Fusarium как ключевой таксон в микобиоте корней картофеля Акосах Йав Абайе

Краткое описание

Акосах,ЙавАбайе.Fusariumкакключевойтаксонвмикобиотекорнейкартофеля: диссертация ... кандидата биологических наук : 03.02.03 /АкосахЙавАбайе; [Место защиты: ФГАОУ ВО «Казанский (Приволжский) федеральный университет»]. - Казань, 2021. - 178 с. : ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
«КАЗАНСКИЙ (ПРИВОЛЖСКИЙ) ФЕДЕРАЛЬНЫЙ УНИВЕРСИТЕТ» На правах рукописиАКОСАХЙАВАБАЙЕFUSARIUMКАККЛЮЧЕВОЙТАКСОНВМИКОБИОТЕКОРНЕЙКАРТОФЕЛЯ03.02.03

стр. 2
характеристика и роль в патогенезе .... 30 1.3.1 Общая характеристика и таксономия микромицетов родаFusarium 30 1.3.2 Микромицеты родаFusarium возбудители болезней различных растений .. 32 1.3.3 Микромицеты родаFusarium возбудители заболеванийкартофеля..... 35 1.3.4Fusariumкакклинически значимый патоген человека .. 38 1.3.5 Микромицеты родаFusariumкакпродуценты токсинов ... 40...

стр. 77
понимание влияния различных факторов на формированиемикобиотыкартофеля. Для выяснения влияния стадии вегетации, сезонных изменений и севооборота намикобиотукорнейкартофелямы провели сравнительный анализ образцовкорнейкартофелясорта Жуковский ранний, культивируемого на серой лесной почве, на стадии

Оглавление диссертациикандидат наук Акосах Йав Абайе
ВВЕДЕНИЕ
1 ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1.1 Микробное сообщество растений: роль в физиологии растений
1.1.1 Общая характеристика и функциональный потенциал микробиоты растений
1.1.2 Разнообразие микробиоты растений
1.1.3 Факторы, влияющие на микробиоту растений
1.1.4 Микробиота корней картофеля
1.2 Картофель как важная сельскохозяйственная культура
1.2.1 Производство картофеля
1.2.2 Потери урожая картофеля от инфекционных заболеваний
1.3 Микромицеты рода Fusarium: характеристика и роль в патогенезе
1.3.1 Общая характеристика и таксономия микромицетов рода Fusarium
1.3.2 Микромицеты рода Fusarium - возбудители болезней различных растений
1.3.3 Микромицеты рода Fusarium - возбудители заболеваний картофеля
1.3.4 Fusarium как клинически значимый патоген человека
1.3.5 Микромицеты рода Fusarium как продуценты токсинов
1.3.6 Патогеномика микромицетов рода Fusarium
1.3.7 Молекулярные механизмы взаимодействия Fusarium spp. с растением-хозяина
1.4 Методы контроля фитопатогенных микромицетов рода Fusarium
1.4.1 Химический контроль фузариоза
1.4.2 Альтернативные стратегии защиты растений картофеля от фузариоза
Заключение
ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ
2 МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
2.1 База для проведения полевых экспериментов
2.2 Метагеномный анализ грибной микробиоты почвы и корней картофеля сорта Жуковский ранний
2.2.1 Культивирование растения картофеля
2.2.2 Отбор проб почвы и корней картофеля для метагеномных исследований
2.2.3 Выделение, амплификация и секвенирование ДНК
2.2.4 Анализ данных секвенирования
2.2.5 Анализ корового компонента грибных сообществ
2.3 Выделение и культивирование микромицетов, хранение культур и получение суспензии конидий
2.3.1 Питательные среды и условия культивирования
2.3.2 Выделение микромицетов рода Fusarium из ризосферы картофеля
2.3.3 Выделение микромицетов рода Fusarium из корневой шейки картофеля
2.3.4 Выделение микромицетов рода Fusarium из клубней картофеля
2.3.5 Молекулярно-генетическая идентификация изолятов
2.3.5.1 Выделение ДНК
2.3.5.2 Полимеразная Цепная Реакция и секвенирование ампликонов
2.3.6 Получение спор грибов рода Fusarium
2.4 Взаимодействие изолятов Fusarium с растением картофеля
2.4.1 Заражение условно-здоровых клубней картофеля
2.4.2 Заражение асептических проростков растений картофеля
2.4.3 Исследование экспрессии генов растений картофеля в ответ на инфицирование изолятами Fusarium
2.4.4 Количественное определение уровня экспресии матричной РНК (мРНК) РК-генов картофеля
2.5 Влияние фунгицидов на рост штаммов F. oxysporum и экспрессию генов
2.5.1 Исследование влияние фунгицидов на рост изолятов
2.5.2 Выделение тотальной РНК, синтез кДНК и анализ экспрессии генов
CYP51A и НК1
2.6 Статистическая обработка данных
3 РЕЗУЛЬТАТЫ
3.1 Сравнительный анализ грибной микробиоты корней картофеля сорта Жуковский ранний
3.1.1 Альфа- и бета-разнообразие грибных сообществ разных компартментов корней
3.1.2 Структура микобиоты ризосферы и ризопланы картофеля сорта Жуковский
ранний
3.2 Влияние различных факторов на структуру микобиоты корней картофеля сорта Жуковский ранний
3.2.1 Условия проведения вегетационного опыта: изменение сезонных и погодных параметров
3.2.2 Биоинформационный анализ результатов секвенирования
3.2.3 Анализ альфа- и бета-разнообразия грибных сообществ
3.2.4 Таксономический состав грибных сообществ различных компартментов корней картофеля и свободной почвы
3.2.4.1 Сравнительный анализ грибных сообществ на уровне филумов и классов
3.2.4.2 Сравнительный анализ грибных сообществ на уровне родов и видов
3.2.5 Ядро (Core) микобиоты корней картофеля сорта Жуковский ранний
3.2.6 Анализ функциональных групп грибных сообществ
3.2.7 Влияние севооборота на изменение численности популяции Fusarium spp. в грибных сообществах корней картофеля
3.3 Выделение изолятов Fusarium spp. и анализ их патогенности в отношении клубней картофеля
3.3.1 Выделение и идентификация изолятов Fusarium spp
3.3.2 Анализ восприимчивости клубней различных сортов картофеля к изолятам Fusarium spp
3.3.2.1 Восприимчивость клубней картофеля к изолятам Fusarium, выделенным из корневой шейки
3.3.2.2 Восприимчивость клубней картофеля к изолятам Fusarium, выделенным из ризосферы
3.3.2.3 Восприимчивость клубней к изолятам, выделенным из больных клубней
3.3.2.4 Восприимчивость клубней к изолятам, выделенным из латентно-инфицированных клубней
3.4 Влияние фунгицидов на рост F. oxysporum и экспрессию генов
3.4.1 Влияние флудиоксонила и пенконазола на рост штаммов F. oxysporum
3.4.2 Влияние фунгицидов на экспрессию генов CYP51A и HK1 Fusarium oxysporum
3.5 Экспрессия гипотетических генов ответа в растениях картофеля при инфекции
Fusarium spp
ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
ПРИЛОЖЕНИЕ