Разработка способов направленной регуляции дегидрогеназ 2-оксокислот млекопитающих и особенности такой регуляции в клетках с разным типом метаболизма Артюхов Артем Викторович

Краткое описание

Артюхов,АртемВикторович.Разработкаспособовнаправленнойрегуляциидегидрогеназ2-оксокислотмлекопитающихиособенноститакойрегуляциивклеткахсразнымтипомметаболизма: диссертация ... кандидата биологических наук : 03.01.08 /АртюховАртемВикторович; [Место защиты: ФГБОУ ВО «Московский государственный университет имени М.В. Ломоносова»]. - Москва, 2022. - 170 с. : ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
МОСКОВСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ УНИВЕРСИТЕТ имени М.В. ЛОМОНОСОВА НИИ ФИЗИКО-ХИМИЧЕСКОЙ БИОЛОГИИ имени А.Н. БЕЛОЗЕРСКОГО На правах рукописиАртюховАртемВикторовичРазработкаспособовнаправленнойрегуляциидегидрогеназ2-оксокислотмлекопитающихиособенноститакойрегуляциивклеткахсразнымтипомметаболизма03.01.08 Биоинженерия ДИССЕРТАЦИЯ на соискание ученой степени...

стр. 8
изолированных ферментах, так и изучение действия регуляторов в живых системах (клеткахи тканях животных), проводимое с учетомразнойспецифичностиметаболизмаэкспериментальных объектов. Цель и задачи работы Цель данной работы заключается вразработкеспособовнаправленнойфармакологическойрегуляцииполиферментных комплексовдегидрогеназ2-оксокислотразнойсубстратной специфичности умлекопитающих, с учетом клеточной...

стр. 107
изоферментовдегидрогеназ2-оксокислотвметаболизмеи его регуляции11 Благодаря узловой ролидегидрогеназ2-оксокислотвметаболизме, наличие большого разнообразия изоформдегидрогеназ2-оксокислотвклеткахи тканяхмлекопитающих, обеспечиваетразныеособенностиметаболизма, необходимые для выполнения

Оглавление диссертациикандидат наук Артюхов Артем Викторович
СПИСОК ИСПОЛЬЗУЕМЫХ СОКРАЩЕНИЙ
1. ВВЕДЕНИЕ
2. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
2.1. Дегидрогеназы 2-оксокислот
2.1.1. Общая характеристика комплексов дегидрогеназ 2-оксокислот и их основные представители
2.1.2. Механизм работы комплексов
2.1.3. Структурные компоненты комплексов дегидрогеназ 2-оксокислот
2.1.4. Изоферменты и изоформы компонентов комплексов дегидрогеназ 2-оксокислот
2.1.5. Регуляция комплексов дегидрогеназ 2-оксокислот природными системами
2.2. Тиамин в качестве фармакологического регулятора дегидрогеназ 2-оксокислот и метаболических путей с их участием
2.2.1. Физиологическая роль тиамина как предшественника кофермента дегидрогеназ 2-оксокислот
2.2.2. Регуляция метаболизма антагонистами тиамина
2.2.3. Некоферментные функции тиамина
2.3. ФОСФОНОВЫЕ И ФОСФИНОВЫЕ АНАЛОГИ 2-оксокислот в качестве синтетических ингибиторов дегидрогеназ 2-оксокислот
2.3.1. Общая характеристика
2.3.2. Химические свойства
2.3.3. Специфическое ингибирование дегидрогеназ 2-оксокислот in vitro
2.3.4. Использование в качестве регуляторов метаболизма in vivo
3. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
3.1. Материалы
3.2. Частичная очистка комплексов дегидрогеназ 2-оксокислот из тканей крысы
3.3. Работа с клеточными культурами
3.4. Работа с животными
3.5. Биохимический анализ клеток и тканей животных и очищенных ферментов
3.5.1. Приготовление гомогенатов тканей для определения экспрессии и активностей ферментов
3.5.2. Приготовление экстрактов клеток и тканей для количественного анализа низкомолекулярных метаболитов
3.5.3. Измерение восстановительного потенциала клеток
3.5.4. Измерение концентрации белка
3.5.5. Измерение активностей ферментов
3.5.6. Вестерн-блоттинг
3.5.7. Метаболомный анализ клеточных экстрактов
3.5.8. Аминокислотный анализ экстрактов тканей
3.5.9. Измерение уровня окисленного глутатиона в тканях
3.5.10. Измерение уровня NAD+ в тканях
3.5.11. Исследование специфичности ингибирования in vitro и эффекта преинкубации
3.5.12. Исследование механизмов ингибирования и определение констант ингибирования
3.6. Работа с биоинформатическими базами данных
3.6.1. Оценка экспрессии генов на уровне мРНК
3.6.2. Оценка экспрессии генов на уровне белка
3.6.3. Филогенетический анализ гомологов ОГДГ
3.6.4. Моделирование структур ОГДГ и ОАДГ в комплексе с ТДФ и 2-оксофосфонатами
3.7. Статистический анализ
4. РЕЗУЛЬТАТЫ
4.1. Филогения дегидрогеназ 2-оксокислот из различных организмов
4.2. Экспрессия комплексов дегидрогеназ 2-оксокислот в животных тканях и их
СООТВЕТСТВИЕ АКТИВНОСТЯМ В ТКАНЯХ
4.3. КИНЕТИКА НАСЫЩЕНИЯ ОГДК И ОАДК животных 2-оксосубстратами и ИНГИБИРОВАНИЯ ИХ ФОСФОНОВЫМИ АНАЛОГАМИ
4.3.1. Насыщение ОГДК и ОАДК 2-оксосубстратами
4.3.2. Ингибирование активности ОГДК в препаратах сердца и печени
4.3.3. Ингибирование активности ОАДК в препаратах сердца и печени
4.3.4. Специфичность ингибирования ОГДК/ОАДК фосфоновыми аналогами дикарбоновых 2-оксокислот
4.4. Ингибирование ПДГК и КДГРК животных синтетическими аналогами пирувата и РАЗВЕТВЛЕННЫХ 2-ОКСОКИСЛОТ
4.4.1. Ингибирование активности ПДГК фосфоновыми и фосфиновыми аналогами пирувата
4.4.2. Ингибирование активностей КДГРК, ПДГК и ОГДК фосфоновыми аналогами разветвленных 2-оксокислот
4.5. Эффекты ингибирования дегидрогеназ 2-оксокислот в клеточных линиях зависят
ОТ СПЕЦИФИКИ КЛЕТОЧНОГО МЕТАБОЛИЗМА
4.5.1. Эффекты ингибиторов ОГДК и ОАДК на клеточный метаболизм
4.5.2. Эффекты ингибиторов ПДГК на клеточный метаболизм и жизнеспособность
4.6. БИОХИМИЧЕСКИЕ последствия регуляции дегидрогеназ 2-оксокислот в мозге животных
4.6.1. Эффекты ингибиторов ОГДК
4.6.2. Эффекты ингибиторов ОАДГ
4.6.3. Эффекты ингибиторов ПДГК
4.6.4. Эффекты тиамина как физиологического активатора дегидрогеназ 2-оксокислот, зависящие от времени суток
4.6.5. Долгосрочные последствия однократного воздействия на дегидрогеназы 2-оксокислот
5. ОБСУЖДЕНИЕ
5.1. РОЛЬ ИЗОФЕРМЕНТОВ ДЕГИДРОГЕНАЗ 2-ОКСОКИСЛОТ В МЕТАБОЛИЗМЕ И ЕГО РЕГУЛЯЦИИ
5.2. ТЕОРЕТИЧЕСКАЯ ЗНАЧИМОСТЬ ФОСФОНАТОВ КАК ВЫСОКОСПЕЦИФИЧНЫХ РЕГУЛЯТОРОВ ДЕГИДРОГЕНАЗ 2-ОКСОКИСЛОТ
5.3. ПРАКТИЧЕСКОЕ ЗНАЧЕНИЕ РЕГУЛЯТОРОВ ДЕГИДРОГЕНАЗ 2-ОКСОКИСЛОТ
5.3.1. Моделирование патологической дисфункции дегидрогеназ 2-оксокислот
5.3.2. Ингибирование дегидрогеназ 2-оксокислот с целью снижения патологических симптомов
5.3.3. Использование регуляторов дегидрогеназ 2-оксокислот в биотехнологии, сельском хозяйстве и системной биологии
5.3.4. Возможные долгосрочные последствия регуляции дегидрогеназ 2-оксокислот
6. ЗАКЛЮЧЕНИЕ
7. ОСНОВНЫЕ РЕЗУЛЬТАТЫ И ВЫВОДЫ
8. БЛАГОДАРНОСТИ
9. СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
10. ДОПОЛНИТЕЛЬНЫЕ МАТЕРИАЛЫ