Антибиотикорезистентность лактобацилл: генетические детерминанты и возможные пути их распространения в кишечном микробиоме Анисимова Елизавета Алексеевна

Краткое описание

Анисимова,ЕлизаветаАлексеевна.Антибиотикорезистентностьлактобацилл:генетическиедетерминантыивозможныепутиихраспространениявкишечноммикробиоме: автореферат дис. ... кандидата биологических наук : 03.02.03 /АнисимоваЕлизаветаАлексеевна; [Место защиты: Казанский (Приволжский) федеральный университет]. - Казань, 2021. - 25 с.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
На правах рукописиАНИСИМОВАЕЛИЗАВЕТААЛЕКСЕЕВНААНТИБИОТИКОРЕЗИСТЕНТНОСТЬЛАКТОБАЦИЛЛ:ГЕНЕТИЧЕСКИЕДЕТЕРМИНАНТЫИВОЗМОЖНЫЕПУТИИХРАСПРОСТРАНЕНИЯВКИШЕЧНОММИКРОБИОМЕ03.02.03 Микробиология Автореферат диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук Казань - 2021 Работа

стр. 3
Комменсальные бактерии гастроинтестинальной микробиоты человека и животных также являются резервуаром и источникомраспространениягенетическихдетерминантантибиотикорезистентности[Klein et al., 2000; Snydman, 2008]. Особыми возможностями дляраспространенияантибиотикорезистентностиобладают повсеместно встречающиеся, убиквитарные бактерии, такие каклактобациллы.Лактобациллышироко распространены в природных экосистемах. У человека они...

стр. 21
действия. В плазмидной и хромосомной ДНКлактобациллобнаружены потенциально мобильные гены устойчивости к тетрациклину и эритромицину. Среди 72 исследованных штаммовлактобациллединственным потенциальным источникомраспространениягенетическихдетерминантустойчивостиантибиотикорезистентностиявились

Оглавление диссертациикандидат наук Анисимова Елизавета Алексеевна
СОДЕРЖАНИЕ
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
ВВЕДЕНИЕ
Актуальность темы исследования
Цели и задачи исследования
Научная новизна полученных результатов
Методология и методы исследования
Достоверность результатов
Теоретическая и практическая значимость работы
Основные положения, выносимые на защиту
Апробация работы и публикации
Место выполнения работы и личный вклад автора
Связь работы с научными программами
Публикация результатов исследования
Объем и структура диссертации
Благодарности
1 ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1. 1 Бактерии рода Lactobacillus
1.2 Природа антибиотикорезистентности и пути ее распространения
1.3 Устойчивость лактобацилл к антибиотикам
1.4 Методы определения устойчивости к антибиотикам у МКБ 41 ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ
2 МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
2.1 Микроорганизмы и условия культивирования
2.2 Микробиологические методы
2.2.1 Видовая идентификация лактобацилл по спектру утилизируемых сахаров
2.2.2 Диско-диффузионный метод оценки антибиотикорезистентности
2.2.3 Определение минимальной подавляющей концентрации (МПК) антибиотиков
2.2.4 Метод градиентного агара
2.2.5 Определение антагонистической активности лактобацилл методом агаровых блоков
2.2.6 Совместное культивирование энтеробактерий и лактобацилл в условиях, имитирующих содержимое кишечника
2.2.6 Оценка транспорта генов между бактериями методом «Конъюгации на мембране»
(«Filter mating»)
2.3 Молекулярно-биологические методы 53 2.3.1 Видовая идентификация лактобацилл методом MALDI-TOF
2.3.1 Выделение геномной ДНК
2.3.2 Выделение плазмидной ДНК
2.3.3 Выделение тотальной ДНК из фекалий мышей
2.3.4 Выделение бактериальной РНК
2.3.5 Полимеразная цепная реакция с обратной транкрипцией (ОТ-ПЦР)
2.3.6 Полимеразная цепная реакция (ПЦР)
2.3.7 ПЦР в реальном времени
2.3.8 Электрофорез ДНК
2.3.9 Очистка ДНК из агарозного геля
2.3.10 Секвенирование ДНК и анализ нуклеотидных последовательностей генов антибиотикорезтентности
2.3.11 Трансформация электрокомпетентных клеток
2.4 Передача генов антибиотикорезистентности от лактобацилл in vivo 61 2.4.1. Лабораторные животные
2.4.1. Определение чувствительности к антибиотикам у культивируемой части микробного сообщества толстой кишки исследуемых мышей
2.4.2. Анализ генотипа антибиотикорезистентности микробного сообщества толстой кишки мышей
2.5 Статистическая обработка результатов
3 РЕЗУЛЬТАТЫ
3.1 Видовая идентификация лактобацилл
3.2 Характеристика устойчивости лактобацилл к антибиотикам
3.3 Генетические детерминанты антибиотикорезистентности лактобацилл
3.4 Мобильность генов антибиотикорезистентности лактобацилл
3.4.1 Подбор доноров и реципиентов генов антибиотикорезистентности
3.4.2 Передача генов антибиотикорезистентности от лактобацилл к условно-патогенным микроорганизмам in vitro 93 3.4.4 Передача генов антибиотикорезистентности от лактобацилл in vivo
4 ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ
4.1 Видовая идентификация лактобацилл
4.2 Характеристика антибиотикорезистентности лактобацилл
3
4.3 Горизонтальный транспорт генов устойчивости к антибиотикам от лактобацилл 114 ЗАКЛЮЧЕНИЕ