Синтез и исследование меченых тритием аминокислот, пептидов и белков с использованием твердофазных реакций Золотарев, Юрий Александрович

Краткое описание

Золотарев, Юрий Александрович.
Синтез и исследование меченых тритием аминокислот, пептидов и белков с использованием твердофазных реакций : диссертация ... доктора химических наук в форме науч. докл. : 02.00.10. - Москва, 1998. - 68 с. : ил.; 20х15 см.
Оглавление диссертациикандидат химических наук Бочаров, Эдуард Валерьевич
СОДЕРЖАНИЕ
ВВЕДЕНИЕ
ГЛАВА I. РИБОСОМА И ЕЕ КОМПОНЕНТЫ (ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ)
Современные представления о структуре и функции рибосомы и ее
компонентов. Ю
Физико-химические методы исследования строения макромолекул
Морфология рибосомы
Рибосомная РНК
Рибосомные факторы
Структура рибосомных белков
Синтез белка на прокариотической рибосоме
Рибосомный белок L7/L12
Заключение
ГЛАВА II. ПРОСТРАНСТВЕННАЯ СТРУКТУРА ДИМЕРА БЕЛКА L7 ИЗ
РИБОСОМЫ ESCHERICHIA COLI В РАСТВОРЕ
Экспериментальные данные для определения пространственной
структуры димера рибосомного белка L7
Отнесение сигналов в ЯМР спектрах белка L7
Отнесение сигналов спиновых систем протонов
Последовательное отнесение сигналов спиновых систем протонов
Конфигурация Х-Pro пептидных связей
Основные элементы вторичной структуры димера L7 и их упаковка в
пространстве
Химический обмен амидных протонов димера L7 с растворителем
N- и С-концевые фрагменты (Ser1-Ala37 и Ala47-Lys120) белка L7
Фрагмент 1-37 рибосомного белка L7
Фрагмент 47-120 рибосомного белка L7
Расчет пространственной структуры димера L7
Экспериментальные ограничения на межпротонные расстояния
и двугранные углы
Продолжение отнесения кросс-пиков ЯЭО в спектрах NOESY
Пространственные структуры N- и С-концевых доменов димера L7. 75 Внутри- и межмолекулярные гидрофобные и гидрофильные взаимодействия,
стабилизирующие пространственную структуру димера L7
Заключение
ГЛАВА III. ПЕНТАМЕРНЫЙ КОМПЛЕКС (L7)4L10
Гомо- и гетероядерные спектры пентамерного комплекса (L7)4L10
Пространственная организация пентамерного комплекса (L7)4L10
Заключение
ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ
Основные экспериментальные проблемы при исследовании рибосомных белков
методом ЯМР. (Обоснование выбора экспериментальных методик.)
Получение и очистка белков
Получение спектров ЯМР
Методика отнесения химических сдвигов сигналов в спектре ЯМР. 122 Расчет пространственной структуры методом молекулярной динамики в
пространстве торсионных углов
Минимизация конформационной энергии
Анализ гидрофобных и гидрофильных взаимодействий по методу МГП. 126 Теоретическое предсказание пространственной структуры рибосомного
белка L10 из Escherichia coli
ВЫВОДЫ
ПРИЛОЖЕНИЕ
Таблицы
Список сокращений
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ