Структура и анализ генома вируса Карши Ляпина, Ольга Викторовна

Короткий опис

Ляпина,ОльгаВикторовна.СтруктураианализгеномавирусаКарши: диссертация ... кандидата биологических наук : 03.00.03. - Москва, 2006. - 120 с. : ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
61:06-3/839 РОССИЙСКАЯ АКАДЕМИЯ МЕДИЦИНСКИХ НАУК ГУ НИИ ВИРУСОЛОГИИ имени Д.И. ИВАНОВСКОГО На правах рукописи ЛЯЛИНАОЛЬГАВИКТОРОВНАСТРУКТУРАИАНАЛИЗГЕНОМАВИРУСАКАРШИ03.00.03 -Моле1сулярпая биология Диссертация на соискапие учёпой степени кандидата биологических наук Научный руководитель кандидат

стр. 3
вирусаКарши(штамм LEIV-2247 Uz) 3.2. Определение первичной нуклеотидной последовательностигеномаштамма LEIV-7192 Tur 3.3.АнализструктурыполноразмерногогеномавирусаКарши.. 3.3.1. Особенности организации белковвирусаКарши3.3.2. 5'-нетранслируемая областьгенома3.4. Филогенетические взаимоотношения

стр. 66
получения фрагментовгеномавирусаКарши{LEIV-2247 Uz), использованных для определения нуклеотидной последовательности. А.СтруктурагеномавирусаКарши. С, ргеМ,

Оглавление диссертациикандидат биологических наук Ляпина, Ольга Викторовна
Список использованных сокращений.
ВВЕДЕНИЕ.
Глава 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.
1.1. Экология вируса Карши и его географическое распространение.
1.2. Биологические свойства вируса Карши.
1.2.1. Патогенные свойства вируса.
1.2.2. Роль вируса Карши в патологии человека.
1.3. Иммунохимические характеристики вируса.
1.4. Таксономическое положение вируса Карши.
1.5. Молекулярно-биологические характеристики флавивирусов.
1.5.1. Структура генома флавивирусов.
1.5.2. Вирусные белки.
1.5.3. Репродуктивный цикл флавивирусов.
1.6. Филогенетические взаимоотношения представителей рода Flavivirus.
1.7. Проблемы классификации вирусов комплекса клещевого энцефалита.
СОБСТВЕННЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ.
Глава 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ.
2.1. Исследуемые штаммы.
2.2. Использованные олигонуклеотидные праймеры.
2.3. Выделение вирусной РНК.
2.4. Реакция обратной транскрипции.
2.5. Проведение полимеразной цепной реакции.
2.6. Определение 5'-концевой последовательности геномной
2.7. Электрофорез ДНК.
2.8. Подготовка ДНК для секвенирования.
2.9. Секвенирование ДНК.
2.10. Построение алайментов и филогенетический анализ.
2.11. Клонирование ПЦР-фрагментов.
Глава 3. РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЙ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ.
3.1. Определение первичной нуклеотидной последовательности генома вируса Карши (штамм LEIV-2247 Uz).
3.2. Определение первичной нуклеотидной последовательности генома штамма LEIV-7192 Tur.
3.3. Анализ структуры полноразмерного генома вируса Карши.
3.3.1. Особенности организации белков вируса Карши.
3.3.2. 5'-нетранслируемая область генома.
3.4. Филогенетические взаимоотношения вируса Карши и других представителей рода Flavivirus.
3.5. Создание лабораторного варианта ОТ-ПЦР для детекции вируса Карши.