Атомно-силовая микроскопия сигма(70)-субъединицы РНК-полимеразы E.coli Кузьмина, Наталья Викторовна

Короткий опис

Кузьмина,НатальяВикторовна.Атомно-силоваямикроскопиясигма(70)-субъединицыРНК-полимеразыE.coli: диссертация ... кандидата физико-математических наук : 03.01.02, 03.01.08 /КузьминаНатальяВикторовна; [Место защиты: Моск. гос. ун-т им. М.В. Ломоносова]. - Москва, 2017. - 110 с. : ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
М.В.ЛОМОНОСОВА» ФИЗИЧЕСКИЙ ФАКУЛЬТЕТ На правах рукописиКузьминаНатальяВикторовнаАтомно-силоваямикроскопиясигма(70)-субъединицыРНК-полимеразыE.coliСпециальность 03.01.02 - «Биофизика», 03.01.08 - «Биоинженерия» Диссертация На соискание ученой степени кандидата физико-математических наук Научные

стр. 26
частности,атомно-силовой(АСМ)) и просвечивающей электронноймикроскопии(ПЭМ).Атомно-силоваямикроскопияПринцип работыатомно-силовогомикроскопа основан на регистрациисиловоговзаимодействия между поверхностью исследуемого образца и зондом. В качестве зонда используется наноразмерное остриё, располагающееся

стр. 45
агрегации σ70-субъединицыРНК-полимеразыE.coliУпоминание об образовании σ70-субъединицейРНК-полимеразыE.coliагрегатов в одной из работ Lowe [9] подтолкнуло

Оглавление диссертациикандидат наук Кузьмина, Наталья Викторовна
Оглавление
Список использованных сокращений
Введение
Глава 1. Литературный обзор
1.1. РНК-полимераза. G-субъединица
1.2. Агрегация белков. Амилоид
1.3. Методы исследования амилоидных структур с высоким пространственным разрешением
1.4. Применение АСМ для исследования полиморфизма амилоидов
Глава 2. Исследование палочкообразной агрегации а70-субъединицы РНК-полимеразы E. coli
2.1. Материалы и методы
2.2. Спонтанная агрегация а70-субъединицы РНК-полимеразы E. coli
2.3. Специфическое окрашивание Конго красным. Электрофорез
2.4. Влияние N-концевого домена на способность к агрегации а70-субъединицы РНК-полимеразы
2.5. Влияние солевого окружения на способность к агрегации а70-субъединицы РНК-полимеразы и ее мутантов
2.6. Просвечивающая электронная микроскопия
2.7. Деполяризованное динамическое рассеяние света (ДДРС)
Глава 3. Исследование червеобразной агрегации а70-субъединицы РНК-полимеразы E. coli
3.1. Атомно-силовая микроскопия и механические свойства интремедиатов. Персистентная длина. Модуль Юнга
3.2. Моделирование а70-субъединицы методом молекулярной динамики
Глава 4. Иерархическая модель агрегации амилоидных белков
2
4.1. Модель "кофейных чашек"
Заключение и выводы
Благодарности
Список литературы
Список использованных сокращений
АСМ - атомно-силовая микроскопия или атомно-силовой микроскоп
ВОПГ - высокоориентированный пиролитический графит
РНК - рибонуклеиновая кислота
ДНК - дезоксирибонуклеиновая кислота
ДДРС - деполяризованное динамическое рассеяние света
ДСН - додецилсульфат натрия
МД - молекулярная динамика
ПААГ - полиакриламидный гель
ПЭМ - просвечивающая электронная микроскопия или просвечивающий
электронный микроскоп
ФВК - фосфорновольфрамовая кислота
ЯМР - ядерный магнитный резонанс