Роль легкодеформируемых звеньев промоторной ДНК в формировании транскрипционных комплексов с РНК-полимеразой E. coli Костяницына, Елена Геннадьевна

brief description

Костяницына,ЕленаГеннадьевна.РольлегкодеформируемыхзвеньевпромоторнойДНКвформированиитранскрипционныхкомплексовсРНК-полимеразойE.coli: диссертация ... кандидата биологических наук : 03.00.03. - Пущино, 2005. - 98 с. : ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
61:06-3/430 РОССИЙСКАЯ АКАДЕМИЯ ИАУК Институт биофизики клетки На правах рукописиКостяницынаЕленаГеннадьевнаРОЛЬЛЕГКОДЕФОРМНРУЕМЫХЗВЕНЬЕВНРОМОТОРНОЙДНКВ ФОРМНРОВАНИН ТРАНСКРННЦНОННЫХ КОМНЛЕКСОВ С РНКНОЛНМЕРАЗОЙ E.COLI03.00.03-молекулярная биология Диссертация на соискание ученой степени кандидата

стр. 2
2.0собенностиДНК-белковых взаимодействий втранскрипционныхкомплексах2.1 .Топологическая характеристикаполимераза-промоторныхкомплексов2.2.Пространственная организациятранскрипционногокомплекса2.3.Особенности взаимодействия а-субъединицРНК-полимеразыс промоторами 3. Конформациоиные свойстваДНК3.1.

стр. 7
них нуклеотидная последовательность промоторов обогащеналегкодеформируемымизвеньями, способствующими адаптивной изомеризации ДЬЖ в условиях слабого изгибного напряжения. Обзор посвящен анализу данных, отражающихрольэтих элементов литературы вформированиитранскрипционногокомплекса. Современные представления о структуреРНК-полимеразы, промотора и механизмах инициации транскрипции даны в объеме, необходимом для понимания сведений о..

Оглавление диссертациикандидат биологических наук Костяницына, Елена Геннадьевна
ВВЕДЕНИЕ 3 ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ (Роль структурно-специфических взаимодействий в формировании транскрипционных комплексов)
1.Общие представления о механизмах инициации транскрипции
1.1 .Характеристика РНК-полимеразы
1.2.Структурная организация промоторов 11 1.3.Общие представления о механизмах взаимодействия РНК-полимеразы с промотором
2.0собенности ДНК-белковых взаимодействий в транскрипционных комплексах
2.1.Топологическая характеристика полимераза-промоторных комплексов
2.2.Пространственная организация транскрипционного комплекса 22 2.3.Особенности взаимодействия а-субъединиц РНК-полимеразы с промоторами 24 3. Конформационные свойства ДНК
3.1. Конформационные свойства ДНК
3.2. Роль легкодеформируемых динуклеотидов в активации транскрипции
3.3. Деформация ДНК в комплексах с белками 34 Заключение 38 МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ 40 РЕЗУЛЬТАТЫ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ
1. Локализация участка температуро-зависимых конформационных перестроек в промоторе
2. Структурно-функциональная роль динуклеотидов ТА, находящихся менаду местами взаимодействия а-субъединиц.
2.1. Функциональная характеристика Т7Д
2.2. Структурная характеристика комплексов, формируемых РНК-полимеразой с T7D&
2.3. Зависимость матричных свойств промотора Т7D от положения кинкообразующего динуклеотида ТА
3. Структурно-функциональная роль динуклеотидов ТА, находящихся в участках непосредственного контакта с а-субъединицами РНК-полимеразы.
3.1. Структурно-функциональная характеристика Т7D.^ic
3.2. Структурно-функциональная характеристика TlD^k