Трансляционная подвижность и особенности надмолекулярной организации белков с внутренней неупорядоченной структурой на примере α- и κ-казеинов Мельникова Дарья Леонидовна

Короткий опис

Мельникова, Дарья Леонидовна.
Трансляционная подвижность и особенности надмолекулярной организации белков с внутренней неупорядоченной структурой на примере α- и κ- казеинов : диссертация ... кандидата физико-математических наук : 01.04.07 / Мельникова Дарья Леонидовна; [Место защиты: Казан. (Приволж.) федер. ун-т]. - Казань, 2019. - 167 с. : ил.
Оглавление диссертациикандидат наук Мельникова Дарья Леонидовна
Введение
Глава 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1.1 Общая характеристика биополимеров - белков с естественной неупорядоченной структурой
1.2 Особенности структуры и функций белков с естественной неупорядоченной структурой
1.3 Межмолекулярные взаимодействия белков с естественной неупорядоченной структурой
1.4 Методы исследования белков с внутренней неупорядоченной структурой
1.5 ЯМР исследования белковых макромолекул
1.6 Теория самодиффузии макромолекул в растворах полимеров
1.7 Учет характеристик локальной подвижности полимерной цепи
1.8 Универсальная концентрационная зависимость коэффициентов самодиффузии линейных гибкоцепных макромолекул
1.9 Универсальная концентрационная зависимость коэффициентов самодиффузии макромолекул с конформацией, отличающейся от гауссовой
1.10 Трансляционная динамика макромолекул, образующих трехмерную сетку
1.11 Постановка задачи диссертации
Глава 2. МЕТОДЫ И ОБЪКТЫ ИССЛЕДОВАНИЯ
2.1 Базовые положения
2.2 Основные принципы измерения КСД молекул методом ЯМР с импульсным градиентом магнитного поля
2.3 Импульсные последовательности для измерения коэффициентов самодиффузии
2.4 Регистрация зависимости формы диффузионного затухания от времени диффузии. Основные принципы учета вкладов, связанных с ядерной магнитной релаксацией
2.5 Регистрация формы диффузионного затухания для отдельных компонент системы в спектрально разрешенном режиме
2.6 Характеристики используемой аппаратуры и условия измерений
2.6.1 Погрешности в экспериментах
2.7 Объекты исследования
2.8 Методика приготовления образцов
Глава 3. САМОДИФФУЗИЯ МОЛЕКУЛ БЕЛКОВ С ВНУТРЕННЕЙ НЕУПОРЯДОЧЕННОСТЬЮ В ВОДНЫХ РАСТВОРАХ НА ПРИМЕРЕ а-КАЗЕИНА
3.1 Форма диффузионного затухания в растворах белков
3.2 Зависимость средних коэффициентов самодиффузии молекул а-казеина от его концентрации в водном растворе и учет локальной подвижности молекул белка
3.3 Сравнение концентрационной зависимости коэффициента самодиффузии для молекул а-казеина с установленными обобщенными концентрационными зависимостями для глобулярных белков и гибкоцепных полимеров
3.4 Влияние времени хранения образца на форму диффузионного затухания
3.5 Обратимость наблюдаемых изменений формы диффузионных затуханий от времени хранения и концентрации
3.6 Зависимость формы диффузионных затуханий от времени диффузии. Признаки образования геля
3.6.1 Зависимость формы диффузионных затуханий от времени диффузии. Признаки молекулярного обмена
3.7 Заключение к главе
Глава 4. ОСОБЕННОСТИ ТРАНСЛЯЦИОННОЙ ПОДВИЖНОСТИ В РАСТВОРАХ а-КАЗЕИНА В ПРИСУТСВИИ АГЕНТА ТСЕР
4.1 Влияние агента ТСЕР на трансляционную подвижность молекул белка в разбавленных растворах а-казеина
4.2 Анализ диффузионных затуханий в спектрально разрешенном режиме в концентрированных растворах а-казеина в присутствии ТСЕР
4.2.1 Трансляционная подвижность молекулярных компонент системы в концентрированном растворе а-казеина в режиме спектрального разрешения на ядрах 31Р
4.3 Особенности влияния агента ТСЕР на формирование надмолекулярной структуры в концентрированных растворах а-казеина
4.4 Заключение к главе
Глава 5. ОСОБЕННОСТИ ТРАНСЛЯЦИОННОЙ ПОДВИЖНОСТИ В РАСТВОРАХ к-казеина
5.1 Форма диффузионных затуханий молекул к-казеина в разбавленных растворах
5.2 Особенности изменений формы диффузионных затуханий в зависимости от времени диффузии в разбавленных и концентрированных растворах
5.3 Влияние ТСЕР на трансляционную подвижность и надмолекулярную структуру в растворах к-казеина
5.4 Зависимость средних коэффициентов самодиффузии молекул к-казеина от концентрации белка в растворе
5.5 Заключение к главе
ВЫВОДЫ
Благодарности
Список публикаций автора по теме диссертации
Список цитируемой литературы
4
Введение