Сравнительный анализ и консервация геномов штаммов вируса натуральной оспы из российской коллекции Бабкина, Ирина Николаевна

Краткое описание

Бабкина,ИринаНиколаевна.Сравнительныйанализиконсервациягеномовштаммоввирусанатуральнойоспыизроссийскойколлекции: диссертация ... кандидата биологических наук : 03.00.03. - Кольцово, 2006. - 148 с. : ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
ГОСУДАРСТВЕННЫЙ НАУЧНЫЙ ЦЕНТР ВИРУСОЛОГИИ И БИОТЕХНОЛОГИИ "ВЕКТОР" 61:06-3/1175 На правах рукописиБабкинаИринаНиколаевнаСРАВНИТЕЛЬНЫЙАНАЛИЗИКОНСЕРВАЦИЯГЕНОМОВШТАММОВВИРУСАНАТУРАЛЬНОЙОСНЫ ИЗРОССИЙСКОЙКОЛЛЕКЦИИ05.00.03 - молекулярная биология Диссертация на соискание ученой степени кандидата биологических

стр. 3
нуклеотидных последовательностей поксвирусов 2.4, Заключение 3. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ 3.1. Материалы 3.2. Выделение ДНКвирусанатуральнойоспы3.2.1. Вьщеление ДНКвирусанатуральнойоспы, культивированного в культуре клеток Vero 3.2.2. Вьщеление ДНКвирусанатуральнойоспы, культивированного наХАО КЭ 3.3. Олигонуклеотидные

стр. 110
изученияштаммовВНО необходимо осушествить генотипирование имеющихсяколлекцийштаммов. Был проведенсравнительныйанализполиморфизма длины рестрикционных фрагментов двадцати ампликонов, покрывающих в сумме полныегеномы21 щтаммавирусанатуральнойоспы(ВНО)Российскойколлекции(табл. 9). Ампликоны

Оглавление диссертациикандидат биологических наук Бабкина, Ирина Николаевна
СПИСОК ИСПОЛЬЗУЕМЫХ СОКРАЩЕНИЙ.
1. ВВЕДЕНИЕ.
2. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ. МЕТОДЫ ГЕНОТИПИРОВАНИЯ ВИРУСОВ.
2.1 Уникальные методы генотипирования РНК-содержащих вирусов.
2.1.1. Олигонуклеотидный метод "отпечатков пальцев".
2.1.2. Анализ полиморфизма длин геномных сегментов. (Электрофоретипирование).
2.2. Методы генотипирования ДНК- и РНК-содержащих вирусов.
2.2.1. Молекулярная гибридизация нуклеиновых кислот.
2.2.2. Иммуноферментный анализ ДНК.
2.2.3. Анализ с помощью РНКазы А.
2.2.4. Гетеродуплексный анализ.
2.2.4.1. Анализ подвижности гетеродуплексов.
2.2.4.2. Анализ подвижности гетеродуплексов с меченым зондом.
2.2.5. Анализ конформационного полиморфизма одноцепочечной ДНК.
2.2.6. Анализ полиморфизма длин рестрикционных фрагментов (ПДРФ).
2.2.6.1. Классический ПДРФ анализ.
2.2.6.2. ПЦР-ПДРФ анализ.
2.2.6.3. ОТ-ПЦР-ПДРФ анализ.
2.2.6.4. ДПЦР-ПДРФ анализ.
2.2.6.5. Филогенетический анализ данных ПДРФ.
2.2.6.6. Саузерн-блот анализ.
2.2.7. Определение нуклеотидной последовательности вирусных геномов.
2.2.7.1. Методы секвенирования.
2.2.7.2. Стратегия секвенирования протяженных фрагментов ДНК.
2.2.7.3. Применение секвенирования для генотипирования вирусов.
2.2.8. Генотипирование смешанных инфекций.
2.3. Генотипирование поксвирусов.
2.3.1. ПДРФ анализ ДНК ортопоксвирусов.
2.3.2. ПЦР-ПДРФ анализ ортопоксвирусов.
2.3.3. ПЦР методы анализа ДНК ортопоксвирусов.
2.3.4. Методы молекулярной гибридизации ортопоксвирусов.
2.3.5. ПДРФ анализ ДНК поксвирусов.
2.3.6. Определение нуклеотидных последовательностей поксвирусов.