Структурная и функциональная организация адсорбционного аппарата Т5-подобных бактериофагов DT57C и DT571/2 Голомидова Алла Константиновна

brief description

Голомидова,АллаКонстантиновна.СтруктурнаяифункциональнаяорганизацияадсорбционногоаппаратаТ5-подобныхбактериофаговDT57CиDT571/2: диссертация ... кандидата биологических наук : 03.02.03 /ГоломидоваАллаКонстантиновна; [Место защиты: Ин-т микробиологии им. С.Н. Виноградского РАН]. - Москва, 2019. - 125 с. : ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
биотехнологии» Российской академии наук» На правах рукописиАллаКонстантиновнаГоломидоваСТРУКТУРНАЯИФУНКЦИОНАЛЬНАЯОРГАНИЗАЦИЯАДСОРБЦИОННОГОАППАРАТАТ5-ПОДОБНЫХБАКТЕРИОФАГОВDT57CИ DT571/2 Специальность 03.02.03 микробиология ДИССЕРТАЦИЯ на соискание учёной степени кандидата биологических наук

стр. 4
обсуждение.........68 6.1 Выделение и характеристика колифаговDT57Cи DT57-1/2.....68 6.2 Полные геномные последовательностибактериофаговDT57Cи DT571/2..........72 6.2.1Организация геновадсорбционногоаппаратабактериофаговDT57Cи DT571/2......74 6.3 Генетический ифункциональныйанализадсорбционногоаппарата.....75 6.3.1Определение конечного рецептора для...

стр. 74
высоко гомологичными с соответствующими продуктами генов фага T5. 74 Рис.17. Выравнивание полных последовательностей геномовбактериофаговDT57C, DT571/2 и T5 с помощью программы Mauve (Version 2.4.0). 6.2.1ОрганизациягеновадсорбционногоаппаратабактериофаговDT57Cи DT571/2 Сравнение двух фаговых

Оглавление диссертациикандидат наук Голомидова Алла Константиновна
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
ВВЕДЕНИЕ
Актуальность работы
Цель и задачи работы
Научная новизна и значимость работы
Практическая значимость
Личное участие автора в получении результатов
Апробация работы
ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
Глава 1. Общие вопросы биологии бактериофагов
1.1 Распространение бактериофагов в природе
1.2 Историческая справка
1.3 Разнообразие и значение вирусов прокариот
1.4 Жизненный циклы бактериофагов
1.5 Адаптация бактерий к бактериофагам
Глава 2. Антифаговая защита бактерий
2.1 Блокирование фаговой адсорбции
2.2 Предотвращение инъекции ДНК фагов
2.3 Деградация фаговых нуклеиновых кислот
2.4 Абортивная инфекция
Глава 3. Механизмы преодоления фагами устойчивости бактерий
3.1 Доступ к хозяйским рецепторам
3.2 Преодоление систем рестрикции-модификации (Я-М)
3.3 Уклонение от СМБРЯ-СаБ систем
3.4 Преодоление механизмов абортивной инфекции
Глава 4. Т5 подобные бактериофаги
4.1 Структура вириона
4.2 Механизм адсорбции фага Т5
ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ
Глава 5. Материалы и методы исследования
Отбор образцов
Выделение бактериофагов и колиформных бактерий
Фаговые и бактериальные штаммы и их культивирование
Определение хозяйского спектра бактериофагов
Экстракция ДНК и анализ полиморфизма длин
рестрикционных фрагментов (ПДРФ)
Идентификация бактериофагов
Секвенирование ДНК
Электронная микроскопия
Выделение и анализ ЛПС
ЯМР анализ О-полисахаридов
Определение кривых адсорбции бактериофагов
Олигонуклеотидные праймеры и плазмидные конструкции
Направленный мутагенез фагов посредством
рекомбинации с плазмидами
Отбор устойчивых к бактериофагам бактериальных клонов
Получение нативной формы белка, ген ltfB
Глава 6. Результаты и обсуждение
6.1 Выделение и характеристика колифагов DT57C и DT57-1/2
6.2 Полные геномные последовательности бактериофагов
DT57C и DT571/2
6.2.1 Организация генов адсорбционного аппарата бактериофагов DT57C и DT571/2
6.3 Генетический и функциональный анализ
адсорбционного аппарата
6.3.1 Определение конечного рецептора для исследуемых бактериофагов
6.3.2 Организация генов латеральных хвостовых
фибрилл (LTF)
6.3.3 Роль гена ltfA в детерминации хозяйской специфичности бактериофагов DT57С и DT571/2
6.3.4 LtfA мутанты
6.3.5 Функция белка LtfB
6.4 Анализ ЛПС штамма E. coli HS3-104, 4S и HS1/2
6.5 Высокий уровень генетической изменчивости локуса ltf
6.6 Модель стратегии адсорбции Т5-подобных бактериофагов
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ВЫВОДЫ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
ПРИЛОЖЕНИЕ
ВВЕДЕНИЕ