Идентификация и картирование LTR на 19 хромосоме человека и анализ структуры локусов 19 хромосомы человека, содержащих LTR эндогенного ретровируса HERV-K Лаврентьева, Ирина Валерьевна

Короткий опис

Лаврентьева,ИринаВалерьевна.ИдентификацияикартированиеLTRна19хромосомечеловекаианализструктурылокусов19хромосомычеловека,содержащихLTRэндогенногоретровирусаHERV-K: диссертация ... кандидата биологических наук : 03.00.03. - Москва, 1999. - 118 с. : ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
РОССИЙСКАЯ АКАДЕМИЯ НАУК Институт биоорганической химии им. М.М. Шемякина и Ю. А. Овчинникова На правах рукописиЛАВРЕНТЬЕВАИРИНАВАЛЕРЬЕВНАИДЕНТИФИ1САЦИЯ ИКАРТИРОВАНИЕLTRНА 19ХРОМОСОМЕЧЕЛОВЕКАИАНАЛИЗСТРУКТУРЫЛОКУСОВ19ХРОМОСОМЫЧЕЛОВЕКА,СОДЕРЖАЩИХLTRЭНДОГЕННОГОРЕТРОВИРУСАHERV-K Специальность-

стр. 5
Настоящая работа является частью исследований, проводимых в лабораторииСтруктурыи Функций ГеновЧеловекапо структурнофункциональному изучению областей 19-йхромосомычеловека,содержащейдлинные концевые повторы (long terminal repeat -LTR)эндогенногоретровирусачеловекаH E R V - K .Эндогенныеретровирусыи ретровирусоподобные элементы были обнаружены в геномах млекопитающих, включая приматов ичеловека....

стр. 71
проводимых в лабораторииСтруктурыи Функции ГеновЧеловекапо структурно-функциональному изучению областей 19-йхромосомычеловека,содержащейдлинные концевые повторы (ЬТК)эндогенногоретровирусачеловекаНЕКУ-К. 1.Картированиепоследовательности, гомологичной длинному концевому повторуэндогенногоретровируса. В проведенной ранее в ЛСФГЧ работе по созданию карты транскрибируемых последовательностей 19-й...

Оглавление диссертациикандидат биологических наук Лаврентьева, Ирина Валерьевна
СОДЕРЖАНИЕ
ВВЕДЕНИЕ
I. ИНТЕГРАЛЬНЫЕ КАРТЫ ХРОМОСОМ И ЛОКАЛИЗАЦИЯ ФУНКЦИОНАЛЬНЫХ ЭЛЕМЕНТОВ
В ГЕНОМЕ ЧЕЛОВЕКА. (ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ)
1. ПРИНЦИПЫ И МЕТОДИЧЕСКИЕ ПОДХОДЫ
К СОЗДАНИЮ КАРТ ХРОМОСОМ ЧЕЛОВЕКА
1.1 ГЕНЕТИЧЕСКИЕ КАРТЫ
1.2. ФИЗИЧЕСКИЕ КАРТЫ
1.3. ТРАНСКРИПЦИОННЫЕ КАРТЫ
2. МАРКЕРЫ, ИСПОЛЬЗУЕМЫЕ ДЛЯ
ПОСТРОЕНИЯ КАРТ
2.1. МЕТОДЫ ПОЛУЧЕНИЯ STS И EST МАРКЕРОВ
мРНК как источник EST
гяРНК как источник EST
2.2. МЕТОДЫ КАРТИРОВАНИЯ STS/EST
Рестриктные карты
FISH-гибридизация
3. ГЕНОМНЫЕ КЛОНОТЕКИ.
ПОСТРОЕНИЕ КОНТИГОВ
3.1. ИСПОЛЬЗОВАНИЕ ХРОМОСОМНОЙ
МИКРОДИССЕКЦИИ
3.2. КЛОНОТЕКИ ГЕНОМА НА ОСНОВЕ YAC
3.3. КОСМИДНЫЕ КЛОНОТЕКИ ГЕНОМА
3.4. РАДИАЦИОННО-ГИБРИДНОЕ КАРТИРОВАНИЕ
3.5. КАРТА 19-Й ХРОМОСОМЫ ЧЕЛОВЕКА
4. ЭНДОГЕННЫЕ РЕТРОВИРУСЫ В СОСТАВЕ ГЕНОМА
4.1. СТРУКТУРА ЭНДОГЕННЫХ РЕТРОВИРУСОВ
И ИХ КЛАССИФИКАЦИЯ
4.2. ТРАНСКРИПЦИОННАЯ АКТИВНОСТЬ
ЭНДОГЕННЫХ РЕТРОВИРУСОВ
II. ЭКСПЕРЕМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ
1. МАТЕРИАЛЫ
2. МЕТОДЫ
III. РЕЗУЛЬТАТЫ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ
1. Картирование последовательности, гомологичной длинному концевому повтору эндогенного ретровируса
2. Отбор космид, содержащих полноразмерные LTR
3. Картирование LTR на космидах с точностью до
EcoRI фрагмента, гибридизацией по методу Саузерна
4. Локализация изучаемых LTR относительно
известных картированных генов или кДНК
5. Определение первичной структуры картированных LTR
ВЫВОДЫ