"Простые" последовательности в геноме крысы, комплементарные ДНК аденовируса человека типа 5 Иванова, Марите Николаевна

brief description

Иванова,МаритеНиколаевна."Простые"последовательностивгеномекрысы,комплементарныеДНКаденовирусачеловекатипа5: диссертация ... кандидата химических наук : 03.00.03. - Москва, 1983. - 141 с. : ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
'''<?5^^/of'(?^ АКАДЕМИЯ П А Ж СССР ИНСТИТУТ МОЛЕКУЛЯРНОЙ БИОЛОГИИ На правах рукописи УДК 577.29+577.113.5ИВАНОВАМаритеНиколаевна"ПРОСТЫЕ" ПОСЛЩОВАТЕЛЬНОСТИ ВГЕНОМЕКРЫСЫ,КОМПЛЕМЕНТАРНЫЕДНКАДЕНОВИРУСАЧЕЛОВЕКАТИПА5 03.00.03 - Молекулярная биология Диссертация на соискание ученой степени кандидата

стр. 8
ходе работы было установлено, что проклонированные участкигеномакрысы, гибридизующиеся сДНКДц5, относятся ктипу"прос­ тых" повторяющихсяпоследовательностей..Данныетипы"простых"по­ следовательностейбыли выявлены впервые. Выделенные сегменты "про­ стых" повторовДНК.крысыбышз весьма протшсенны

стр. 8
участков, в которых расположены "простые"последователь­ ностивыявленных наглитипов. Весьма возможно, что обнаруженные нагли "простые"последовательностигеномакрысы,комплементарныеДНКаденовируса, могут слулшть своеобразныш шшенями для интеграции вируснойДНКвгеномеклетки. - 9 ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ ГЛАВА

Оглавление диссертациикандидат химических наук Иванова, Марите Николаевна
Список использованных соьфащений.
ВВВДЕНИЕ.
ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.
ГЛАВА I. "ПРОСТЫЕ" ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ В ГЕНОМЕ ЭУКАРИОТ.
1.1. Повторяющиеся последовательности ДНК в геноме эукариот
1.2. Сателлитные ДНК (стДНК)
1.3. Полипиривяидиновые-полипуриновые последовательности ДНК, их возможные функции.
1.4. Присутствие "простых" последовательностей на концах линейных молекул экстрахромосомальных рибосомных
ДНК (рДНК)
1.5. "Простые" последовательности ДНК и транспозиция генов.
1.6. Возможное участие "простых" последовательностей ДНК в процессах поддержания гомогенности структуры муль-тигенных семейств.
1.7. Способность некоторых "простых" последовательностей к переходу в z -конформацию ДНК.
1.8. "Простые" повторяющиеся последовательности, входящие в состав генов, кодирующих фибриллярные белки.
1.9. "Простые" последовательности в геноме вируса Эпштейн-Барра.
ГЛАВА II. ИНТЕГРАЦИЯ АДЕНОВИРУСНОЙ ДНК В ГЕНОМ КЛЕТКИ-ХОЗЯИНА.
ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ.
ГЛАВА III. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ.
111.1. Выращивание рекомбинантных фагов Харон 4А, содержащих библиотеку генов крысы, и иммобилизация фаговой ДНК на нитроцеллюлозные фильтры.
111.2. Получение препаратов ДНК, меченых методом "смещение одноцепочечных разрывов"
111.3. Гибридизация ДНК, иммобилизованной на нитроцеллншоз-ных фильтрах, с мечеными пробами ДНК.
111.4. Радиоавтография.
111.4.1. Анализ гибридизационных фильтров.
111.4.2. Анализ полиавриламидных гелей.
111.5. Отбор индивидуальных клонов из библиотеки генов крысы, гибридизупцихся с ДНК аденовируса типа
111.6. Выделение ДНК из рекомбинантных фаговых клонов
111.7. Выделение и очистка плазмидной ДНК.
111.7.1. Выделение плазмидной ДНК в препаративных количествах
111.7.2. Очистка плазмидной ДНК гель-фильтрацией на колонке биогеля А 15м.
111.7.3. Центрифугирование плазмидной ДНК в градиенте плотности хлористого цезия.
111.7.4. Выделение плазмидной ДНК в аналитических количествах
111.8. Обработка ДНК рестрикционными эндонуклеазами.
111.9. Разделение фрагментов ДНК электрофорезом в агароз-ных и полиакриламидных гелях.
Ш.Ю.Эинектроэлюция фрагментов ДНК из агарозных и полиакриламидных гелей.
111.11.Перенос фрагментов ДНК из агарозного геля на нит-роцеллвшозные фильтры.
111.12. Субклонирование фрагментов ДНК крысы в шгазмид-ном векторе
III. 12.1. Получение векторной ДНК.
111.12.2. Реакция лигирования.
111.12.3. Приготовление компетентных клеток E.coli и их трансформация шгазмидной ДНК.
III.12.4. Отбор рекомбинантных клонов.
III. 13. Оцределение первичной структуры ДНК.
III. 13.1. Дефосфорилирование фрагментов ДНК.
III.13.2. Введение 5'-концевой метки в ДНК.
III. 13.3. Введение 3'- концевой метки в ДНК.
III. 13.4. Получение фрагментов ДНК, меченых по одному концу.
III. 13.5. Злюция меченых фрагментов ДНК из ПААГ.
III. 13.6. Частичная химическая модификация меченых по одному концу фрагментов ДНК.
III. 13.7. Разделение продуктов частичной химической модификации меченых фрагментов ДНК в ПААГе в денату-рвдвдих условиях.
111.14. Анализ первичной структуры ДНК с помощью ЭВМ
111.15. Реактивы и материалы, использованные в работе.
ГЛАВА 1У. РЕЗУЛЬТАТЫ.
1У.1. Получение клонов из библиотеки генов крысы, гибридизующихся с ДНК аденовируса типа 5.
1У.2. Картирование и определение первичной структуры фрагментов ДНК, гибридизующихся с ДНК Ад5.
1У.З. Выяснение локализации участков генома аденовируса типа 5, комплементарных ДНК рекомбинантных клонов.85 1У.4. Выяснение частоты встречаемости в геноме крысы "црос-тых"последовательностей, комплементарных ДНК Ад5.
ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ.
ВЫВОДЫ.III