupaia glis
Глава 4. Обсуждение результатов
4.1. Тандемный повтор
4.2. 78Ь-родствснные короткие ретропозоны
4.3. Основной короткий ретропозон генома тупай 78 Выводы 82 Благодарности 83 Список литературы
Основные обозначения и сокращения
ДЭАЭ-мембрана диэтиламиноэтил-целлюлозиая мембрана кДНК комплементарная ДНК
ПААГ полиакриламидный гель
ОРС открытая рамка считывания
ЭДТА этилендиаминтетрауксусная кислота
SSC стандартный солевой раствор
SDS додецилсульфат натрия
SRP signal recognition particles
ДР длинный ретропозоп
КР короткий ретропозон
7SL-KP 7SL РНК-родственные ретропозоны
LTR long terminal repeats
LINE long interspersed elements
SINE short interspersed elements
FAM fossil Alu monomer
FLAM free left Alu monomer
FRAM free right Alu monomer pBl proto B
ERV Endogenous retroviruses