Молекулярно-генетический анализ кластера генов, контролирующих устойчивость к метилвиологену и фототаксис цианобактерии Synechocystis sp. PCC 6803 Кирик, Инесса Анатольевна

Краткое описание

Кирик,ИнессаАнатольевна.Молекулярно-генетическийанализкластерагенов,контролирующихустойчивостькметилвиологенуифототаксисцианобактерииSynechocystissp.PCC6803: диссертация ... кандидата биологических наук : 03.00.15. - Москва, 2006. - 110 с. : ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
61:07-3/50 м о с к о в с к и й ГОСУДАРСТВЕННЫЙ УНИВЕРСИТЕТ ИМЕНИ М.В.ЛОМОНОСОВА БИОЛОГИЧЕСКИЙ ФАКУЛЬТЕТ На правах рукописиКирикИисссаАнатольевнаМолекулярно-генетическиианалнзкластерагенов,контролирующихустойчивостьк метилвнологену ифототаксисцианобактерннSynechocystissp. РСС6803Специальность

стр. 6
нарушенной функцией prqR для обнаруження новыхгенов, экспрессия которых контролнруетсягеномprqR. 4. Фуикциоиальный аиализгенов, входящих в одникластерсгеномprqR (sllO887, sllO886 и prqA), для установления их роли в регуляциифототаксисауцианобактерий. б ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫГенетическийкоигроль и молекулириые

стр. 93
о том, что гены/7/Y//? и sllO886контролируютне биогенез нилей, а их функционироваиие. 93 ВЫВОДЫ у циапобактерииSynechocystissp. РСС6803исследоваликластергепов sllO886prqR-prqA, и котором геп prqR пегативпо регулируетустойчивостьклеток к индуктору окислительпого стрессаметилвиологену. 1. С помощью сайт-направлеппого мутагепеза игенетическогоанализагсиа prqR установлено, что репрессорпая функция белка PrqR обеспечивается как...

Оглавление диссертациикандидат биологических наук Кирик, Инесса Анатольевна
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
ВВЕДЕНИЕ
ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ б
Гспстпчсскпй контроль п молекулярные механизмы адаптации фотоеннтезнругощнх организмов к стрессовым факторам
1. Окислительный стресс и антиоксидантпые системы защиты б
1.1. Условия развития окислительного стресса в клетках аэробных организмов б
1.2. Генетический контроль адаптивного ответа на окислительный стресс у энтеробактерий
1.3. Генетический контроль устойчивости к окислительному стрессу у растений
1.4. Системы адаптации к окислительному стрессу у циапобактернй
1.4.1. Изменения в тотальном профиле транскрипции у Synechocystis при гндропероксидпом стрессе
1.4.2. PerR регулоп Synechocystis
1.4.3. Изменения в тотальном профиле транскрипции в клетках Synechocystis под действием генератора суперокеида MV
1.4.4. Контроль устойчивости клеток Synechocystis к MV с участием регуляторного гена prqR и генов белков-транспортеров
2. Молекулярные механизмы адаптации цианобактерий к солевому и гиперосмотическому стрессу
2.1. Специфичность адаптивных ответов клеток Synechocystis па солевой и гиперосмотический стресс
2.2. Перекрывание адаптивных ответов на солевой и гиперосмотический стресс
2.3. Кинетика адаптивного ответа клеток Synechocystis на солевой стресс
2.4. Регуляция адаптивного ответа клеток на солевой и гиперосмотичеекий стресс
3. Механизмы адаптации клеток Synechocystis к холодовому стрессу
4. Системы адаптации фотоеинтезирующих организмов к световому стрессу
5. Генетический контроль фототаксиса и биогенеза пилей у Synechocystis 37 МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
1. Бактериальные штаммы и плазмиды
2. Питательные среды и культивирование микроорганизмов
3. Определение содержания хлорофилла и каротииоидов в клетках цианобактерий
4. Трансформация клеток Е. coli и Synechocystis
5. Передача плазмид из Е. coli в Synechocystis с помощью конъюгации
6. Тест па чувствительность клеток к ингибиторам роста
7. Измерение активности р-галактозидазы в клетках Synechocystis
8. Выделение ДНК, определение числа копий плазмид в клетке
9. Обработка ДНК ферментами
10. Электрофорез ДНК в агарозном геле и выделение ДНК из геля
11. Полимеразная цепная реакция (ПЦР)
12. Сайт-паправлепиый мутагенез
13. Определение последовательности пуклеотидов в ДИК
14. Выделение РНК, электрофорез и перенос РНК из геля на нейлоновую мембрану
15. Получение специфических ДНК-зондов
16. Нозсрп-блот-гибридизация
17. Анализ профилей транскрипции в клетках Synechocystis с помощью ДНК-микрочипов
18. Атомио-силовая микроскопия 50 РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ
1. Анализ регуляторпой функции генаprqR с помощью сайт-паправлсппого мутагенеза и гепов-репортеров
1.1. С-копцевой участок необходим для функционирования белка PrqR в качестве репрессора транскрипции
1.2. Системы анализа экспрессии и взаимодействия аллелей генаprqR
1.3. Негативная авторегуляция гена prqR в клетках Е. coli
1.4. Z/мс-домииаптный характер проявления мутаптпого аллсля prqRL17Q в клетках Synechocystis
2. Оперон prqR-prqA вовлечен в адаптивный ответ клеток па солевой стресс
3. Плсйотроппый характер мутацииprqRLl7Q: повышенная устойчивость клеток к
MV и отрицательный фототаксис, независимый от интенсивности света
4. Делеция prqR и ипсерциоппая инактивация гена prqA не влияют па фототаксис
5. Зависимость подвижности клеток мутанта Pql7 от спектра света
6. В регуляцию фототаксиса вовлечен ген sll0886, контролирующий активируемый светом гетеротрофный рост клеток Synechocystis
7. Изменения в регуляции генов, ответственных за функционирование пилей, у мутантов с нарушенной функцией гена prqR
8. Анализ морфологии пилей, обеспечивающих подвижность клеток
Synechocystis, у мутантов с нарушенным или измененным фототаксисом
8.1. Сравнительный анализ пилей, формируемых подвижными и неподвижными клетками штаммов ДТ и ДТ-М Synechocystis
8.2. Гены prqR и sll0886 контролируют функционирование толстых пилей, по не их биогенез