Морские протеобактерии группы Alteromonas Иванова, Елена Петровна

Короткий опис

Иванова,ЕленаПетровна.МорскиепротеобактериигруппыAlteromonas: диссертация ... доктора биологических наук : 03.00.07. - Владивосток, 1999. - 251 с. : ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 9
данных о биологии и биотехнологическом потенциале бактерийгруппыAlteromonas. Основные задачи: 1. Исследование разнообразияморскихбактерийгруппыAlteromonas, выделенных из различных местообитаний Тихого океана. 2. Оценка возможности применения хемотаксономических маркеров в систематике бактерийгруппы

стр. 10
соединений. бактерий Научная новизна. Новым является применение методов полифазной таксономиигруппыкморскимаэробным на основе грамотрицательным изучения ихпротеобактериямиAlteromonas, фенотипических хемотаксономических особенностей, характеристики бактериального генома, исследования их филогенетических

стр. 173
позволило изучить таксономическую филогенетические структуру, связи и отличительные биологиюморскихособенности, исследоватьгруппыпротеобактерийAlteromonas. Созданная специализированная коллекция бактерий, ответственная за сохранение иAlteromonas-подобиых даннойгруппыподдержание микроорганизмов, является

Оглавление диссертациидоктор биологических наук Иванова, Елена Петровна
ВВЕДЕНИЕ 5
ГЛАВА 1. ЭВОЛЮЦИОННОЕ РАЗНООБРАЗИЕ
ПРОТЕОБАКТЕРИЙ 15
1.1. Характеристика таксономических групп класса Рго1еоЬас1епа 23
1.2. Таксономическая структура гамма группы класса Рго1еоЬа&епа
1.3. Некоторые общие признаки бактерий рРНК 1-суперсемейства 25
ГЛАВА 2. СОВРЕМЕННЫЕ ПОДХОДЫ К ТАКСОНОМИИ МИКРООРГАНИЗМОВ
2.1. Понятие полифазной таксономии 29
2.2. Виды информации, используемые в бактериальной полифазной таксономии
2.2.1. Генотипические методы 34
2.2.2. Методы типирования ДНК 35
2.3. Фенотипические методы 38
2.4. Нумерические анализы 39
2.5. Секвенирование рибосомных РНК 42
2.6. Эволюция и перспективы полифазной таксономии 45
2.6.1. Концепция вида в полифазной таксономии
2.6.2. Проблемы дифференцировки геновидов и некоторых других таксономических категорий 47
2.6.3. Использование фенотипических данных в полифазной таксономии 48
2.7. Трудности систематики микроорганизмов в свете реальности адаптивных мутаций 49
ГЛАВА 3. МОРСКИЕ БАКТЕРИИ ГРУППЫ АИеготопах КАК ПЕРСПЕКТИВНЫЕ ПРОДУЦЕНТЫ УНИКАЛЬНЫХ ФИЗИОЛОГИЧЕСКИ АКТИВНЫХ СОЕДИНЕНИЙ
3.1. Бактериальные продуценты ферментов
3.1.1. Бактериальные продуценты ферментов, гидролизующих сложные полисахариды морской среды 51
3.1.2. а-Галактозидазы как перспективный объект медицинской и сельскохозяйственной биотехнологии 52
3.1.3. Продуценты тирозиназ 56
3.1.4. Продуценты ферментов нуклеинового обмена 59
3.2. Бактериальные продуценты вторичных метаболитов
3.2.1. Продуценты антибиотиков и близких к ним веществ 63
ГЛАВА 4. ОБЪЕКТЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ
4.1. Источники выделения рабочей коллекции АИеготопая-подобных микроорганизмов, культивирование
4.2. Фенотипические признаки
4.3. Хемотаксономические особенности
4.3.1. Жирно-кислотный анализ
4.3.2. Определение антимикробных свойств
4.3.3. Выделение капсульных полисахаридов
4.4. Определение ферментативной активности
4.5. Генетические анализы
4.5.1. Определение нуклеотидного состава ДНК
80-81 81
4.5.2. Определение уровней гомологии ДНК
4.5.3. Клонирование, амплифицирование ДНК
4.5.4. Геномный фингерпринт
4.6. Секвенирование 168 рибосомных РНК
4.7. Филогенетический анализ
ГЛАВА 5. РОД Pseudoalteromonas'. ПРОБЛЕМЫ ИДЕНТИФИКАЦИИ
5.1. Атипичные представители Pseudoalteromonas nigrifaciens, выделенные из дальневосточных моллюсков 88
5.2. Фенотипическое разнообразие бактерий Pseudoalteromonas citrea, выделенных из различных местообитаний и изменение диагноза вида 97
5.3. Pseudoalteromonas elyakovii comb. nov. - новый вид бактерий, выделенный из моллюсков
5.4. Реклассификация бактерий рода Alteromonas distincta Романенко et al., 1995 как Pseudoalteromonas distincta comb. nov. 107
5.5. Восстановление статуса вида Alteromonas tetraodonis как Pseudoalteromonas tetraodonis comb. nov. 109
ГЛАВА 6. ПРОТЕОБАКТЕРИИ РОДА Idiomarina
ГЛАВА 7. ОБЪЕДИНЕНИЕ ГРУППЫ ГЕНЕТИЧЕСКИ И ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИ БЛИЗКИХ РОДОВ В СЕМЕЙСТВО Alteromonadaceae 1'ат. по^: ТАКСОНОМИЧЕСКИЕ ОСОБЕННОСТИ И ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКАЯ СТРУКТУРА 118
ГЛАВА 8. БИОЛОГИЧЕСКИЕ ОСОБЕННОСТИ Alteromonas-TiOROBHblX БАКТЕРИЙ
8.1. Антибиотические свойства 130
8.2. Влияние адсорбции штаммов-продуцентов на продукцию антимикробных соединений 136
8.3. Сравнительное изучение капсульных полисахаридов 140
8.4. Жирнокислотный состав 142
8.5. Биосинтез некоторых ферментов Alteromonas-nomüwbma бактериями
8.5.1. Штамм Pseudoalteromonas elyakovii КММ 162 - продуцент щелочной фосфатазы и ламинараназы 149
8.5.2. Агаролитические штаммы Pseudoalter omonas и особенности биосинтеза а-гал актозид аз 161
8.5.3.Некоторые другие гидролитические ферменты, биосинтезируемые бактериями группы А her omonas 164
ГЛАВА 9. ГЕНОМНЫЙ ФИНГЕРПРИНТ БАКТЕРИЙ РОДА Pseudoalter omonas 170