Новая секретируемая рибонуклеаза bacillus licheniformis: характеристика и биологические свойства Сурченко Юлия Владимировна

Короткий опис

Сурченко,ЮлияВладимировна.НоваясекретируемаярибонуклеазаBacilluslicheniformis:характеристикаибиологическиесвойства: диссертация ... кандидатабиологическихнаук : 03.02.03 /СурченкоЮлияВладимировна; [Место защиты: Казан. (Приволж.) федер. ун-т]. - Казань, 2019. - 149 с. : ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
«КАЗАНСКИЙ (ПРИВОЛЖСКИЙ) ФЕДЕРАЛЬНЫЙ УНИВЕРСИТЕТ» На правах рукописиСУРЧЕНКОЮЛИЯВЛАДИМИРОВНАНОВАЯСЕКРЕТИРУЕМАЯРИБОНУКЛЕАЗАBACILLUSLICHENIFORMIS:ХАРАКТЕРИСТИКАИБИОЛОГИЧЕСКИЕСВОЙСТВА03.02.03 микробиология Диссертация на соискание ученой степени кандидатабиологическихнаук Научный руководитель:

стр. 4
геноме B.licheniformis.............................. 66 3.2 Сравнительный анализ физико-химическихсвойствРНКаз B.licheniformis, B. amyloliquefaciens и B. pumilus, выделение и очистка РНКазы B.licheniformis...................................................................................... 71 3.3 Анализ пространственной структуры РНКазы B.licheniformisи определение паттерна формирования олигомерных структур ................. 77 3.4 Создание...

стр. 119
1992. Т. 26. С. 1338-1348. 5. Дудкина, Е.В. ПолучениеновойсекретируемойрибонуклеазыBacillussp. на основе рекомбинантного штаммаBacillusmegaterium

Оглавление диссертациикандидат наук Сурченко Юлия Владимировна
ВВЕДЕНИЕ
ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1.1 Рибонуклеазы - перспективные препараты таргетного действия
1.2 Эукариотические цитотоксичные РНКазы
1.2.1 Онконаза
1.2.2 BS-РНКаза
1.2.3 а-Сарцин
1.3 Секретируемые РНКазы бацилл
1.3.1 Общие свойства и механизм деградации РНК
1.3.2 Биназа
1.3.3 Барназа
1.3.4 РНКаза Sa
1.3.5 Bacillus licheniformis - продуцент низкомолекулярной гуанил-предпочитающей РНКазы
1.3.6 Внеклеточные высокомолекулярные рибонуклеазы бацилл
1.4 Механизмы и молекулярные детерминанты, определяющие цитотоксичность РНКаз
1.5 Методы выделения бациллярных РНКаз
1.6 Олигомеризация белков
1.6.1 Роль олигомеризации белков в их биологической активности
1.6.2 Димеризация РНКаз
1.7 Циклические нуклеотиды
ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ
ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
2.1 Штаммы бактерий и условия культивирования
2.2 Векторы для клонирования
2.3 Линии клеток и условия культивирования
2.4 Лабораторные животные
2.5 Определение рибонуклеазной активности
2.6 Хроматографические методы
2.6.1 Подготовка ионитов для ионообменной хроматографии
2.6.2 Ионообменная хроматография
2.6.3 Гель-фильтрация
2.6.4 Очистка рекомбинантных белков
2.7 Электрофоретические методы
2.7.1 ДСН-электрофорез в ПААГ
2.7.2 Зимография
2.7.3 Электрофорез в нативных условиях
2.7.4 Вестерн-блоттинг
2.7.5 Электрофорез ДНК
2.8 Масс-спектрометрия
2.9 Генная инженерия
2.9.1 Получение геномной ДНК
2.9.2 Создание экспрессионных конструкций
2.9.3 Трансформация и анализ рекомбинантной ДНК
2.9.4 Подбор оптимальных условий экспресии
2.9.5 Получение периплазматической фракции
2.10 Определение цитотоксичности
2.11 Определение 2',3'-цГМФ
2.11.1 Подготовка образцов
2.11.2 БОБЛ-тест
2.12 ЯМР-спектроскопия
2.13 Активность неспецифических фосфодиэстераз (ФДЭ) мозга крыс
2.14 Цитофлуориметрический анализ
2.15 Биоинформатический анализ
2.16 Статистическая обработка результатов
ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЙ
3.1 Поиск гена внеклеточной низкомолекулярной РНКазы и изучение его генетического окружения в геноме В. licheniformis
3.2 Сравнительный анализ физико-химических свойств РНКаз В. Иchemformis, B. amyloliquefaciens и В. ритНш, выделение и очистка РНКазы B. licheniformis
3.3 Анализ пространственной структуры РНКазы В. licheniformis и определение паттерна формирования олигомерных структур
3.4 Создание генетических конструкций, получение и анализ рекомбинантных белков
3.5 Оценка цитотоксических свойств полученных препаратов аутентичной и рекомбинантной РНКазы В. licheniformis
3.6 Идентификация 2',3'-цГМФ при расщеплении РНК биназой и его
действие на клетки карциномы легких человека А549
ГЛАВА 4. ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ
4.1 Генетический контекст генов внеклеточных низкомолекулярных РНКаз
4.2 Сравнительный анализ физико-химических свойств биназы, барназы и балифазы, выделение и очистка балифазы
4.3 Анализ пространственной структуры РНКазы В. licheniformis и определение паттерна формирования олигомерных структур
4.4 Создание генетических конструкций, получение и анализ рекомбинантных белков
4.5 Оценка цитотоксических свойств полученных препаратов аутентичной и рекомбинантной РНКазы В. licheniformis
4.6 Идентификация 2',3'-ЦГМФ при расщеплении РНК биназой и его
действие на клетки карциномы легких человека А549
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ И УСЛОВНЫХ ОБОЗНАЧЕНИЙ
СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННЫХ ИСТОЧНИКОВ