Теоретический конформационный анализ тертиапина и MCD-пептида Ломизе, Андрей Львович

Короткий опис

Ломизе,АндрейЛьвович.ТеоретическийконформационныйанализтертиапинаиMCD-пептида: диссертация ... кандидата физико-математических наук : 03.00.02. - Москва, 1984. - 157 с. : ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
e/'ir-//^S?^-X АКАДЕМИЯ НАУК СССР ИНСТИТУТ БЙООРГАНИЩСКОЙ Х М Й им. М.М.ШЕМЯКИНА И И На правах рукошси УДК 577*322.4 547.993ЛОМИЗЕАндрейЛьвовичТЕОРЕТИЧЕСКИЙК0НФ0Р1ЛАЦИ0ННЫЙАНАЛИЗТЕРТИАПИНАИMCD-ПЕПТИЛА 03.00.02 Ейофизика Диссертация на соискание ученой степени кандидата физико-математических

стр. 3
карт 50 § 2.7. Новый комплекс вычислительных программ длятеоре­ тическогоконформационногоанализа55 § 2.8, Изучение подвижности боковых цепей на npoMeJsyточных этапах расчета .61 Глава 3 .Конформационныйанализмолекулытертиапина. . . 65 § 3 . 1 . Формирование нуклеаций на участках Oys^-ile^ и lle^^-GjB^^

стр. 130
определившейся геометрией основной цепи, а штрихо­ выми линиями - лабильные участки. - 150 Таблица 26.Конформационнаяподвижность молекултертиапинаи M O D -пептида, Участок Участок молекулы молекулытертиапинаMOD-пептидаконформационныевозможности участка Не'' имеется два изоэнергетичных конформера по углу

Оглавление диссертациикандидат физико-математических наук Ломизе, Андрей Львович
Введение.
Глава I. Теоретический конформационный анализ олигопептидов.
§1.1. Вычисление потенциальной энергии.
§ 1.2. Конформационные состояния монопептидов.
§ 1.3. Методика расчета пространственного строения пептидов.
§ 1.4. Пространственная организация природных олигопептидов ■.
§ 1.5. Сопоставление результатов теоретических работ с экспериментальными данными.
Глава 2. Методика расчета пространственных структур молекул тертиапина . и MOD-пептида.
§ 2.1. Тактика выбора фрагментов пептидной цепи.
§ 2.2. Изучение тетрапептидных участков.
§ 2.3. Классификация структур основной цепи.
§ 2.4. Вычисление потенциальной энергии.
§ 2.5. Выбор оптимального метода минимизации энергии
§ 2.6. Построение конформационных карт.
§ 2.7. Новый комплекс вычислительных программ для теоретического конформационного анализа.
§ 2.8. Изучение подвижности боковых цепей на промежуточных этапах расчета.
Глава 3. Конформационный анализ молекулы тертиапина.
§ 3.1. Формирование нуклеаций на участках Сув^-Ие^ и Ile^-Cys14.
§ 3.2. Взаимодействие нуклеаций и образование циклической структуры с дисульфидной связью Cys^-Cys
§ 3.3. Укладка лабильных участков и формирование второй дасульфидной связи.
§ 3.4. Трехмерная структура и конформационные возможности молекулы тертиашна.
Глава 4. Расчет трехмерной структуры MOD-пептида . •
§ 4.1. Формирование нуклеации на участке Lys11-Cys
MCD-пептида.
§ 4.2. Укладка участка Cys^-Cys1^ и образование первой дасульфидной связи mod -пептида.
§ 4.3. Формирование второй дасульфидной связи Cys5
Cys19.
§ 4.4. Трехмерная структура и конформационные возможности молекулы mcd-пептида. Сопоставление с литературными данными.
Глава 5. Сравнительный анализ пространственных структур молекул тертиапина и МОР -пептида.
§ 5.1. Влияние аминокислотных замен на пространствен, ную организацию молекул тертиапина и mod -пептида.
§ 5.2. Энергетика взаимодействий.
§ 5.3. Конформационный механизм образования дисульфидных связей и их роль в стабилизации трехмерных структур олигопептидов.
Выводы.