Структура углеводсвязывающих пептидов лектина бобовых растений в связи с их различной хозяйской специфичностью при образовании симбиоза с клубеньковыми растениями Баймиев, Алексей Ханифович

Короткий опис

Баймиев,АлексейХанифович.Структурауглеводсвязывающихпептидовлектинабобовыхрастенийвсвязисихразличнойхозяйскойспецифичностьюприобразованиисимбиозасклубеньковымирастениями: диссертация ... кандидата биологических наук : 03.00.03. - Уфа, 1999. - 151 с. : ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
« Ii РОССИЙСКАЯ АКАДЕМИЯ НАУК УФИМСКИЙ НАУЧНЫЙ ЦЕНТР ОТДЕЛ БИОХИМИИ И ЦИТОХИМИИ На правах рукописиБАЙМИЕВАлексейХанифович^ралл^л^СТРУКТУРАУГЛЕВОДСВЯЗЫВАЮЩИХПЕПТИДОВЛЕКТИНАБОБОВЫХРАСТЕНИЙВСВЯЗИС ИХРАЗЛИЧНОЙХОЗЯЙСКОЙСПЕЦИФИЧНОСТЬЮПРИОБРАЗОВАНИИСИМБИОЗАСКЛУБЕНЬКОВЫМИБАКТЕРИЯМИ Диссертация

стр. 3
использованных стандартных растворов Глава 3. Результаты исследований и их обсуждение 3.1. Сравнениеуглеводсвязывающихпептидовлектинабобовыхрастений3.1.1. Компьютерный анализ нуклеотидных и аминокислотных последовательностей и амплификация участка геналектинаураз­ личныхпредставителейбобовыхрастений3.1.2. Клонирование и секвенирование фрагментов геналектинаразличныхпредставителейбобовых...

стр. 70
ОБСУЖДЕНИЕ 3.1. Сравнениеуглеводсвязывающихпептидовпектинабобовыхрастенийвсвязис ихразличнойхозяйскойспецифичностьюприобразованиисимбиозасклубеньковымибактериями Во многих работах показано, чтоспецифичностьобразованиябобоворизобиальногосимбиозаопределяется в первую очередьрастением- хозяином. Более того, этот макросимбионт диктует как саму возможность подобного...

Оглавление диссертациикандидат биологических наук Баймиев, Алексей Ханифович
Список сокращений.
Введение.
Глава 1. Обзор литературы.
1.1. Происхождение бобово-ризобиального симбиоза.
1.2. Специфичность образования бобово-ризобиального симбиоза.
1.2.1. Механизмы инфекции и клубенькообразования.
1.2.2. Сигналлинг между ризобией и бобовым растением.
1.2.3. Лектины бобовых растений.
1.3. Современная систематика клубеньковых бактерий и проблема детекции штаммов ризобий.
1.3.1. Особенности организации генома клубеньковых бактерий.
1.3.2. Систематика клубеньковых бактерий.
1.3.3. Применение современных методов молекулярной биологии для определения штаммов ризобий.
Глава 2. Объекты и методы исследований.
2.1. Краткая характеристика объектов исследований.
2.2. Выделение и очистка ДНК растений.
2.3. Выделение и очистка ДНК ризобий.
2.4. Выделение и очистка плазмидной ДНК.
2.5. Выделение мегаплазмидной ДНК ризобий.
2.6. Выделение и очистка одноцепочечной фагмидной ДНК.
2.7. Расщепление ДНК рестрикционными эндонуклеазами.
2.8. Аналитический гель-электрофорез ДНК в неденатурирующих условиях.
2.9. Препаративный гель-электрофорез ДНК в неденатурирующих условиях.
2.10. Элюция ДНК из агарозных гелей.
2.11. Клонирование фрагментов генов лектина бобовых растений.
2.12. Перенос ДНК из агарозных гелей на мембранные фильтры (блоттинг).
2.13. Радиоактивное мечение препаратов ДНК.
2.14. Блот-гибридизация ДНК.
2.15. Полимеразная цепная реакция.
2.16. Подготовка компетентных клеток.
2.17. Трансформация компетентных клеток E.coli плазмидной ДНК.
2.18. Секвенирование ДНК ферментативным методом.
2.19. Электрофоретическое фракционирование ДНК в денатурирующих условиях (секвенирующий гель-электрофорез).
2.20. Компьютерный анализ нуклеотидных последовательностей.
2.21. Бактериальные штаммы и фагмидные вектора.
2.22. Реактивы и материалы.
2.23. Составы использованных стандартных растворов.
Глава 3. Результаты исследований и их обсуждение.
3.1. Сравнение углеводсвязывающих пептидов лектина бобовых растений.
3.1.1. Компьютерный анализ нуклеотидных и аминокислотных последовательностей и амплификация участка гена лектина у различных представителей бобовых растений.
3.1.2. Клонирование и секвенирование фрагментов гена лектина различных представителей бобовых растений.
3.1.3. Клонирование и секвенирование полноразмерного гена лектина гороха посевного сорта «Неосыпающийся-1».
3.1.4. Сравнительный анализ нуклеотидных последовательностей секвенированных фрагментов генов лектина.
3.1.5. Сравнительный анализ аминокислотных последовательностей лектинов бобовых растений.
3.2. Анализ информативности некоторых современных методов идентификации ризобий на примере R. galegae.
3.2.1. Метод "геномной дактилоскопии" с использованием в качестве гибридизационного зонда ДНК фага М13.
3.2.2. Метод RAPD анализа с использованием «произвольных» праймеров.
3.2.3. Метод концевого мечения рестрикционных фрагментов.
3.2.4. Сравнение степени пригодности ПДРФ, RAPD и КМРФ анализов для идентификации штаммов ризобий козлятника.