Ретропозоны Alu-семейства и их роль в геноме человека Казаков, Василий Иванович

Краткое описание

Казаков,ВасилийИванович.РетропозоныAlu-семействаиихрольвгеномечеловека: диссертация ... доктора биологических наук : 03.00.03 /КазаковВасилийИванович; [Место защиты: Институт цитологии РАН]. - Санкт-Петербург, 2014. - 153 с. : 6 ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
РОССИЙСКАЯ АКАДЕМИЯ НАУК Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт цитологии РАН На правах рукописи 05201451087КАЗАКОВВасилийИвановичРетропозоныAlu-семействаи ихрольвгеномечеловека03.01.03 - молекулярная биология ДИССЕРТАЦИЯ на соискание ученой степени доктора биологических наук Санкт-Петербург 2014 СОДЕРЖАНИЕ ВВЕДЕНИЕ ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ СтроениеAlu-повторов. ПроисхождениеAlu-повторов....

стр. 5
участвуют в регуляции экспрессии белок-кодирующих генов. Но все же, получается, чточеловекна сегодняшний день слабо представляет себе функциональнуюрольосновной части (97 %) своегогенома. Особое место среди некодирующих элементовгеномачеловеказанимаютретропозоныAlu-семейства, относящиеся к классу

Оглавление диссертациикандидат наук Казаков, Василий Иванович
СОДЕРЖАНИЕ
ВВЕДЕНИЕ
ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
Строение Alu-повторов
Происхождение Alu-повторов
Классификация Alu повторов
Амплификация Alu-повторов в геноме человека
Механизм ретропозиции Alu-повторов
Распределение Alu-повторов в геноме человека
Роль Alu повторов в регуляции генной экспрессии. 27 Роль Alu-повторов в возникновении наследственных
заболеваний. 36 "Нейтральные" инсерции и инсерционно-делеционный
полиморфизм, влияющий на экспрессию генов
МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ
Международная программа «Геном человека»
Alu-повторы в составе внеклеточной ДНК человека. 60 Alu-повторы за счет модуляции экспрессии генов и Alu-опосредованной экзонизации интронов вносят существенный вклад
в генетическую гетерогенность популяции. 70 Alu-повторы участвуют в регуляции генной экспрессии Alu-повторы могут служить вспомогательными сигналами при
формировании факультативного гетерохроматина
Инвертированные повторы встречаются в геноме амфибий 100 Подобно Alu-элементам DL1 повторы лентеца широкого (Diphyllobothrium latum) содержат внутренний промотор для
РНК-полимеразы III

ВЫВОДЫ
СПИСОК ПУБЛИКАЦИЙ ПО ТЕМЕ ДИССЕРТАЦИИ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
ПРИЛОЖЕНИЯ
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
5'-, З'-UTR - (5'-, З'-untranslated regions) - 5'-, З'-нетранслируемые области
5тС - 5-метилцитозин
CD8a - (CD8 antigen, alpha polypeptide) - а субъединица CD8 антигена DD - делеционная гомозигота
ERa - транскрипционный фактор Estrogen receptor alpha
FAM - (fossil Alu monomer) - мономер Alu повтора
FLAM - (fossil left Alu monomer) - левый мономер Alu повтора
FRAM - (fossil right Alu monomer) - правый мономер Alu повтора
ID - инсерционно-делеционные гетерозиготы
II - инсерционная гомозигота
L1 - повторы LINE1 семейства
LINE - (long interspersed nucleotide elements) - длинные
диспергированные нуклеотидные элементы
SINE - (short interspersed nucleotide elements) - короткие
диспергированные нуклеотидные элементы
Sp1 - транскрипционный фактор Stimulating protein
TBE - трис-боратный буфер
ТЕ - трис-ЭДТА буфер
YY1 - транскрипцонный фактор Yin Yang
XIC - (X inactivation center) - центр инактивации X хромосомы
Xist РНК- (X inactivation specific transcript) - специфический
транскрипт, экспрессирующийся в ходе инактивации X хромосомы
АПФ - ангиотензинпревращающий фермент
ПААГ - полиакриламидный гель
СС - сайт связывания
ССТФ - сайт связывания транскрипционного фактора ТФ - транскрипционный фактор ЦРМ - Ц1/с-регуляторный модуль
ч