Особенности взаимодействия катионных пиридилфениленовых дендримеров с амилоидогенным белком Сорокина Светлана Анатольевна

Краткое описание

Сорокина, Светлана Анатольевна.
Особенности взаимодействия катионных пиридилфениленовых дендримеров с амилоидогенным белком : диссертация ... кандидата химических наук : 02.00.06; 03.01.04 / Сорокина Светлана Анатольевна; [Место защиты: Ин-т элементоорган. соединений им. А.Н. Несмеянова РАН]. - Москва, 2019. - 193 с. : ил.
Оглавление диссертациикандидат наук Сорокина Светлана Анатольевна
ВВЕДЕНИЕ
1. ЛИТЕРАТУРНЫЙ ОБЗОР
1.1 ОБЩИЕ ПРИНЦИПЫ СИНТЕЗА ДЕНДРИМЕРНЫХ МОЛЕКУЛ
1.2 СВОЙСТВА ДЕНДРИМЕРОВ
1.3 КЛАССЫ ДЕНДРИМЕРОВ, НАИБОЛЕЕ ЧАСТО ИССЛЕДУЕМЫЕ ДЛЯ ПРИМЕНЕНИЯ В МЕДИЦИНЕ
1.3.1 Полиамидоаминные дендримеры
1.3.2 Полипропилениминовые дендримеры
1.3.3 Фосфорсодержащие дендримеры
1.3.4 Полилизиновые дендримеры
1.3.5 Карбосилановые дендримеры
1.3.6 Гибридные дендримеры
1.4 БИОСОВМЕСТИМОСТЬ ДЕНДРИМЕРОВ
1.4.1 Токсичность
1.4.2 Проницаемость гемато-энцефалического барьера для дендримеровЗО
1.5 КОМПЛЕКСЫ ДЕНДРИМЕРОВ С БЕЛКАМИ
1.5.1 Природа взаимодействия дендримеров с белками
1.5.2 Влияние различных факторов на взаимодействие дендримеров с белками
1.5.3 Влияние дендримеров на вторичную структуру, конформацию и внутримолекулярную подвижность
1.5.4 Метод молекулярной динамики и моделирование белок-дендримерных взаимодействий
1.6 ДЕНДРИМЕРЫ И НЕЙРОДЕГЕНЕРАТИВНЫЕ ЗАБОЛЕВАНИЯ
1.6.1 Молекулярные механизмы развития нейродегенеративных заболеваний
1.6.2 Прионный белок
1.5.3 Способы воздействия на процесс амилоидной агрегации белков
1.5.4 Анти-амилоидные свойства дендримеров
2 РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ
2.1 СИНТЕЗ КАТИОННЫХ ПИРИДИЛФЕНИЛЕНОВЫХ ДЕНДРИМЕРОВ
2.2 ХАРАКТЕРИЗАЦИЯ КАТИОННЫХ ПИРИДИЛФЕНИЛЕНОВЫХ ДЕНДРИМЕРОВ
2.2.1 Динамическое лазерное светорассеяние
2.2.2 Спектры поглощения
2.2.3 Разделение дендримеров методом фракционирования в ассиметричном потоке поля
2.2.4 Моделирование методом молекулярной динамики
2.3 ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ ДЕНДРИМЕРОВ С НАТИВНЫМ ПРИОННЫМ БЕЛКОМ
2.3.1 Изотермическая титрационная калориметрия
2.3.2 Моделирование методом молекулярной динамики
2.3.3 Динамическое лазерное светорассеяние
2.3.4 Спектроскопия кругового дихроизма
2.3.5 Тушение собственной флуоресценции белка под действием дендримеров
2.3.6 Изучение стабильности комплексов дендримера с прионным белком
2.4 ИЗУЧЕНИЕ СПОСОБНОСТИ ДЕНДРИМЕРОВ ПРЕПЯТСТВОВАТЬ БЕЛКОВОЙ АГРЕГАЦИИ
2.4.1 Влияние дендримеров на процесс формирования олигомеров приона
2.4.2 Ингибирование фибриллизации прионного белка
2.5 РАЗРУШЕНИЕ БЕЛКОВЫХ АГРЕГАТОВ АМИЛОИДНОЙ ПРИРОДЫ
2.5.1 Электрофорез по Лэммли
2.5.2 Иммунохимическое детектирование белка
2.5.3 Динамическое лазерное светорассеяние
2.5.4 Определение концентрации высвободившегося белка методом иммуноферментного анализа
2.5.5 Флуоресценция тиофлавина Т
2.5.6 Флуоресцентная микроскопия
2.6 ИССЛЕДОВАНИЕ ЦИТОТОКСИЧНОСТИ ДЕНДРИМЕРОВ
3 ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ
3.1 РЕАГЕНТЫ И РАСТВОРИТЕЛИ
3.2 СИНТЕЗ ИСХОДНЫХ СОЕДИНЕНИЙ
3.3 СИНТЕЗ ПИРИДИЛФЕНИЛЕНОВЫХ ДЕНДРИМЕРОВ
3.4 СИНТЕЗ КАТИОННЫХ ПИРИДИЛФЕНИЛЕНОВЫХ ДЕНДРИМЕРОВ
3.5 ВЫДЕЛЕНИЕ И ОЧИСТКА РЕКОМБИНАНТНОГО ОВЕЧЬЕГО ПРИОННОГО БЕЛКА
3.6 ФОРМИРОВАНИЕ КОМПЛЕКСОВ МЕЖДУ ДЕНДРИМЕРАМИ И НАТИВНЫМ ОВЕЧЬИМ ПРИОННЫМ БЕЛКОМ
3.7 ИНГИБИРОВАНИЕ АГРЕГАЦИИ ПРИОННОГО БЕЛКА
3.8 РАЗРУШЕНИЕ БЕЛКОВЫХ АГРЕГАТОВ
3.9 МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ
ВЫВОДЫ
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
БЛАГОДАРНОСТИ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ