Выявление генов дифференциально экспрессирующихся при регенерации планарий Богданова, Екатерина Андреевна

Короткий опис

Богданова,ЕкатеринаАндреевна(кандидат биологических наук).Выявлениегеновдифференциальноэкспрессирующихсяприрегенерациипланарий: диссертация ... кандидата биологических наук : 03.00.03. - Москва, 1999. - 84 с. : ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
РОССИЙСКАЯ АКАДЕМИЯ НАУК ИНСТИТУТ БИООРГАНИЧЕСКОЙ ХИМИИ ИМ. М.ШЕМЯКИНА И Ю.ОВЧИННИКОВАБогдановаЕкатеринаАндреевнаВЫЯВЛЕНИЕГЕНОВДИФФЕРЕНЦИАЛЬНОЭКСПРЕССИРУЮЩИХСЯПРИРЕГЕНЕРАЦИИПЛАНАРИЙ. снециальность - 03.00.03 - молекулярная биология диссертация на соискание ученой степени кандидата биологических

стр. 24
восстановительные процессы, - методов прямого поискадифференциальноэкспрессирующихсягенов. 1.3.4. Методы прямого поискадифференциальноэкспрессирующихсягеновВ основе этих методов лежитвыявлениемолекул мРНК по разному представленных в тех или иных тканях и на разных стадиях биологического процесса.

стр. 26
гаструлы [153]. В настоящее время различные стратегии вычитающей гибридизации используются на для самых поиска разныхдифференциальносистемах. Вэкспрессирующихсяпоследовательностей последние годы методы прямого поискадифференциальноэкспрессирующихсягеноввсе более активно применяют для иследованиярегенерации. Подобный путь позволяет выявлятьгены, меняющие уровень своей экспрессии в ходе восстановительных процессов, к которым относятся не...

Оглавление диссертациикандидат биологических наук Богданова, Екатерина Андреевна
СОДЕРЖАНИЕ
ВВЕДЕНИЕ
1. ЛИТЕРАТУРНЫЙ ОБЗОР
1.1. Типы репаративной регенерации
1.2. Планарии как модельный объект при иссследованиях регенерации
1.2.1. Морфологические и функциональные особенности пресноводных 5 планарий
1.2.2. Общие аспекты регенерации планарии
1.3. Молекулярно- биологические иследования регенерации (Методы 9 идентификации регуляторных генов и их применение к исследованию регнерации)
1.3.1. Методы, основанные на мутационном анализе
1.3.2. Поиск генов с использованием их эволюционного-.консерватизма
1.3.3. Ограничения методов поиска генов, основанных на их эволюционном 20 консерватизме
1.3.4. Методы прямого поиска дифференциально экспрессируюгцихся генов
1.4. Заключение
2. РЕЗУЛЬТАТЫ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ
2.1. Модельный эксперимент
2.2. Получение библиотек кДНК, обогащенных последовательностями 30 специфически экспрессирующимися в ходе регенерации различной полярности
2.2.1. Стратегия вычитающей гибридизации
2.2.2. Получение образцов амплифицированной кДНК из регенерационных 33 бластем планарии
2.2.3. Приготовление образцов кДНК трейсера и драйвера
2.2.4. Вычитающая гибридизация
2.3. Дифференциальный скрининг
2.3.1. Описание метода in vitro клонирования
2.3.2. Применение клонирования in vitro для анализа образцов кДНК, 35 обогащенных последоватльностями специфическими для регенерации различной полярности
2.4. Структура выделенных фрагментов
2.4.1. Нозерн-блот гибридизация
2.4.2. Выявление полной кодирующей последовательности кДНК гена scarf
2.4.3. Анализ структуры гена scarf
2.4.4. Scarf - представитель новой группы лектинов С-типа
2.5. Анализ экспрессии генов scarf и collar в теле нерегенерирующих 43 планарии
2.5.1. Whole mount in situ гибридизация
2.5.2. Анализ распределения мРНК выделенных генов вдоль дорсо- 45 вентральной оси
2.5.3. RT-ПЦР анализ
2.6. Анализ экспрессии генов scarf и collar в ходе регенерации 47 3. ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ
3.1. Оборудование и материалы
3.2. Методы исследования 56 ВЫВОДЫ 66 СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ 67 СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ