Изучение механизмов взаимодействия между промотором и энхансером у Drosophila melanogaster Костюченко, Маргарита Владимировна

Краткое описание

Костюченко,МаргаритаВладимировна.ИзучениемеханизмоввзаимодействиямеждупромоторомиэнхансеромуDrosophilamelanogaster: диссертация ... кандидата биологических наук : 03.00.26. - Москва, 2005. - 107 с. : ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
Gl'.OCb-^/se РОССИЙСКАЯ АКАДЕМИЯ НАУК ИНСТИТУТ БИОЛОГИИ ГЕНА На правах рукописи УДК 575.22:595.773.4.КОСТЮЧЕНКОМАРГАРИТАВЛАДИМИРОВНАИзучениемеханизмоввзаимодействиямеждупромоторомиэнхансеромуDrosophilamelanogasterДИССЕРТАЦИЯ на соискание ученой степени кандидата биологических наук (специальность

стр. 4
элементов вовзаимодействиимеждуэнхансеромипромоторомгена miniwhite 5.0БСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ 5.1.Изучениевзаимодействиямеждуэнхансеромипромоторомв модельной системе гена yellow 5.2.Изучениевзаимодействиямеждуэнхансеромипромоторомв модельной системе гена white 6. ВЫВОДЫ СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

стр. 27
Ira En Pri Рис.11. Схема модели действия инсуляторов. А, В - инсуляторы изолируютэнхансеротпромотора. С, D - инсуляторы не влияют навзаимодействиемеждуэнхансеромипромотором, Е - инсуляторы способствуютвзаимодействиюмеждуэнхансеромипромотором. Обозначены: Рг -промотор. En -энхансер. Ins

Оглавление диссертациикандидат биологических наук Костюченко, Маргарита Владимировна
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ.
1. ВВЕДЕНИЕ.
2. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.
2.1. Базовые элементы эукариотических промоторов.
2.2. Проксимальные и дистальные регуляторные элементы эукариотических генов.
2.2.1. CpG островки.
2.2.2. UAS/URS элементы.
2.2.3. Энхансеры.
2.3. Регуляторные элементы ДНК, влияющие на экспрессию гена.
2.3.1. Пограничные последовательности.
2.3.2. Регуляторные области локусов (LCR).
2.3.3. Инсуляторы.
8и(Ну)-инсулятор.
Инсуляторы регуляторной области Abd-B гена.
3 -глобиновый инсулятор.
2.4. Модели влияния инсуляторов на взаимодействие между энхансером и промотором.
2.5. Примеры взаимодействия энхансера и промотора на расстоянии.
2.5.1. Трансвекция.
2.5.2. Кооперативное действие цис-регуляторных элементов. GAGA-фактор.
2.5.3. Цис-регуляторные элементы в сложных локусах генов.
2.6. Исследование взаимодействия хроматина на больших дистанциях.
3. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ.
3.1. Генетические методы.
3.1.1. Линии и мутации Drosophila melanogaster, использованные в данной работе.
3.1.2. Трансформация эмбрионов Drosophila melanogaster и получение трансгенных линий.
3.1.3. Фенотипический анализ экспрессии генов yellow и miniwhite в трансгенных линиях.
3.1.4. Генетические скрещивания.
3.2. Программное обеспечение. Базы данных.
3.3. Биохимические методы.
3.3.1. Выделение ДНК из дрозофилы.
3.3.2. Саузерн-блотанализ.
3.3.3. Метод полимеразной цепной реакции (ПЦР).
3.3.4. Секвенирование плазмид и ПЦР продуктов.
3.3.5. Молекулярное клонирование.
3.3.6. Трансформация бактериальных клеток плазмидами.
3.3.7. Выделение ДНК плазмид методом щелочного лизиса.
3.3.8. Создание конструкций.
4. РЕЗУЛЬТАТЫ.
4.1.1. Анализ нуклеотидной последовательности 5' регуляторной области гена yellow Drosophila melanogaster.
4.1.2. Анализ цис-регуляторных элементов в области промотора гена yellow.
4.1.3. Роль регуляторных элементов промоторной области гена yellow в присутствии промотора гена white.
4.2.1. Анализ нуклеотидной последовательности 5' регуляторной области гена white Drosophila melanogaster.
4.2.2. Значение белка Zeste во взаимодействии между энхансером и промотором гена miniwhite Drosophila melanogaster зависит от расстояния между регуляторными элементами.
4.2.3. Роль белка Zeste во взаимодействии между энхансером и промотором гена miniwhite при делеции в регуляторной области гена.
4.2.4. Su(Hw) инсуляторов недостаточно для осуществления взаимодействия между энхансером и промотором гена miniwhite при делеции в регуляторной области гена.
4.2.4. Роль цис-регуляторных элементов во взаимодействии между энхансером и промотором гена miniwhite.
5.0БСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ.
5.1. Изучение взаимодействия между энхансером и промотором в модельной системе гена yellow.
5.2. Изучение взаимодействия между энхансером и промотором в модельной системе гена white.
6. ВЫВОДЫ.