Аноксигенные нитчатые фототрофные бактерии в микробных сообществах минерализованных водных экосистем Бурганская Екатерина Игоревна

Краткое описание

Бурганская,ЕкатеринаИгоревна.Аноксигенныенитчатыефототрофныебактериивмикробныхсообществахминерализованныхводныхэкосистем: диссертация ... кандидата биологических наук : 03.02.03 /БурганскаяЕкатеринаИгоревна; [Место защиты: ФГУ «Федеральный исследовательский центр «Фундаментальные основы биотехнологии» Российской академии наук»]. - Москва, 2020. - 169 с. : ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
рукописиБурганскаяЕкатеринаИгоревнаАНОКСИГЕННЫЕНИТЧАТЫЕФОТОТРОФНЫЕБАКТЕРИИВМИКРОБНЫХСООБЩЕСТВАХМИНЕРАЛИЗОВАННЫХВОДНЫХЭКОСИСТЕМДиссертация

стр. 6
виды мезофильных АНФБ, исследовать их метаболизм на геномном уровне и выявить новые тренды эволюциифототрофныхсообществ. Цель данного исследования: изучение фенотипического и генетического разнообразияаноксигенныхнитчатыхфототрофныхбактерийвмикробныхсообществахминерализованныхводныхэкосистемразного типа с применением комплекса микробиологических и молекулярно-генетических методов. В задачи исследования...

стр. 137
operational taxonomic unit, англ. операционная таксономическая единица ААФ аэробныеаноксигенныефототрофныебактерииАНФБ аноксигенныенитчатыефототрофныебактерииАФБ аноксигенныефототрофныебактерииБхл бактериохлорофилл ЗСБ зеленые серныебактерииММ микробныймат НПБ несерные пурпурныебактерииОКФ общее количество фототрофов ПСБ пурпурные серныебактерииПЦР полимеразная...

Оглавление диссертациикандидат наук Бурганская Екатерина Игоревна
Введение
Литературный обзор
1 Общая характеристика АФБ
2 Характеристика АНФБ
2.1 Биоразнообразие АНФБ
2.2 Морфология и особенности строения клеток АНФБ
2.2.1 Способность к скольжению
2.2.2 Клеточное строение
2.2.3 Хлоросомы
2.3 Пигментный состав клеток
2.3.1 Бактериохлорофиллы
2.3.2 Каротиноиды
2.3.3 Хиноны
3 Физиологические особенности
3.1 Отношение к температуре, соли, pH
3.1.1 Отношение к температуре
3.1.2 Отношение к соли
3.1.3 Отношение к рН
3.2 Фотосинтез
3.3 Использование неорганических и органических соединений в качестве донора электронов
3.4 Пути автотрофной фиксации углекислоты
3.4.1 Цикл Кальвина
3.4.2 3-Гидроксипропионатный цикл
3.5 Источники азота
3.6 Темновой метаболизм
4 Распространение АНФБ в природе
4.1 Микробный мат как естественная среда обитания АНФБ
4.2 Положение АНФБ в экосистеме
4.3 Местообитания АНФБ
5 Возможное применение АНФБ в практике
6 Заключение к литературному обзору
МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
7 Материалы исследования
8 Микробиологические методы исследования
8.1 Состав питательной среды и условия культивирования
8.2 Микроскопия
8.3 Количественный учет различных групп АФБ
8.4 Определение пигментов клеток
8.5 Определение световой фиксации углекислоты
9 Молекулярно-генетические методы исследования
9.1 Выделение ДНК
9.2 Амплификация фрагментов исследуемых генов
9.3 Детектирование продуктов ПЦР
9.4 Очистка ПЦР-фрагментов
9.5 Секвенирование ДНК
9.6 Анализ бактериального состава исследованных матов
9.7 Секвенирование геномной ДНК
9.8 Анализ полученных последовательностей
9.9 Флуоресцентная гибридизация in situ
РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ
10 Микробные маты содового озера Киран
10.1 Характеристика местообитания
10.2 Тотальный пигментный состав матов
10.3 Вертикальная структура матов по стеклам обрастания и микроскопия
10.4 Состав микробных сообществ по данным высокопроизводительного секвенирования
10.5 Характеристика и таксономическое положение выделенных культур АФБ
10.6 'Candidatus Viridilinea mediisalina' Kir15-3F - новая аноксигенная нитчатая фототрофная бактерия из озера Киран
10.6.1 Морфологическая характеристика
10.6.2 Пигменты клеток
10.6.3 Физиологические свойства
10.6.4 Генетические свойства
10.6.5 Таксономическое описание 'Candidatus Viridilinea mediisalina'
10.7 Особенности состава исследованных алкалофильных микробных матов и присутствие новых АНФБ
11 Микробные маты солевых маршей и литорали озер, имевших связь с Кандалакшским заливом Белого моря
11.1 Характеристика местообитания
11.2 Тотальный пигментный состав матов
11.3 Основные группы фототрофных бактерий, выявленные с помощью микроскопии

11.4 Состав микробных сообществ по данным высокопроизводительного секвенирования
11.5 Особенности состава исследованных микробных матов и присутствие новых АНФБ
12 Микробные маты холодных соленых источников побережья озера Чокрак (Крымский полуостров)
12.1 Характеристика местообитания
12.2 Тотальный пигментный состав матов
12.3 Основные группы фототрофных бактерий, выявленные с помощью микроскопии
12.4 Состав микробных сообществ по данным высокопроизводительного секвенирования
12.5 Характеристика и таксономическое положение выделенных культур АФБ
12.6 'Сап&^т УтёШпеа Ьа1о1;о1егап8' СЬок-6 - новая аноксигенная нитчатая фототрофная бактерия из Чокракского источника
12.6.1 Морфологическая характеристика
12.6.2 Пигменты клеток
12.6.3 Физиологические свойства
12.6.4 Генетические свойства
12.6.5 Таксономическое описание íCandidatus УтёШпеа Ьа1о1о1егапв'
12.7 Особенности состава исследованных галофильных микробных матов и присутствие новых АНФБ
13 Микробные маты теплых высокоминерализованных источников Дагестана
13.1 Характеристика местообитания
13.2 Основные группы фототрофных бактерий, выявленные с помощью микроскопии
13.3 Характеристика и таксономическое положение выделенных культур АФБ
13.4 Особенности состава исследованных алкалофильных микробных матов и присутствие новых АНФБ
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ВЫВОДЫ
СОКРАЩЕНИЯ И АББРЕВИАТУРЫ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
Приложение А
Приложение Б