Разработка сульфозамещенных ингибиторов транскетолазы и тирозил-ДНК-фосфодиэстеразы 1 с использованием методов биоинформатики и молекулярного моделирования Гущина Ирина Владимировна

Короткий опис

Гущина,ИринаВладимировна.Разработкасульфозамещенныхингибиторовтранскетолазыитирозил-ДНК-фосфодиэстеразы1сиспользованиемметодовбиоинформатикиимолекулярногомоделирования: диссертация ... кандидата биологических наук : 03.01.08 /ГущинаИринаВладимировна; [Место защиты: ФГБОУ ВО «Московский государственный университет имени М.В. Ломоносова»]. - Москва, 2021. - 110 с. : ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
МОСКОВСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ УНИВЕРСИТЕТ имени М.В. ЛОМОНОСОВА ФАКУЛЬТЕТ БИОИНЖЕНЕРИИ ИБИОИНФОРМАТИКИ, НИИ ФИЗИКО-ХИМИЧЕСКОЙ БИОЛОГИИ имени А.Н. БЕЛОЗЕРСКОГО На правах рукописиГущинаИринаВладимировнаРазработкасульфозамещенныхингибиторовтранскетолазыитирозил-ДНК-фосфодиэстеразы1 сиспользованиемметодовбиоинформатикиимолекулярногомоделированияСпециальность 03.01.08 ...

стр. 2
........................................................................ 46 3.1Разработкаингибиторовтранскетолазы......................................................... 46 3.1.1Молекулярноемоделированиеи биоинформатический анализтранскетолаз............................................................................................................. 46 3.1.2 Первичный скринингингибиторовтранскетолазы...

Оглавление диссертациикандидат наук Гущина Ирина Владимировна
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
ВВЕДЕНИЕ
ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1.1 Использование сульфонатов в медицинской химии
1.2 Строение и функция транскетолазы
1.3 Строение и функция тирозил-ДНК-фосфодиэстеразы
МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
2.1 Построение моделей ферментов
2.2 Подготовка библиотек низкомолекулярных соединений
2.3 Молекулярный докинг и виртуальный скрининг
2.4 Структурная фильтрация лигандов
2.5 Моделирование ADMET-свойств
2.6 Экспериментальная проверка ингибиторной активности
РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ
3.1 Разработка ингибиторов транскетолазы
3.1.1 Молекулярное моделирование и биоинформатический анализ транскетолаз
3.1.2 Первичный скрининг ингибиторов транскетолазы
3.1.3 Вторичный скрининг ингибиторов транскетолазы
3.2 Разработка ингибиторов тирозил-ДНК-фосфодиэстеразы
3.2.1 Молекулярное моделирование тирозил-ДНК-фосфодиэстеразы
3.2.2 Первичный скрининг ингибиторов тирозил-ДНК-фосфодиэстеразы
3.2.3 Вторичный скрининг ингибиторов тирозил-ДНК-фосфодиэстеразы
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ОСНОВНЫЕ РЕЗУЛЬТАТЫ И ВЫВОДЫ
БЛАГОДАРНОСТИ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
КМ квантово-механический
MM молекулярно-механический
ТДФ1 тирозил-ДНК-фосфодиэстераза
TK транскетолаза
ADMET абсорбция, распределение, метаболизм, выведение, токсичность (absorption, distribution, metabolism, excretion, toxicity)
ATP аденозинтрифосфат
AG свободная энергия связывания
IC50 концентрация ингибитора, уменьшающая активность фермента на 50 %
LD50 доза, летальная для 50 % тестируемых животных
NAD+ никотинамидадениндинуклеотид, окисленная форма
NADPH никотинамидадениндинуклеотид фосфат, восстановленная форма
PDB база данных белковых структур Protein Data Bank
Top1 топоизомераза I