Петельно-доменная организация хромосом животных Глазков, Михаил Васильевич

Короткий опис

Глазков,МихаилВасильевич.Петельно-доменнаяорганизацияхромосомживотных: диссертация ... доктора биологических наук : 03.00.15. - Москва, 1999. - 366 с. : ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
РОССИЙСКАЯ АКАДЕМИЯ НАУК Институт общей генетики им.Н.И. Вавилова УДК575.113.1;576.316 евичПЕТЕЛЬНО-ДОМЕННАЯОРГАНИЗАЦИЯХРОМОСОМЖИВОТНЫХДиссертация

стр. 4
ядерной оболочкой П.2.Петельнаяорганизацияметафазиыххромосом112.1. Линейная неоднородность метафазиыххромосомII. 3.Петельнаяорганизацияхромосомв мейозе 11.4. Нуклеоиды - экспериментальная модель для изученияпетельнойорганизациихромосомной ДНК в интерфазных ядрах 11.4.1. Молекулярный анализ

стр. 11
установлено, что единство структурных и функциональ­ ных единиц генетического материала реализуется напетельномуровнеор­ ганизациихромосом. В результате был сформулированпетельно-домен- ный принципорганизациихромосом(Benyajati, Worcel, 1976; Igo-Kemenes, Zachau, 1978). Изучениепетельнойорганизациихромосомной

Оглавление диссертациидоктор биологических наук Глазков, Михаил Васильевич
I. ВВЕДЕНИЕ.
II. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.
ПЛ. Интерфазные хромосомы соматических клеток.
II. 1.1 .Ультраструктурный анализ интерфазных хромосом.
II. 1.2. Нуклеазный метод анализа организации интерфазных хромосом.
II. 1.3. Ассоциация интерфазных хромосом с ядерной оболочкой.
11.2. Петельная организация метафазных хромосом.
11.2.1. Линейная неоднородность метафазных хромосом.
И. 3. Петельная организация хромосом в мейозе.
11.4. Нуклеоиды - экспериментальная модель для изучения петельной организации хромосомной ДНК в интерфазных ядрах.
Н.4.1. Молекулярный анализ нуклеоидов.
П.4.2. Электронно-микроскопический анализ нуклеоидов и лишенных гистонов интерфазных хромосом.
11.5. Ядерный матрикс.
11.5.1. Состав ядерного матрикса.
Н.5.2. Остаточные ядерные белки, ассоциированные с хромосомной ДНК.
II.5.3. Нуклеотидные последовательности хромосомной ДНК, ассоциированные с ядерным матриксом.
П.5.4. Репликация хромосомной ДНК и ядерный матрикс.
II.5.5. Транскрипция хромосомной ДНК и ядерный матрикс.
II.6. Петелъно-доменная организация генов в эукариотическга хромосомах.
11.6.1. Методы выявления MARs/SARs эукариотических хромосом.
11.6.2. MARs/SARs в хромосомных доменах генов.
11.6.3. Характерные черты структурной организации MARs/SARs.
11.6.4. Функции MARs/SARs.
11.6.5. MARs/SARs и внутриядерные структуры.
11.6.5.1. Индивидуальные белки ядерного скэффолда, специфически связывающие MARs/SARs.
11.6.5.2. ДНК топоизомераза II и петельная организация хромосом.
11.6.5.3. Внутриядерные структуры, с которыми взаимодействуют MARs/SARs.
11.6.6. MARs/SARs и границы структурно-функциональных единиц хромосом животных и растений.
III. МАТЕРИАЛ И МЕТОДЫ.
III. 1. Выделение ядер гепатоцитов мыши и крысы.
111.2. Выделение и фракционирование ядер сперматогониальных клеток мыши и крысы.
111.3. Выделение нуклеоидов гепатоцитов крысы.
111.4. Выделение нуклеоидов сперматогониальных клеток крысы.
111.5. Выделение ядерного матрикса гепатоцитов и сперматогониальных клеток крысы.
III.6. Выделение ядерных оболочек гепатоцитов мыши.
III. 7. Седиментационный анализ нуклеоидов гепатоцитов крысы.
III. 8. Выделение мДНК гепатоцитов и сперматогониальных клеток крысы.
III. 9. Электронная микроскопия.
III. 10. Флуоресцентная микроскопия.
III. 11. Электрофоретический анализ ДНК.
III. 12. Гибридизационные эксперименты.
III. 13. Трансформация клеток Е. coli и выделение плазмидных ДНК.
III. 14. Клонирование и определение первичной нуклеотидной последовательности "структурных" участков интерфазных хромосом.
III. 15. Выделение фрагментов ДНК из плазмид.
III. 16. Анализ специфичности связывания фрагментов срДНК и яоДНК с хромосомными/ядерными субструктурами.
III. 17. Анализ белков в ПААГ и ЭФ-перенос белков на мембрану.
III. 18. Вестерн-блот анализ хромосомных/ядерных белков.
III. 19. Радиоавтография гелей.
III.20. Компьютерный анализ нуклеотидных последовательностей ДНК.
IV. РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЙ.
IV. 1. Нуклеоиды и ядерный матрикс гепатоцитов и сперматоцитов.
IV. 1.1. Седиментационный анализ нуклеоидов гепатоцитов крысы.
IV. 1.1.1. Седиментационный анализ нуклеоидов в градиенте сахарозы, содержащем ЭДТА.
IV. 1.1.2. Седиментационный анализ нуклеоидов в градиента сахарозы, не содержащем ЭДТА.
IV. 1.2. Флуоресцентный анализ нуклеоидов гепатоцитов крысы.
IV. 1.3. Электронно-микроскопический анализ нуклеоидов гепатоцитов крысы.
IV. 1.3.1. Морфология нуклеоидов на отдельных этапах их выделения.
IV. 1.3.2. Интеркалирующие в ДНК агенты и морфология нуклеоидов
IV. 1.3.3. Ионы меди и морфология нуклеоидов.
IV. 1.3.4. Дисульфидные связи и морфология нуклеоидов.
IV. 1.4. Транскрипционная организация хромосомной ДНК.
IV. 1.5. Линейная неоднородность интерфазных хромосом.
IV. 1.6. Репликативная организация хромосомной ДНК.
IV. 1.7. Организация ДНК в лишенных гистонов ядрах сперматогониальных клеток.
IV. 1.8. Морфология остаточных ядерных структур соматических и мейотических клеток.
IV. 1.9. Фрагменты мДНК соматических и мейотических клеток.
IV. 1.9.1. Общая характеристика фрагментов мДНК соматических и мейотических клеток.
IV. 1.9.2. В-подобные повторы в составе ядерных матриксов соматических и мейотических клеток.
IV. 1.10. Обсуждение результатов.
ГУ.2. Хромосомные домены.
1У.2.1. Выделение субструктур интерфазных хромосом мыши, различающихся по чувствительности к ДНКазе 1.
IV.2.2. Локализация транскрипционно-активных и неактивных генов во фракциях хроматина, различающихся по чувствительности к ДНКазе 1.
IV.2.3. Организация генов каппа-ИГ в элементарных хромомерах.
IV.2.4. Фрагменты срДНК интерфазных хромосом.
1У.2.4.1. Специфичность фрагментов срДНК.
ГУ.2.4.2. Анализ нуклеотидных последовательностей фрагментов срДНК.
IV.2.4.3. Специфичность ДНК-белковых взаимодействий при формировании розетко-подобной организации интерфазных хромосом.
Г/.2.4.4. Специфичность ДНК-белковых взаимодействий при ассоциации интерфазных хромосом с ядерной оболочкой.
IV.2.4.5. Белковые сердцевины розетко-подобных структур и ядерные оболочки "узнают" разные конформационные состояния ДНК.
IV.2.4.6. ДНК-связывающие белки розетко-подобных структур интерфазных хромосом.
IV.2.4.7. ДНК топоизомераза II - компонент сердцевин розетко-подобных структур.
IV.2.6. Триплексные структуры ДНК и компактизация хромосомных доменов генов.
IV.2.6.1. Компьютерное моделирование компактизации хромосомных доменов генов.
IV.2.7. Фрагменты яоДНК гепатоцитов мыши.
IV.2.7.1. Специфичность фрагментов яоДНК гепатоцитов мыши.
IV.2.7.2. Эволюционная консервативность фрагментов срДНК и яоДНК.
IV.2.7.3. Анализ нуклеотидных последовательностей яоДНК гепатоцитов мыши.
IV.2.8. Компьютерный анализ фрагментов ДНК, предположительно участвующих в петельной организации хромосом животных и растений.
IV.2.9. Обсуждение результатов.