Молекулярно-генетический анализ риккетсий, циркулирующих на территории Западной Сибири и Дальнего Востока Иголкина Яна Петровна

Краткое описание

Иголкина,ЯнаПетровна.Молекулярно-генетическийанализриккетсий,циркулирующихнатерриторииЗападнойСибирииДальнегоВостока: диссертация ... кандидата биологических наук : 03.01.03 /ИголкинаЯнаПетровна; [Место защиты: Ин-т хим. биологииифундамент. медицины СО РАН]. - Новосибирск, 2019. - 132 с. : ил.больше

Оглавление диссертациикандидат наук Иголкина Яна Петровна
ВВЕДЕНИЕ
1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1.1. История изучения риккетсиозов
1.2. Морфология риккетсий
1.3. Классификация риккетсий
1.4. Организация генома риккетсий
1.5. Взаимодействие риккетсий с клетками хозяина
1.6. Иммунитет при риккетсиозах
1.7. Характеристика риккетсий и вызываемых ими риккетсиозов
1.7.1. Риккетсии и риккетсиозы группы сыпного тифа
1.7.2. Риккетсии, переносимые клещами
1.7.3. Клещи, как переносчики риккетсий
1.7.4. Роль позвоночных в поддержании очагов клещевых риккетсиозов
1.7.5. Характеристика распространенных на территории РФ риккетсий, переносимых клещами
1.7.6. Клещевые риккетсиозы на территории РФ
1.7.7. Клинические проявления риккетсиозов
1.7.8. Методы диагностики риккетсиозов
1.8. Заключение
2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
2.1. Материалы
2.2. Буферы и основные растворы
2.3. Медико-биологические образцы
2.3.1. Иксодовые клещи
2.3.2. Клинические образцы пациентов
2.4. Выделение ДНК
2.4.1. Выделение ДНК из иксодовых клещей
2.4.2. Выделение ДНК из клинических образцов пациентов (крови, ликвора
и биоптатов)
2.5. Выявление ДНК Rickettsia spp. методом полимеразной цепной реакции (ПЦР)

2.5.1. Синтетические олигонуклеотиды
2.5.2. Постановка ПЦР
2.5.3. Электрофоретическая детекция продуктов ПЦР
2.5.4. Определения нуклеотидных последовательностей
2.5.5. Анализ нуклеотидных последовательностей
2.6. Проведение серологического анализа (ELISA)
2.7. Проведение статистического анализа
3. РЕЗУЛЬТАТЫ
3.1. Выбор праймеров для родо- и видоспецифичной ПЦР
3.2. Выявление ДНК риккетсий в клещах
3.2.1. Выявление ДНК риккетсий в иксодовых клещах, собранных на Дальнем Востоке
3.2.1.1. Хабаровский край
3.2.1.2. Амурская область
3.2.1.3. Камчатский край
3.2.1.4. Сахалинская область
3.2.2. Выявление ДНК риккетсий в клещах, собранных на флаг в Западной Сибири
3.2.2.1. Новосибирская область
3.2.2.2. Республика Алтай
3.2.2.3. Омская область
3.2.3. Выявление ДНК риккетсий в клещах, снятых с мелких млекопитающих в Омской области
3.3. Генетическая характеристика выявленных в клещах риккетсий
3.4. Филогенетический анализ кандидатных видов
3.5. Выявление ДНК риккетсий в образцах пациентов
3.6. Генотипирование риккетсий, выявленных в клинических образцах пациентов
3.7. Клинические проявления у пациентов, в клинических образцах которых была выявлена ДНК риккетсий
3.8. Анализ парных сывороток пациентов на наличие антител к риккетсиям
методом ELISA
4. ОБСУЖДЕНИЕ
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ВЫВОДЫ