Компьютерное моделирование пространственной структуры цитохрома Р450 2В4 и прогноз изменения свойств поверхности Сеченых, Анна Андреевна

brief description

Сеченых,АннаАндреевна.КомпьютерноемоделированиепространственнойструктурыцитохромаР4502В4ипрогнозизменениясвойствповерхности: диссертация ... кандидата биологических наук : 03.00.04. - Москва, 2005. - 97 с. : ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
рукописиСеченыхАннаАндреевнаКОМПЬЮТЕРНОЕМОДЕЛИРОВАНИЕПРОСТРАНСТВЕННОЙСТРУКТУРЫЦИТОХРОМАР4502В4ИПРОГНОЗИЗМЕНЕНИЯСВОЙСТВПОВЕРХНОСТИ03.00.04

стр. 2
СОДЕРЖАНИЕ Список сокращений ВВЕДЕНИЕ ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ Краткая характеристикацитохромовР450 СуперсемействоцитохромовР450 ПодсемействоцитохромовР45 О 2В Анализ кристаллическойструктурыCYP2B4 «Открыгая» конформация CYP2B4 «Закрытая» конформация CYP2B4 Предпосылки кмоделированиюпространственнойструктурыР450 МетодымоделированияцитохромовР450 Цели и задачи молекулярногомоделированияР450 Основные этапы...

стр. 2
PDBМоделированиепространственнойструктурыцитохромаCYP2B4 Уточнение модели CYP2B4 Верификация модели CYP2B4Моделированиеизвестных мутантов CYP2B4Моделированиеновых мутаций CYP2B4 РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ Анализ существующих кристаллическихструктурCYP2B4Компьютерноемоделированиетрехмернойструктуры

Оглавление диссертациикандидат биологических наук Сеченых, Анна Андреевна
Список сокращений.
ВВЕДЕНИЕ.
ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.
Краткая характеристика цитохромов Р450.
Суперсемейство цитохромов Р450.
Подсемейство цитохромов Р450 2В.
Анализ кристаллической структуры СУР2В4.
Открытая» конформация СУР2В4.
Закрытая» конформация СУР2В4.
Предпосылки к моделированию пространственной структуры Р450.
Методы моделирования цитохромов Р450.
Цели и задачи молекулярного моделирования Р450.
Основные этапы моделирования пространственной структуры белка по гомологии.
Проблемы моделирования Р450 по гомологии.
Критерии оценки успешного моделирования Р450 по гомологии.
Методы проверки правильности моделей Р450.
ОБЪЕКТЫ И МЕТОДЫ.
Аппаратное обеспечение. .Т.
Программное обеспечение.
Информационные ресурсы.
Сравнение кристаллических структур СУР2В4 из РЭВ.
Моделирование пространственной структуры цитохрома СУР2В4.
Уточнение модели СУР2В4.
Верификация модели СУР2В4.
Моделирование известных мутантов СУР2В4.
Моделирование новых мутаций СУР2В4.
РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ.
Анализ существующих кристаллических структур СУР2В4.
Компьютерное моделирование трехмерной структуры СУР2В4 по гомологии.
Моделирование трехмерной структуры СУР2В4 по гомологии.
Верификация модели трехмерной структуры СУР2В4.
Сравнение модели с «закрытой» конформацией СУР2В4.
Сравнительное моделирование пространственных структур микросомальных цитохромов Р450.
Модели трехмерной структуры СУР2В4.
Модели трехмерной структуры представителей СУР2С.
Модели трехмерной структуры СУРЗА4.
Выявление общих закономерностей среди моделей.
Оценка возможных перспектив по моделированию цитохромов Р450 по существующим прототипам.
Прогнозирование изменения сродства СУР2В4 к цитохром Р450 редуктазе при точеном мутагенезе.