Структура 16SpPHK и таксономический статус Anaerobacter polyendosporus Никитин, Дмитрий Валерьевич

Короткий опис

Никитин,ДмитрийВалерьевич.Структура16SpPHKитаксономическийстатусAnaerobacterpolyendosporus: диссертация ... кандидата биологических наук : 03.00.03. - Пущино, 1999. - 96 с. : ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
РОССИЙСКАЯ АКАДЕМИЯ НАУК ИНСТИТУТ БИОХИМИИ И ФИЗИОЛОГИИ МИКРООРГАНИЗМОВ ИМ. Г.К. СКРЯБИНА на правах рукописиНИКИТИНДМИТРИЙВАЛЕРИЕВИЧСТРУКТУРА16S рРНК ИТАКСОНОМИЧЕСКИЙСТАТУСANAEROBACTERPOLYENDOSPORUS03.00.03- Молекулярная биология Диссертация на соискание ученой степени кандидата биологических

стр. 3
нуклеотидной последовательности ДНК ГЛАВА III. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ 3.1. Амплификация и клонирование 16S рДНКAnaerobacterpolyendosporus3.2. Определение нуклеотидной последовательности 16S рДНК Л.polyendosporus3.3. Вторичнаяструктура16S рРНК Л.polyendosporus3.4. Характеристика морфологических свойств

стр. 49
A G C C GTAGGAGÍAC T G C G G C T G G A T C A C C T C C T T pW Рис. 6. Нуклеотидная последовательность 16SрРНКAnaerobacterpolyendosporus50 3.3. Вторичнаяструктура16S pVRK А.polyendosporusРибонуклеотидная последовательность 16S рРНК А.polyendosporusбыла под­ вергнута анализу ковариантных позиций

Оглавление диссертациикандидат биологических наук Никитин, Дмитрий Валерьевич
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
ВВЕДЕНИЕ
ГЛАВА I. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1.1. Использование генотипических данных в таксономии бактерий 8 1.1.1 Роль семантид в систематике микроорганизмов
1.1.2. Методы филогенетического анализа на основе семантид
1.1.3. Обработка информации
1.1.4. Генотипирование бактерий
1.2. Изучение пространственной укладки рибосомальных РНК
1.3. Использование фенотипических признаков в таксономии микроорганизмов
1.3.1. Использование морфофизиологических признаков в систематике бактерий
1.3.2. Использование биохимических данных для классификации бактерий
1.3.2.1. Биохимическое разнообразие бактерий и его роль в таксономии
1.3.2.2. Использование пептидогликана для систематики микроорганизмов
1.3.2.3. Состав жирных кислот как таксономический признак
1.3.2.4. Фенотипирование микроорганизмов
1.4. Таксономическое разрешение различных методов бактериальной систематики
ГЛАВА II. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ
2.1. Материалы
2.1.1. Штаммы бактерий, фаговые и плазмидные вектора
2.1.2. Среды и основные буферы
2.1.3. Материалы и реактивы
2.2.Методы исследования
2.2.1. Культивирование бактерии
2.2.2. Морфологическая характеристика 39 2.2.3 Анализ аминокислотного состава пептидогликана
2.2.4. Анализ профиля жирных кислот
2.2.5. Выделение плазмидной ДНК
2.2.6. Выделение одноцепочечной ДНК фага М
2.2.7. Фосфорилирование олигонуклеотидных праймеров
2.2.8. ПЦР-амплификадия ДНК
2.2.9. Препаративное выделение фрагмента ДНК
2.2.10. Лигирование фрагментов ДНК
2.2.11. Получение компетентных клеток E.coli и их трансформация
2.2.12. Анализ рекомбинантных клонов
2.2.13. Определение нуклеотидной последовательности ДНК
ГЛАВА III. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ
3.1. Амплификация и клонирование 16S рДНК Anaerobacter polyendosporus
3.2. Определение нуклеотидной последовательности 16S рДНК А. polyendosporus
3.3. Вторичная структура 16S рРНК А. polyendosporus
3.4. Характеристика морфологических свойств бактерии
3.5. Определение аминокислот пептидогликана
3.6. Анализ состава жирных кислотAnaerobacter polyendosporus Ъ.1. Анализ филогенетического положения