Оптимизация обработки масс-спектрометрических данных для выявления особенностей липидома клинических образцов Токарева Алиса Олеговна

Краткое описание

Токарева, Алиса Олеговна.
Оптимизация обработки масс-спектрометрических данных для выявления особенностей липидома клинических образцов : диссертация ... кандидата физико-математических наук : 02.00.02 / Токарева Алиса Олеговна; [Место защиты: ФГАОУ ВО «Московский физико-технический институт (национальный исследовательский университет)»]. - Москва, 2021. - 118 с. : ил.
Оглавление диссертациикандидат наук Токарева Алиса Олеговна
ВВЕДЕНИЕ
ГЛАВА 1. МАСС-СПЕКТРОМЕТРИЯ ЛИПИДОВ В КЛИНИЧЕСКИХ ИССЛЕДОВАНИЯХ
1. 1 Липиды, их классы и роль в метаболизме человека
1.2 Методы масс-спектрометрии липидов
1.2.1 Методы прямого анализа биологической ткани
1.2.2 Анализ липидного экстракта с использованием прямого ввода
1.2.3 Анализ липидного экстракта с использованием жидкостной хромато-масс спектрометрии
1.3 Анализ масс-спектрометрических данных в клинических исследованиях
1.3.1 Предобработка данных
1.3.2 Нормализация данных
1.3.3 Идентификация липидов
1.3.4 Выбор биомаркеров, построение диагностической модели
ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
2.1 Материалы
2.1.1. Биологические образцы
2.2.2 Химические препараты
2.2 Подготовка образцов
2.2.1 Синтез фосфотидилхолинов
2.2.2 Экстракция липидов
2.2.3 Состав партий
2.3 Масс-спектрометрический анализ
2.3.1 Масс-спектрометрия с прямой ионизацией
2.3.2 Масс-спектрометрия прямого ввода
2.3.3 Масс-спектрометрия с предварительным хроматографическим разделением
2.4 Обработка масс-спектрометрических данных
2.4.1 Предобработка масс-спектрометрических данных
2.4.2 Редуцирование межпартийных изменений
2.4.3 Идентификация липидов
2
2.4.4 Выбор маркеров
2.4.5. Построение классификационных моделей, диагностических моделей и
их валидация
2.4.6 Статистический анализ
ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЯ
3.1 Деконволюция спектров
3.2 Нормализация данных
3.3. Выбор переменных
3.3.1 Построение дискриминантных моделей
3.3.2 Поиск биомаркеров. Диагностические модели
ГЛАВА 4. ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ ИССЛЕДОВАНИЯ
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ВЫВОДЫ
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
ВВЕДЕНИЕ