Свойства 5'-нетранслируемой области мРНК белка теплового шока человека HSP70 Рубцова, Мария Петровна

Короткий опис

Рубцова, Мария Петровна.
Свойства 5'-нетранслируемой области мРНК белка теплового шока человека HSP70 : диссертация ... кандидата химических наук : 02.00.10. - Москва, 2004. - 110 с. : ил.
Оглавление диссертациикандидат химических наук Рубцова, Мария Петровна
Список сокращений ВВЕДЕНИЕ
ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
Участки внутреннего связывания рибосомы клеточных мРНК
1.1. Общая схема инициации белкового синтеза в клетках эукариот
1.2. Внутренняя инициация трансляции
1.3. Инициация трансляции по механизму шунтирования
1.4. Метод поиска IRES-элементов
1.5. Участки внутреннего связывания клеточных мРНК
1.5.1. IRES-элемент мРНК BIP/GRP
1.5.2. IRES-элементы мРНК морфогенетических факторов Ultrabithorax и Antennapedia
1.5.3. IRES-элемент мРНК протоонкогена с-туе
1.5.4. IRES-элемент мРНК N-myc 25 pi 1.5.5. IRES-элемент мРНК AML1/RUNX
1.5.6. IRES-элемент мРНК NRF
1.5.7. IRES-элемент мРНК Smad
1.5.8. IRES-элемент мРНК аутоантигена La
1.5.9. IRES-элемент мРНК XIAP
1.5.10. IRES-элемент мРНК BAG
1.5.11. IRES-элемент мРНК Apaf-1 32 * 1.5.12. IRES-элемент мРНК FGF
1.5.13. IRES-элемент мРНК PDGF2/c-Sis
1.5.14. IRES-элемент мРНК VEGF
1.5.15. IRES-элемент мРНК PITSLRE
1.5.16. IRES-элемент мРНК р
1.5.17. IRES-элемент мРНК протеинкиназы С5 (РКС) 40 0 1.5.18. IRES-элемент мРНК рецептора IGF-I
1.5.19. IRES-элемент мРНК cat
1.5.20. IRES-элемент мРНК орнитиндекарбоксилазы
1.5.21. IRES-элементы других мРНК клеточных белков 45 IRES-элемент мРНК FMR1 45 IRES-элемент мРНК NDST 46 IRES-элемент мРНК Myt
IRES-элемент мРНК c-jun
IRES-элемент мРНК Mnt
IRES-элемент мРНК Nkx6.
IRES-элемент мРНК HIF-la
IRES-элемент мРНК DAP5/NAТ1/Р
IRES-элемент мРНК Сх
IRES-элемент мРНК Сх
IRES-элемент мРНК рецептора эстрогена а
IRES-элемент мРНК Kvl.
ГЛАВА 2. РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЙ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ Свойства 5'-нетранслируемой области мРНК белка теплового шока человека HSP
2.1. Особенности инициации трансляции в условиях теплового шока
2.2. Исследование способности мРНК HSP70 к внутренней инициации трансляции
2.3. Определение границ IRES-элемента мРНК HSP
2.4. Делеционный анализ IRES-элемента мРНК HSP
2.5. Трехмерная модель узнавания инициаторного кодона при инициации трансляции на 5 '-НТО мРНК HSP
ГЛАВА 3. ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ
3.1. Реактивы и материалы
3.2. Плазмидные конструкции, использованные для исследования способности 5'-НТО мРНК HSP70 к внутренней инициации
3.3. Плазмидные конструкции, использованные для исследования границ IRES-элемента мРНК HSP
3.4. Плазмидные конструкции, использованные для делеционного анализа IRES-элемента мРНК HSP
3.5. Клонирование
3.5.1. Рестрикция и выделение фрагмента ДНК в легкоплавкой агарозе
3.5.2. Лигирование
3.5.3. Полимеразная цепная реакция
3.6. Трансфекция клеток и измерение в них активности люцифераз и Р-галактозидазы
3.7. Определение целостности РНК методом защиты от рибонуклеаз 82 ВЫВОДЫ 85 СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ мРНК матричная РНК
Met-tRNAj инициаторная тРНК рРНК рибосомная РНК
5'-НТО 5'-нетранслируемая область
IRES-элемент участок внутреннего связывания рибосомы elF эукариотический фактор инициации трансляции
HSP 70 белок теплового шока
АТР аденозин-5'-трифосфат
GTP гуанозин-5'-трифосфат
UTP уридин-5'-трифосфат
GDP гуанозин-5'-дифосфат
NTP рибонуклеозид-5'-трифосфат
ПААГ полиакриламидный гель
EDTA этилендиаминтетраацетат
HPRI ингибитор РНКаз из плаценты человека
BiP/GRP78 белок, связывающий тяжелую цепь иммуноглобулинов/регулируемый глюкозой белок
NRF репрессор фактора NF-kB
XIAP Х-сцепленный ингибитор апоптоза
BAG-1 белок, ассоциированный с антиапоптотическим геном Вс
Apaf-1 фактор 1, активирующий апоптотические протеазы
FGF2 фактор роста фибробластов
PDGF2/c-Sis фактор роста тромбоцитов
VEGF фактор роста сосудистого эндотелия
IGF-I инсулиноподобный фактор роста I cat-1 переносчик катионных аминокислот
NDST гепарансульфат-А^-ацетилглюкозамин-//-деацетилазаЛУ-сульфотрансфераза
HIF-la индуцируемый гипоксией фактор la
DAP5/NAT1/P97 белок, ассоциированный с гибелью клеток
Сх коннексин