Характеристика Vibrio cholerae nonO1/nonO139, циркулирующих в Ростовской области и Республике Калмыкия Архангельская Ирина Викторовна

Краткое описание

Архангельская,ИринаВикторовна.ХарактеристикаVibriocholeraenonO1/nonO139,циркулирующихвРостовскойобластииРеспубликеКалмыкия: диссертация ... кандидата медицинских наук : 03.02.03 /АрхангельскаяИринаВикторовна; [Место защиты: ФКУЗ «Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб» Федеральной службы по надзорувсфере защиты прав потребителейиблагополучия человека]. - Саратов, 2019. - 171 с. : ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
ФЕДЕРАЛЬНОЙ СЛУЖБЫ ПО НАДЗОРУ В СФЕРЕ ЗАЩИТЫ ПРАВ ПОТРЕБИТЕЛЕЙ И БЛАГОПОЛУЧИЯ ЧЕЛОВЕКА На правах рукописиАРХАНГЕЛЬСКАЯИРИНАВИКТОРОВНАХАРАКТЕРИСТИКАVibriocholeraenonO1/nonО139,ЦИРКУЛИРУЮЩИХВРОСТОВСКОЙОБЛАСТИИРЕСПУБЛИКЕКАЛМЫКИЯпо специальности 03.02.03 микробиология ДИССЕРТАЦИЯ на соискание

стр. 9
штаммов V.choleraenonO1/nonO139,циркулирующихвРостовскойобластииреспубликеКалмыкия. Задачи исследования: 1. Анализ динамики выделения от людей V.choleraenonO1/nonO139 на территорияхРостовскойобластииреспубликиКалмыкия, изучение фенотипических свойств клинических штаммов и изолированных

стр. 54
ГЛАВА 3 РАСПРОСТРАНЕНИЕ, ЭТИОЛОГИЧЕСКАЯ ЗНАЧИМОСТЬ И ФЕНОТИПИЧЕСКАЯХАРАКТЕРИСТИКАХОЛЕРНЫХ ВИБРИОНОВ неО1/неО139 СЕРОГРУПП 3.1 Анализ заболеваемости ОКИ, вызванными НАГ-вибрионами вРостовскойобластииреспубликеКалмыкияВРостовскойобласти(РО) в 1960-70-е годы заболеваемость, вызванная НАГ-вибрионами,

Оглавление диссертациикандидат наук Архангельская Ирина Викторовна
ВВЕДЕНИЕ
ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1.1 Роль У.ско1вгав поп01/поп0139 в этиологии ОКИ
1.2 Источники и пути передачи инфекции
1.3 Серогруппы У.ско1егае поп01/поп0139
1.4 Факторы патогенности
1.5 Антибиотикорезистентность У.сЬоЫтав поп01/поп0139
1.6 Гетерогенность популяций и генетический обмен
1.7 Происхождение НАГ-вибрионов
ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
2.1 Штаммы холерных вибрионов неО1/неО139 серогрупп
2.2 Питательные среды и условия культивирования
2.3 Методы выделения и идентификации НАГ-вибрионов
2.4 Метод серотипирования
2.5 Метод определения чувствительности к антибиотикам
2.6 Метод определения нейраминидазной активности
2.7 Метод определения агглютинации эритроцитов
2.8 Метод определения чувствительности/устойчивости к Вгс1у-о81вИит discoideum
2.9 Определение антибактериальной активности
2.10 Молекулярно-биологические методы
2.10.1 Детекция генов с помощью ПЦР
2.10.2 Секвенирование ДНК
2.10.3 Биоинформационый анализ
ГЛАВА 3 РАСПРОСТРАНЕНИЕ, ЭТИОЛОГИЧЕСКАЯ ЗНАЧИМОСТЬ
И ФЕНОТИПИЧЕСКАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА ХОЛЕРНЫХ
ВИБРИОНОВ неО1/неО139 СЕРОГРУПП
3.1 Анализ заболеваемости ОКИ, вызванными холерными вибрионами неО1/неО139 серогрупп в Ростовской области и республике Калмыкия
3.2 Результаты мониторинговых исследований проб воды и гид-робионтов Таганрогского залива на наличие холерных вибрионов
3.3 Сравнительный анализ фенотипических свойств представителей разных популяций V.cholerae nonO1/non0139
3.4 Определение чувствительности штаммов V.cholerae
nonO 1/nonO 139 к антибиотикам
ГЛАВА 4 ПЦР-ГЕНОТИПИРОВАНИЕ ХОЛЕРНЫХ ВИБРИОНОВ не01/не0139 СЕРОГРУПП
4.1 ПЦР-детекция генетических детерминант факторов патоген-ности и персистенции
4.2 Кластерный анализ распределения генов у штаммов холерных вибрионов неО1/неО139 серогрупп
ГЛАВА 5 ИЗУЧЕНИЕ СТРУКТУРЫ ГЕНОМОВ ХОЛЕРНЫХ ВИБРИОНОВ не01/не0139 СЕРОГРУПП
5.1 Полногеномное секвенирование и биоинформационный анализ полученных последовательностей ДНК
5.2 Сравнительный биоинформационный анализ генов наиболее значимых факторов патогенности/персистенции и их продуктов
5.2.1 Структура и изменчивость MARTX и RtxC
5.2.2 Структура и изменчивость генов и белков cholix-токсина
5.2.3 Структура и изменчивость протеаз НАГ-вибрионов
5.2.4 Структура и изменчивость Сef (CHO cell elongating factor)
5.2.5 Структура и изменчивость гемолизина HlyA
5.2.6 Структура и изменчивость нейраминидазы (NanH)
5.2.7 Структура и изменчивость белков наружной мембраны
5.2.8 Структура и изменчивость субъединиц пилей MSHA
5.2.9 Структура и изменчивость регуляторных белков ToxR и
HapR
5.2.10 Контакт-зависимые системы секреции третьего и шестого типов (T3SS и T6SS)
5.2.11 Штамм, содержащий профаг preCTX и остров VPI
5.3 Мозаичная структура и пластичность генома НАГ-
вибрионов
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ВЫВОДЫ