Генотипирование штаммов возбудителя гистоплазмоза Шпак Иван Михайлович

Краткое описание

Шпак,ИванМихайлович.Генотипированиештаммоввозбудителягистоплазмоза: диссертация ... кандидата медицинских наук : 03.02.03 /ШпакИванМихайлович; [Место защиты: ФКУЗ «Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб» Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека]. - Саратов, 2019. - 111 с. : ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
рукописиШПАКИванМихайловичГЕНОТИПИРОВАНИЕШТАММОВВОЗБУДИТЕЛЯГИСТОПЛАЗМОЗА03.02.03 микробиология Диссертация на соискание ученой степени кандидата медицинских

стр. 2
использованные в работе 2.8 Статистическая обработка результатов ГЛАВА 3.ГЕНОТИПИРОВАНИЕШТАММОВHISTOPLASMA CAPSULATUM НА ОСНОВЕ АМПЛИФИКАЦИИ ДНК 3.1 Типированиештаммоввозбудителягистоплазмозаметодом ПЦР со случайной амплификацией полиморфной ДНК 3.2 Генетическое типированиештаммовHistoplasma capsulatum

стр. 10
Волгоградский научно-исследовательский противочумный институт Роспотребнадзора для внутривидовой дифференциацииштаммоввозбудителягистоплазмозаи паспортизации коллекционныхштаммовH. capsulatum (акт о внедрении от 23.12.16). Материалы исследования вошли в методические рекомендации «Алгоритмгенотипированиямикромицетов

Оглавление диссертациикандидат наук Шпак Иван Михайлович
СОДЕРЖАНИЕ Стр.
ВВЕДЕНИЕ
ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1.1 История изучения и характеристика возбудителя гистоплазмоза
1.2 Распространение Histoplasma capsulatum в мире
1.3 Характеристика генома и отдельных генов Histoplasma capsulatum
1.4 Методы генотипирования и филогенетическая классификация 26 микромицетов Histoplasma capsulatum
ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
2.1 Штаммы микроорганизмов, питательные среды, условия 33 культивирования
2.2 Подготовка проб для ПЦР
2.3 Выделение ДНК
2.4 Полимеразная цепная реакция
2.5 Детекция продуктов амплификации и определение размеров 37 фрагментов ДНК
2.6 Секвенирование продуктов амплификации
2.7 Программные продукты, использованные в работе
2.8 Статистическая обработка результатов 39 ГЛАВА 3. ГЕНОТИПИРОВАНИЕ ШТАММОВ HISTOPLASMA 41 CAPSULATUM НА ОСНОВЕ АМПЛИФИКАЦИИ ДНК
3.1 Типирование штаммов возбудителя гистоплазмоза методом ПЦР 41 со случайной амплификацией полиморфной ДНК
3.2 Генетическое типирование штаммов Histoplasma capsulatum 50 методом амплификации дифференцирующих фрагментов ДНК (DFR) ГЛАВА 4. ГЕНЕТИЧЕСКОЕ ТИПИРОВАНИЕ ШТАММОВ 59 HISTOPLASMA CAPSULATUM С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ СЕКВЕНИРОВАНИЯ
4.1 Мультилокусное сиквенс-типирование штаммов Histoplasma
capsulatum
4.2 Типирование штаммов Histoplasma capsulatum методом
секвенирования фрагмента гена ms8
ГЛАВА 5. СРАВНЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ РАЗЛИЧНЫХ МЕТОДОВ 75 ГЕНОТИПИРОВАНИЯ КОЛЛЕКЦИОННЫХ ШТАММОВ
HISTOPLASMA CAPSULATUM
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ВЫВОДЫ
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
ПРИЛОЖЕНИЕ А
ВВЕДЕНИЕ