Изотермические и управляемые сменой температур реакции амплификации и высокочувствительной детекции специфичных последовательностей нуклеиновых кислот в реальном времени Чемерис, Дмитрий Алексеевич

Краткое описание

Чемерис,ДмитрийАлексеевич.Изотермическиеиуправляемыесменойтемпературреакцииамплификацииивысокочувствительнойдетекцииспецифичныхпоследовательностейнуклеиновыхкислотвреальномвремени: диссертация ... кандидата биологических наук : 03.00.03. - Уфа, 2006. - 158 с. : ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
61:07-3/222 РОССИЙСКАЯ АКАДЕМИЯ НАУК УФИМСКИЙ НАУЧНЫЙ ЦЕНТР ИНСТИТУТ БИОХИМИИ И ГЕНЕТИКИ На правах рукописиЧЕМЕРИСДмитрийАлексеевичИЗОТЕРМИЧЕСКИЕИУПРАВЛЯЕМЫЕСМЕПОЙТЕМПЕРАТУРРЕАКЦИИАМПЛИФИКАЦИИИ ВЫСОКОЧУВСТВИТЕЛЬПОИДЕТЕКЦИИСПЕЦИФИЧПЫХ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬПОСТЕИ ПУКЛЕИПОВЫХКИСЛОТВ РЕАЛЬПОМ ВРЕМЕПИ

стр. 4
дитиотрейтол НЭГ - нолиэтиленгликоль Трис - трис(гидроксиэтил)аминометан ЭДТА - этилендиаминтетрауксуснаякислотаРеакцииамплификацииивысокочувствительнойдетекции: ГЦР - гибридизационная цепнаяреакцияГЦР-РВ - гибридизационная цепнаяреакциявреальномвремениЛЦР - лигазная цепнаяреакцияЛЦР-РВ - лигазная цепнаяреакциявреальномвремениПЦР - полимеразная цепнаяреакцияПЦР-РВ -...

стр. 15
рост цепей ДНК, и которая также пока не востребована. Большинство этихреакцийамплификацииивысокочувствительнойдетекциинуклеиновыхкислотявляютсяизотермическимии протекают при постояннойтемпературе, в отличие отуправляемыхсменойтемнератур ЛЦР и НЦР (в ее классическом варианте без геликазы). Новышенный интерес кизотермическимреакциямотчасти вызван тем, что для их проведения не требуется специальный...

Оглавление диссертациикандидат биологических наук Чемерис, Дмитрий Алексеевич
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ И УСЛОВНЫХ ОБОЗНАЧЕНИЙ.
ВВЕДЕНИЕ.
ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1.1. Методы амплификации и высокочувствительной детекции специфичных фрагментов ДНК и РНК.
1.2. Полимеразная цепная реакция в реальном времени - ПЦР-РВ
1.3. Лигазная цепная реакция - ЛЦР.
1.4. Амплификация смещением цепи - Strand Displacement Amplification (SDA).
1.5. Амплификация по типу катящегося кольца или рамификация
1.6. Технология циклирующей пробы.
1.7. Гибридизационная цепная реакция - ГЦР.
ГЛАВА 2. ОБЪЕКТЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЙ
2.1. Объекты исследований.
2.2. Фосфорилирование олигонуклеотидов.
2.3. Выделение и очистка нуклеиновых кислот.
2.4. Получение кДНК.
2.5. Полимеразная цепная реакция.
2.6. Полимеразная цепная реакция в реальном времени.
2.7. Лигазная цепная реакция в реальном времени с красителем SYBR Green 1.
2.8. Лигазная цепная реакция, основанная на FRET-эффекте, в режиме реального времени.
2.9. Проведение амплификации по типу катящегося кольца с дезоксирибозимным расщеплением химерной пробы в реальном времени.
2.10. Рамификация в реальном времени.
2.11. Гибридизационная цепная реакция в реальном времени.
2.12. Электрофоретический анализ ампликонов и исходных молекул нуклеиновых кислот.
2.13. Компьютерный анализ нуклеотидных последовательностей
2.14. Использованные в работе обычные и модифицированные олигонуклеотиды.
2.15. Основные реактивы, использованные в работе.
2.16. Составы использованных стандартных растворов.
ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ
3.1. Полимеразная цепная реакция в реальном времени.
3.2. Лигазная цепная реакция в реальном времени.
3.3. Амплификация по типу катящегося кольца с дезоксирибозимным расщеплением химерной пробы.
3.4. Рамификация в реальном времени.
3.5. Гибридизационная цепная реакция в реальном времени.
3.6. Применимость реакций амплификации и высокочувствительной детекции в реальном времени для фундаментальных исследований и диагностических целей.