Новый тип модификации ДНК. Направленное введение межолигомерных пирофосфатных связей Пурмаль, Андрей Анатольевич

Краткое описание

Пурмаль, Андрей Анатольевич.
Новый тип модификации ДНК. Направленное введение межолигомерных пирофосфатных связей : диссертация ... кандидата химических наук : 02.00.10. - Москва, 1984. - 190 с. : ил.
Оглавление диссертациикандидат химических наук Пурмаль, Андрей Анатольевич
НОВЫЙ ТИП МОДИФИКАЦИИ ДНК. НАПРАВЛЕННОЕ ВВЕДЕНИЕ МЕЖОЛИГОМЕРНЫХ ПИРОФОСФАТНЫХ СВЯЗЕЙ
02.00.10 - биоорганическая химия, химия природных и физиологически активных веществ
Научные руководители: докт.хим.наук, профессор З.А.Шабарова канд.хим.наук,ст.научн.сотр. В.Л.Друца
Химический факультет
На правах рукописи
Диссертация на соискание ученой степени кандидата химических наук
Москва
ОГЛАВЛЕНИЕ
СПИСОК СОКРАЩЕННЫХ ОБОЗНАЧЕНИЙ
ВВЕДЕНИЕ.
ГЛАВА I. ОЛИГО- и ПОЛИНУКЛЕОТИДЫ С МОДИФИЦИРОВАННЫМИ МЕШОНШЕРНЫМИ УЗЛАМИ. ПОЛУЧЕНИЕ И СВОЙСТВА (ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ)
1.1. Методы получения аналогов нуклеиновых кислот с различными типами модифицированных межмоно-мерных узлов
1.1.1. Фосфотриэфирные аналога олиго- и полинуклео-тидов
1.1.2. Фосфонатные аналоги олигонуклеотидов
1.1.3. Фосфитные аналоги олигонуклеотидов
1.1.4. Серусодержащие аналоги олиго- и полинуклео-тидов
1.1.4.1.Тиофосфатные аналоги олигонуклеотидов
1.1.4.2.Тионфосфатные аналоги олиго- и полинуклеоти
1.1.5. Фосфоамидные аналоги олиго- и полинуклеоти
1.2. Комплементационные взаимодействия олиго- и полинуклеотидов с модифицированными межмоно-мерными узлами •••••••;••••••••••••.
1.2.1. Неионные аналоги олигонуклеотидов
1.2.2. Поликатионные аналоги олигонуклеотидов
1.2.3. Полианионные аналоги олиго- и полинуклеотидов
1.3. Субстратные свойства нуклеиновых кислот с модифицированными межмономерными узлами
1.3.1. Нуклеазы
1.3.1.1.Неспецифические нуклеазы и РНазы
1.3.1.2.Эндонуклеазы рестрикции
1.3.2. Ферменты, катализирующие синтез межнуклеотидных связей
1.3.2.Г.ДНК-зависимая РНК-полимераза
1.3.2.2.ДНК-зависимые ДНК-полимеразы
1.3.2.3.Полинуклеотидфосфорилаза (ПНФаза)
1.3.2.4.Терминальная дезоксинуклеотидилтрансфераза
1.3.3. Т4г-Полинуклеотидкиназа
1.3.4. Т4г-ДНК-лигаза
1.4. Биохимические свойства нуклеиновых кислот с модифицированными межнуклеотидными узлами
1.4.1. Влияние аналогов на белок-синтезирущую систему и рост клеток.
1.4.2. Интерфероногенная активность
ГЛАВА 2. ПОЛУЧЕНИЕ И СВОЙСТВА ПОЛИНУКЛЕОТЙДОВ С МЕЖ-0ЛИ1ШЕРНШИ З^ПИРОФОСФАТНЫМИ СВЯЗЯМИ
ОБШДШЕ РЕЗУЛЬТАТОВ)
2.1. Получение и комплементационные свойства ди-фосфатов олигонуклеотидов.
2.1.1. Получение 3^-дифосфатов олигонуклеотидов
2.1.2. Получение 3) 5^-дифосфатов олигонуклеотидов
2.1.3. комплементационные взаимодействия и 3^5дифосфатов олигонуклеотидов ••••••••••••••
2.2. Получение и физико-химические свойства дву-тяжевых ДНК с повторяющимися 3^5-пирофосфатными межнуклеотидными узлами •••.•••••••••.
2.2.1. Химическая матричная поликонденсация TGGCCAAGCTpp
2.2.2. Химическая матричная поликонденсация З^ди-фосфатов нона- и декануклеотидов
2.2.3. Сравнение эффективности образования различных типов межнуклеотидных связей в реакциях матричной конденсации . ПО
2.2.4. Выяснение возможного механизма ЕДЙ-индуцируе-мой матричной конденсации З1,5^-дифосфатов оли-гонуклеотидов •••••••••.
2.2.5. Физико-химические свойства полинуклеотидов с 3^5-пирофо сфатными межмономерными связями
2.3. Субстратные свойства полинуклеотидов с 3^-5^пирофосфатными межмономерными связями
2.3.1. Расщепление двутяжевых полинуклеотидов с шгрофо сфатными межмономерными связями эндо-нуклеазами рестрикции.
2.3.2. Транскрипция полинуклеотидов с пирофосфатными межмономерными узлами.
ГЛАВА 3. ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ
ВЫВОДЫ